Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13433
- Subject:
- NM_172706.3
- Aligned Length:
- 3084
- Identities:
- 2146
- Gaps:
- 675
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCTGCTGCTCACCCTGCGGCGGGCGAAAGGCAGGGATCGGGGGCGACCGGCCGGGGGTCCCCGCCGCGCGCT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CTCGCTGCCCTGGAGCCCCGCCTGGATTTGCTGCTGGGCGCTCGCAGGCTGCCAGGCAGTTTGGGCTGGAGACT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CGTCCTCCTCTGGCCGCCCGCTTCCTGCGTGCCAAGAGAAAGATTACCACTTTGAATATACAGAATGTGATAGC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 ACTGGCTCCAGGTGGAGGGTCGCCATTCCGAATTCTGCAGTGGATTGCTCTGGCCTGCCTGACCCAGTGAAAGG 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 CAAAGAATGCACTTTCTCCTGTGCTTCTGGAGAGTATCTAGAAATGAAGAACCAGGTATGCAGTAAATGTGTGG 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 AAGGCACCTACTCCTTGGGCAGTGGCATCAAATTTGATGAATGGGATGAATTGCCGGCAGGATTTTCCAACGTT 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 GCAACATTCATGGACACTGTGGTGGGCCCTTCTGACAGCAGGCCAGATGGCTGTAACAACTCTTCTTGGCTTCC 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 TCGTGGGAACTATATAGAGTCTAACCGTGATGACTGCACTGTGTCTTTGATCTACGCTGTGCACCTGAAGAAGT 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 CTGGCTACGTCTTCTTTGAGTACCAGTACGTGGACAACAACATCTTCTTTGAGTTCTTTATTCAGAATGACCAG 666
Query 1 ---------ATGGACACCACCACTGACAAGTGGGTAAAACTTACAGACAATGGAGAATGGGGCTCTCATTCTGT 65
|||||..|||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 667 TGCCAGGAGATGGATGCCACCACAGACAAGTGGGTGAAGCTCACAGACAATGGAGAATGGGGCTCCCATTCTGT 740
Query 66 AATGCTGAAATCAGGCACAAACATACTCTACTGGAGAACTACAGGCATCCTTATGGGTTCTAAGGCGGTCAAGC 139
|||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 741 AATGCTGAAATCAGGCACAAATATTCTGTACTGGAGAACGACAGGCATCCTTATGGGTTCTAAGGCAGTCAAGC 814
Query 140 CTGTGCTGGTAAAAAATATCACAATTGAAGGGGTGGCGTACACATCAGAATGTTTTCCTTGCAAGCCAGGCACA 213
|.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||.
Sbjct 815 CCGTGCTAGTAAAGAATATCACCATCGAAGGGGTGGCATACACCTCAGAGTGCTTTCCATGTAAGCCAGGCACT 888
Query 214 TTCAGCAACAAACCAGGTTCATTCAACTGCCAGGTGTGTCCCAGAAACACCTATTCTGAGAAAGGAGCCAAAGA 287
|||||||||||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 889 TTCAGCAACAAACCAGGCTCATTTAACTGCCAGATGTGTCCCAGAAACACCTATTCTGAGAAGGGTGCTAAAGA 962
Query 288 ATGTATAAGGTGTAAAGACGACTCTCAATTTTCAGAGGAAGGATCCAGTGAGTGTACAGAGCGCCCTCCCTGTA 361
||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||...||.|||||.|||||.|
Sbjct 963 ATGTATTAGGTGTAAGGAGGACTCCCAGTTTTCAGAGGAAGGAGCCAGTGAGTGTGTGGATCGCCCACCCTGCA 1036
Query 362 CCACAAAAGACTATTTCCAGATCCATACTCCATGTGATGAAGAAGGAAAGACACAGATAATGTACAAGTGGATA 435
|.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTACCAAAGACTATTTCCAGATCCATACCCCCTGTGACGAAGAAGGGAAGACACAGATAATGTACAAGTGGATA 1110
Query 436 GAGCCCAAAATCTGCCGGGAGGATCTCACAGATGCTATTAGATTGCCCCCTTCTGGAGAGAAGAAGGATTGTCC 509
|||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAGCCAAAAATCTGCAGGGAGGATCTCACAGATGCTATTAGGCTGCCCCCTTCTGGAGAGAAGAAGGATTGTCC 1184
Query 510 GCCTTGCAACCCTGGATTTTATAACAATGGATCATCTTCTTGCCATCCCTGTCCTCCTGGAACATTTTCAGATG 583
.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||
Sbjct 1185 TCCTTGCAACCCAGGATTCTATAACAATGGATCGTCTTCTTGCCATCCCTGCCCTCCGGGGACGTTTTCAGATG 1258
Query 584 GAACCAAAGAATGTAGACCATGTCCAGCAGGAACGGAGCCTGCACTTGGCTTTGAATATAAATGGTGGAATGTC 657
||||.||.|||||.|...|||||||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GAACAAAGGAATGCAAGTCATGTCCGGCCGGAACAGAGCCAGCACTTGGGTTTGAATATAAATGGTGGAATGTC 1332
Query 658 CTTCCTGGCAACATGAAAACTTCCTGCTTCAATGTTGGGAATTCAAAGTGCGATGGAATGAATGGTTGGGAGGT 731
||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333 CTCCCTGCCAACATGAAAACTTCCTGCTTCAATGTTGGGAATTCCAAGTGCGATGGAATGAACGGTTGGGAGGT 1406
Query 732 GGCTGGAGATCATATCCAGAGTGGGGCTGGAGGTTCTGACAATGATTACCTGATCTTAAACTTGCATATCCCAG 805
||||||||||||.||||.||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1407 GGCTGGAGATCACATCCGGAGTGGAGCTGGAGGCTCTGACAATGACTATCTCATCTTAAACTTGCACATCCCAG 1480
Query 806 GATTTAAACCACCAACATCTATGACTGGAGCCACGGGTTCTGAACTAGGAAGAATAACATTTGTCTTTGAGACC 879
||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 1481 GATTTAAACCACCAACGTCTATGACTGGAGCCACAGGTTCGGAACTGGGAAGGATAACATTTGTGTTTGAGACT 1554
Query 880 CTCTGTTCAGCTGACTGTGTTTTGTACTTCATGGTGGATATTAATAGAAAAAGTACAAATGTGGTAGAATCGTG 953
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1555 CTCTGCTCAGCTGACTGTGTTTTGTACTTCATGGTGGATATAAATAGAAAAAGCACCAATGTGGTGGAATCATG 1628
Query 954 GGGTGGAACCAAAGAAAAACAAGCTTACACCCATATCATCTTCAAGAATGCAACTTTTACATTTACATGGGCAT 1027
|||.||||||||||||||.||||||||.||.|||.||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1629 GGGAGGAACCAAAGAAAAGCAAGCTTATACGCATGTCATATTCAAGAATGCAACGTTTACATTTACATGGGCGT 1702
Query 1028 TCCAGAGAACTAATCAGGGTCAAGATAATAGACGGTTCATCAATGACATGGTGAAGATTTATTCTATCACAGCC 1101
|||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TCCAGAGGACAAACCAAGGTCAAGATAACAGACGATTCATCAATGATGTGGTGAAGATTTATTCTATCACAGCC 1776
Query 1102 ACTAATGCAGTTGATGGGGTGGCGTCCTCATGCCGTGCCTGTGCCCTCGGTTCTGAACAGTCGGGTTCATCGTG 1175
||||||||||||||||||||.||..|.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||..|||||.||
Sbjct 1777 ACTAATGCAGTTGATGGGGTAGCAGCGTCATGTCGTGCCTGTGCCCTGGGCTCTGAGCAGTCGGCCTCATCATG 1850
Query 1176 TGTCCCCTGCCCTCCAGGCCACTACATTGAGAAAGAAACCAACCAGTGCAAGGAATGTCCACCTGACACCTACC 1249
|||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||
Sbjct 1851 TGTACCCTGCCCCCCAGGCCACTACATTGAGAAGGAAACCAACCAGTGCAAGGAGTGTCCAGCTGACACCTACC 1924
Query 1250 TGTCCATACATCAGGTCTATGGCAAAGAGGCTTGTATTCCATGCGGGCCTGGGAGTAAAAACAATCAGGACCAT 1323
|||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||.||..||||||||.
Sbjct 1925 TGTCCATCCACCAGGTCTATGGCAAGGAAGCTTGCATTCCGTGTGGGCCTGGAAGTAAAAGCACCCAGGACCAC 1998
Query 1324 TCGGTTTGCTATAGTGACTGCTTTTTCTACCATGAAAAAGAAAATCAGAGTTTGCACTATGACTTTAGCAACCT 1397
|||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||.|.|||||||||||||..|||||||
Sbjct 1999 TCGCTTTGCTATAGCGACTGCTTTTTCTACCATGAAAAAGAAAACCAGACTCTGCACTATGACTTCCGCAACCT 2072
Query 1398 CAGCAGTGTGGGCTCATTAATGAATGGCCCCAGCTTCACCTCCAAAGGAACAAAATACTTCCATTTCTTCAATA 1471
|||||||||.|||||..|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CAGCAGTGTAGGCTCGCTGATGAATGGCCCCAGCTTCACCTCCAAGGGAACGAAATACTTCCATTTCTTCAATA 2146
Query 1472 TCAGTTTATGTGGGCATGAGGGGAAGAAGATGGCTCTCTGTACCAACAATATAACAGACTTTACAGTAAAAGAA 1545
|||||||||||||.||||||||||..||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||.|||
Sbjct 2147 TCAGTTTATGTGGACATGAGGGGAGAAAGATGGCTCTCTGTACCAACAATATTTCAGACTTTACGGTAAAGGAA 2220
Query 1546 ATAGTGGCAGGGTCAGATGATTACACAAATTTGGTAGGGGCATTTGTATGCCAGTCAACAATTATTCCTTCTGA 1619
||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2221 ATGGTGACAGGGTCAGATGATTACACAAATTTGGTTGGAGCATTTGTATGCCAGTCAACTATTATTCCTTCTGA 2294
Query 1620 AAGTAAGGGTTTCCGAGCAGCCTTATCATCACAATCCATCATTCTGGCAGATACATTCATAGGAGTCACAGTTG 1693
|||||||||.|||||.||||||.|.||.|||||.||.||||||||||||||||..||..||||.|||||.||||
Sbjct 2295 AAGTAAGGGCTTCCGGGCAGCCCTGTCGTCACAGTCTATCATTCTGGCAGATATGTTTTTAGGTGTCACTGTTG 2368
Query 1694 AAACCACATTGAAAAATATTAATATAAAAGAAGATATGTTCCCAGTTCCAACAAGCCAAATACCAGATGTGCAT 1767
|.||..|.|||.||||..|||||||.||.||.||||||||||||||..||.|.||||||.||||||||||.|||
Sbjct 2369 ACACTGCCTTGCAAAACGTTAATATCAAGGAGGATATGTTCCCAGTGTCACCGAGCCAAGTACCAGATGTTCAT 2442
Query 1768 TTCTTTTATAAGTCTTCTACAGCAACAACATCTTGTATTAATGGCCGATCAACTGCTGTGAAAATGAGGTGTAA 1841
|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2443 TTCTTTTATAAGTCTTCCACAGCCACCACATCTTGTATTAATGGACGATCGACTGCTGTGAAGATGAGGTGTAA 2516
Query 1842 TCCTACTAAATCTGGAGCAGGAGTGATTTCAGTCCCCAGCAAGTGCCCAGCAGGTACCTGTGATGGGTGTACGT 1915
|||.|..|.|.||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 2517 TCCCATGAGACCTGGTGCAGGTGTGATATCAGTCCCCAGCAAGTGTCCAGCTGGCACCTGTGATGGTTGTACCT 2590
Query 1916 TCTATTTCCTGTGGGAGAGTGCTGAAGCTTGCCCTCTGTGTACGGAGCATGACTTCCATGAGATTGAGGGAGCC 1989
||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2591 TCTACTTTCTATGGGAGAGTGCAGAAGCTTGCCCTCTGTGCACAGAACATGACTTCCATGAGATCGAGGGAGCC 2664
Query 1990 TGCAAGAGAGGATTTCAGGAAACCTTGTATGTGTGGAATGAACCTAAATGGTGCATTAAAGGAATTTCTTTGCC 2063
|||||||||||..|||||||||..||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 TGCAAGAGAGGGCTTCAGGAAATATTATATGTATGGAATGAACCTAAGTGGTGCATTAAAGGAATTTCTTTGCC 2738
Query 2064 TGAGAAAAAGTTGGCAACCTGTGAAACGGTTGACTTTTGGCTGAAGGTGGGAGCCGGTGTGGGAGCTTTTACTG 2137
.||.||.||||||.|||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||.|
Sbjct 2739 CGAAAAGAAGTTGTCAACCTGCGAAACTGTTGACTTTTGGCTGAAAGTGGGAGCTGGTGTGGGCGCGTTCACAG 2812
Query 2138 CCGTTTTGCTGGTGGCTCTGACCTGCTACTTCTGGAAAAAGAATCAAAAACTGGAATACAAATATTCCAAGTTA 2211
||||||||.||||||||.|.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 2813 CCGTTTTGTTGGTGGCTTTAACATGCTACTTTTGGAAAAAGAATCAAAAGCTGGAATACAAATATTCTAAATTA 2886
Query 2212 GTAATGACGACTAACTCAAAAGAGTGTGAACTCCCGGCTGCAGACAGTTGTGCTATCATGGAAGGAGAAGATAA 2285
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 GTAATGACGACTAACTCAAAAGAGTGTGAACTCCCAGCTGCAGACAGCTGTGCTATCATGGAAGGAGAAGATAA 2960
Query 2286 TGAAGAGGAAGTTGTATATTCCAATAAACAGTCACTACTAGGAAAACTCAAATCTTTGGCAACCAAGGAAAAAG 2359
|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||
Sbjct 2961 TGAAGAGGATGTTGTATATTCCAACAAACAGTCACTACTAGGAAAACTTAAGTCTTTGGCCACAAAGGAAAAAG 3034
Query 2360 AAGACCATTTTGAATCTGTTCAACTGAAAACCTCAAGATCCCCAAATATA 2409
|.|||||.|||||.||||||||.||||||.|||||||||.|||.||||||
Sbjct 3035 ATGACCACTTTGAGTCTGTTCAGCTGAAATCCTCAAGATGCCCCAATATA 3084