Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13433
• Subject: XM_011515921.1
• Aligned Length: 2745
• Identities: 2409
• Gaps: 336

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAAGAACCAGGTATGCAGTAAGTGTGGTGAAGGCACCTATTCCTTGGGCAGTGGCATCAAATTTGATGAATG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGATGAATTGCCGGCAGGATTTTCTAACATCGCAACATTCATGGACACTGTGGTGGGCCCTTCTGACAGCAGGC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CAGACGGCTGTAACAACTCTTCTTGGATCCCTCGTGGAAACTACATAGAATCTAATCGTGATGACTGCACGGTG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  TCTTTGATCTATGCTGTGCACCTTAAGAAGTCAGGCTATGTCTTCTTTGAGTACCAGTATGTCGACAACAACAT  296

Query    1  ----------------------------------------ATGGACACCACCACTGACAAGTGGGTAAAACTTA  34
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTCTTTGAGTTCTTTATTCAAAATGATCAGTGCCAGGAGATGGACACCACCACTGACAAGTGGGTAAAACTTA  370

Query   35  CAGACAATGGAGAATGGGGCTCTCATTCTGTAATGCTGAAATCAGGCACAAACATACTCTACTGGAGAACTACA  108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGACAATGGAGAATGGGGCTCTCATTCTGTAATGCTGAAATCAGGCACAAACATACTCTACTGGAGAACTACA  444

Query  109  GGCATCCTTATGGGTTCTAAGGCGGTCAAGCCTGTGCTGGTAAAAAATATCACAATTGAAGGGGTGGCGTACAC  182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCATCCTTATGGGTTCTAAGGCGGTCAAGCCTGTGCTGGTAAAAAATATCACAATTGAAGGGGTGGCGTACAC  518

Query  183  ATCAGAATGTTTTCCTTGCAAGCCAGGCACATTCAGCAACAAACCAGGTTCATTCAACTGCCAGGTGTGTCCCA  256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATCAGAATGTTTTCCTTGCAAGCCAGGCACATTCAGCAACAAACCAGGTTCATTCAACTGCCAGGTGTGTCCCA  592

Query  257  GAAACACCTATTCTGAGAAAGGAGCCAAAGAATGTATAAGGTGTAAAGACGACTCTCAATTTTCAGAGGAAGGA  330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAAACACCTATTCTGAGAAAGGAGCCAAAGAATGTATAAGGTGTAAAGACGACTCTCAATTTTCAGAGGAAGGA  666

Query  331  TCCAGTGAGTGTACAGAGCGCCCTCCCTGTACCACAAAAGACTATTTCCAGATCCATACTCCATGTGATGAAGA  404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCAGTGAGTGTACAGAGCGCCCTCCCTGTACCACAAAAGACTATTTCCAGATCCATACTCCATGTGATGAAGA  740

Query  405  AGGAAAGACACAGATAATGTACAAGTGGATAGAGCCCAAAATCTGCCGGGAGGATCTCACAGATGCTATTAGAT  478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGAAAGACACAGATAATGTACAAGTGGATAGAGCCCAAAATCTGCCGGGAGGATCTCACAGATGCTATTAGAT  814

Query  479  TGCCCCCTTCTGGAGAGAAGAAGGATTGTCCGCCTTGCAACCCTGGATTTTATAACAATGGATCATCTTCTTGC  552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCCCCCTTCTGGAGAGAAGAAGGATTGTCCGCCTTGCAACCCTGGATTTTATAACAATGGATCATCTTCTTGC  888

Query  553  CATCCCTGTCCTCCTGGAACATTTTCAGATGGAACCAAAGAATGTAGACCATGTCCAGCAGGAACGGAGCCTGC  626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CATCCCTGTCCTCCTGGAACATTTTCAGATGGAACCAAAGAATGTAGACCATGTCCAGCAGGAACGGAGCCTGC  962

Query  627  ACTTGGCTTTGAATATAAATGGTGGAATGTCCTTCCTGGCAACATGAAAACTTCCTGCTTCAATGTTGGGAATT  700
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACTTGGCTTTGAATATAAATGGTGGAATGTCCTTCCTGGCAACATGAAAACTTCCTGCTTCAATGTTGGGAATT  1036

Query  701  CAAAGTGCGATGGAATGAATGGTTGGGAGGTGGCTGGAGATCATATCCAGAGTGGGGCTGGAGGTTCTGACAAT  774
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAAAGTGCGATGGAATGAATGGTTGGGAGGTGGCTGGAGATCATATCCAGAGTGGGGCTGGAGGTTCTGACAAT  1110

Query  775  GATTACCTGATCTTAAACTTGCATATCCCAGGATTTAAACCACCAACATCTATGACTGGAGCCACGGGTTCTGA  848
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GATTACCTGATCTTAAACTTGCATATCCCAGGATTTAAACCACCAACATCTATGACTGGAGCCACGGGTTCTGA  1184

Query  849  ACTAGGAAGAATAACATTTGTCTTTGAGACCCTCTGTTCAGCTGACTGTGTTTTGTACTTCATGGTGGATATTA  922
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACTAGGAAGAATAACATTTGTCTTTGAGACCCTCTGTTCAGCTGACTGTGTTTTGTACTTCATGGTGGATATTA  1258

Query  923  ATAGAAAAAGTACAAATGTGGTAGAATCGTGGGGTGGAACCAAAGAAAAACAAGCTTACACCCATATCATCTTC  996
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATAGAAAAAGTACAAATGTGGTAGAATCGTGGGGTGGAACCAAAGAAAAACAAGCTTACACCCATATCATCTTC  1332

Query  997  AAGAATGCAACTTTTACATTTACATGGGCATTCCAGAGAACTAATCAGGGTCAAGATAATAGACGGTTCATCAA  1070
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGAATGCAACTTTTACATTTACATGGGCATTCCAGAGAACTAATCAGGGTCAAGATAATAGACGGTTCATCAA  1406

Query 1071  TGACATGGTGAAGATTTATTCTATCACAGCCACTAATGCAGTTGATGGGGTGGCGTCCTCATGCCGTGCCTGTG  1144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGACATGGTGAAGATTTATTCTATCACAGCCACTAATGCAGTTGATGGGGTGGCGTCCTCATGCCGTGCCTGTG  1480

Query 1145  CCCTCGGTTCTGAACAGTCGGGTTCATCGTGTGTCCCCTGCCCTCCAGGCCACTACATTGAGAAAGAAACCAAC  1218
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCCTCGGTTCTGAACAGTCGGGTTCATCGTGTGTCCCCTGCCCTCCAGGCCACTACATTGAGAAAGAAACCAAC  1554

Query 1219  CAGTGCAAGGAATGTCCACCTGACACCTACCTGTCCATACATCAGGTCTATGGCAAAGAGGCTTGTATTCCATG  1292
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAGTGCAAGGAATGTCCACCTGACACCTACCTGTCCATACATCAGGTCTATGGCAAAGAGGCTTGTATTCCATG  1628

Query 1293  CGGGCCTGGGAGTAAAAACAATCAGGACCATTCGGTTTGCTATAGTGACTGCTTTTTCTACCATGAAAAAGAAA  1366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CGGGCCTGGGAGTAAAAACAATCAGGACCATTCGGTTTGCTATAGTGACTGCTTTTTCTACCATGAAAAAGAAA  1702

Query 1367  ATCAGAGTTTGCACTATGACTTTAGCAACCTCAGCAGTGTGGGCTCATTAATGAATGGCCCCAGCTTCACCTCC  1440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATCAGAGTTTGCACTATGACTTTAGCAACCTCAGCAGTGTGGGCTCATTAATGAATGGCCCCAGCTTCACCTCC  1776

Query 1441  AAAGGAACAAAATACTTCCATTTCTTCAATATCAGTTTATGTGGGCATGAGGGGAAGAAGATGGCTCTCTGTAC  1514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AAAGGAACAAAATACTTCCATTTCTTCAATATCAGTTTATGTGGGCATGAGGGGAAGAAGATGGCTCTCTGTAC  1850

Query 1515  CAACAATATAACAGACTTTACAGTAAAAGAAATAGTGGCAGGGTCAGATGATTACACAAATTTGGTAGGGGCAT  1588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CAACAATATAACAGACTTTACAGTAAAAGAAATAGTGGCAGGGTCAGATGATTACACAAATTTGGTAGGGGCAT  1924

Query 1589  TTGTATGCCAGTCAACAATTATTCCTTCTGAAAGTAAGGGTTTCCGAGCAGCCTTATCATCACAATCCATCATT  1662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TTGTATGCCAGTCAACAATTATTCCTTCTGAAAGTAAGGGTTTCCGAGCAGCCTTATCATCACAATCCATCATT  1998

Query 1663  CTGGCAGATACATTCATAGGAGTCACAGTTGAAACCACATTGAAAAATATTAATATAAAAGAAGATATGTTCCC  1736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CTGGCAGATACATTCATAGGAGTCACAGTTGAAACCACATTGAAAAATATTAATATAAAAGAAGATATGTTCCC  2072

Query 1737  AGTTCCAACAAGCCAAATACCAGATGTGCATTTCTTTTATAAGTCTTCTACAGCAACAACATCTTGTATTAATG  1810
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AGTTCCAACAAGCCAAATACCAGATGTGCATTTCTTTTATAAGTCTTCTACAGCAACAACATCTTGTATTAATG  2146

Query 1811  GCCGATCAACTGCTGTGAAAATGAGGTGTAATCCTACTAAATCTGGAGCAGGAGTGATTTCAGTCCCCAGCAAG  1884
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GCCGATCAACTGCTGTGAAAATGAGGTGTAATCCTACTAAATCTGGAGCAGGAGTGATTTCAGTCCCCAGCAAG  2220

Query 1885  TGCCCAGCAGGTACCTGTGATGGGTGTACGTTCTATTTCCTGTGGGAGAGTGCTGAAGCTTGCCCTCTGTGTAC  1958
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TGCCCAGCAGGTACCTGTGATGGGTGTACGTTCTATTTCCTGTGGGAGAGTGCTGAAGCTTGCCCTCTGTGTAC  2294

Query 1959  GGAGCATGACTTCCATGAGATTGAGGGAGCCTGCAAGAGAGGATTTCAGGAAACCTTGTATGTGTGGAATGAAC  2032
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GGAGCATGACTTCCATGAGATTGAGGGAGCCTGCAAGAGAGGATTTCAGGAAACCTTGTATGTGTGGAATGAAC  2368

Query 2033  CTAAATGGTGCATTAAAGGAATTTCTTTGCCTGAGAAAAAGTTGGCAACCTGTGAAACGGTTGACTTTTGGCTG  2106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CTAAATGGTGCATTAAAGGAATTTCTTTGCCTGAGAAAAAGTTGGCAACCTGTGAAACGGTTGACTTTTGGCTG  2442

Query 2107  AAGGTGGGAGCCGGTGTGGGAGCTTTTACTGCCGTTTTGCTGGTGGCTCTGACCTGCTACTTCTGGAAAAAGAA  2180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  AAGGTGGGAGCCGGTGTGGGAGCTTTTACTGCCGTTTTGCTGGTGGCTCTGACCTGCTACTTCTGGAAAAAGAA  2516

Query 2181  TCAAAAACTGGAATACAAATATTCCAAGTTAGTAATGACGACTAACTCAAAAGAGTGTGAACTCCCGGCTGCAG  2254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TCAAAAACTGGAATACAAATATTCCAAGTTAGTAATGACGACTAACTCAAAAGAGTGTGAACTCCCGGCTGCAG  2590

Query 2255  ACAGTTGTGCTATCATGGAAGGAGAAGATAATGAAGAGGAAGTTGTATATTCCAATAAACAGTCACTACTAGGA  2328
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  ACAGTTGTGCTATCATGGAAGGAGAAGATAATGAAGAGGAAGTTGTATATTCCAATAAACAGTCACTACTAGGA  2664

Query 2329  AAACTCAAATCTTTGGCAACCAAGGAAAAAGAAGACCATTTTGAATCTGTTCAACTGAAAACCTCAAGATCCCC  2402
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  AAACTCAAATCTTTGGCAACCAAGGAAAAAGAAGACCATTTTGAATCTGTTCAACTGAAAACCTCAAGATCCCC  2738

Query 2403  AAATATA  2409
            |||||||
Sbjct 2739  AAATATA  2745