Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13433
• Subject: XM_017011843.1
• Aligned Length: 3087
• Identities: 2217
• Gaps: 870

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTGTTCCGCGCCCGGGGGCCGGTACGGGGCAGGGGCTGGGGGCGGCCGGCGGAGGCTCCCCGCCGCGGGCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTCGCCGCCCTGGAGCCCCGCCTGGATTTGCTGCTGGGCGCTCGCCGGCTGCCAGGCGGCCTGGGCTGGGGACC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TGCCCTCCTCCTCCAGCCGCCCGCTTCCTCCTTGCCAGGAGAAAGATTATCACTTTGAATATACGGAATGTGAT  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  AGCAGTGGCTCCAGGTGGAGAGTTGCCATTCCAAATTCTGCAGTGGACTGCTCTGGCCTGCCTGACCCAGTGAG  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  AGGCAAAGAATGCACTTTCTCCTGTGCTTCTGGAGAGTATCTAGAAATGAAGAACCAGGTATGCAGTAAGTGTG  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  GTGAAGGCACCTATTCCTTGGGCAGTGGCATCAAATTTGATGAATGGGATGAATTGCCGGCAGGATTTTCTAAC  444

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  445  ATCGCAACATTCATGGACACTGTGGTGGGCCCTTCTGACAGCAGGCCAGACGGCTGTAACAACTCTTCTTGGAT  518

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  519  CCCTCGTGGAAACTACATAGAATCTAATCGTGATGACTGCACGGTGTCTTTGATCTATGCTGTGCACCTTAAGA  592

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  593  AGTCAGGCTATGTCTTCTTTGAGTACCAGTATGTCGACAACAACATCTTCTTTGAGTTCTTTATTCAAAATGAT  666

Query    1  ------------ATGGACACCACCACTGACAAGTGGGTAAAACTTACAGACAATGGAGAATGGGGCTCTCATTC  62
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGTGCCAGGAGATGGACACCACCACTGACAAGTGGGTAAAACTTACAGACAATGGAGAATGGGGCTCTCATTC  740

Query   63  TGTAATGCTGAAATCAGGCACAAACATACTCTACTGGAGAACTACAGGCATCCTTATGGGTTCTAAGGCGGTCA  136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTAATGCTGAAATCAGGCACAAACATACTCTACTGGAGAACTACAGGCATCCTTATGGGTTCTAAGGCGGTCA  814

Query  137  AGCCTGTGCTGGTAAAAAATATCACAATTGAAGGGGTGGCGTACACATCAGAATGTTTTCCTTGCAAGCCAGGC  210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGCCTGTGCTGGTAAAAAATATCACAATTGAAGGGGTGGCGTACACATCAGAATGTTTTCCTTGCAAGCCAGGC  888

Query  211  ACATTCAGCAACAAACCAGGTTCATTCAACTGCCAGGTGTGTCCCAGAAACACCTATTCTGAGAAAGGAGCCAA  284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACATTCAGCAACAAACCAGGTTCATTCAACTGCCAGGTGTGTCCCAGAAACACCTATTCTGAGAAAGGAGCCAA  962

Query  285  AGAATGTATAAGGTGTAAAGACGACTCTCAATTTTCAGAGGAAGGATCCAGTGAGTGTACAGAGCGCCCTCCCT  358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGAATGTATAAGGTGTAAAGACGACTCTCAATTTTCAGAGGAAGGATCCAGTGAGTGTACAGAGCGCCCTCCCT  1036

Query  359  GTACCACAAAAGACTATTTCCAGATCCATACTCCATGTGATGAAGAAGGAAAGACACAGATAATGTACAAGTGG  432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTACCACAAAAGACTATTTCCAGATCCATACTCCATGTGATGAAGAAGGAAAGACACAGATAATGTACAAGTGG  1110

Query  433  ATAGAGCCCAAAATCTGCCGGGAGGATCTCACAGATGCTATTAGATTGCCCCCTTCTGGAGAGAAGAAGGATTG  506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATAGAGCCCAAAATCTGCCGGGAGGATCTCACAGATGCTATTAGATTGCCCCCTTCTGGAGAGAAGAAGGATTG  1184

Query  507  TCCGCCTTGCAACCCTGGATTTTATAACAATGGATCATCTTCTTGCCATCCCTGTCCTCCTGGAACATTTTCAG  580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCCGCCTTGCAACCCTGGATTTTATAACAATGGATCATCTTCTTGCCATCCCTGTCCTCCTGGAACATTTTCAG  1258

Query  581  ATGGAACCAAAGAATGTAGACCATGTCCAGCAGGAACGGAGCCTGCACTTGGCTTTGAATATAAATGGTGGAAT  654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATGGAACCAAAGAATGTAGACCATGTCCAGCAGGAACGGAGCCTGCACTTGGCTTTGAATATAAATGGTGGAAT  1332

Query  655  GTCCTTCCTGGCAACATGAAAACTTCCTGCTTCAATGTTGGGAATTCAAAGTGCGATGGAATGAATGGTTGGGA  728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTCCTTCCTGGCAACATGAAAACTTCCTGCTTCAATGTTGGGAATTCAAAGTGCGATGGAATGAATGGTTGGGA  1406

Query  729  GGTGGCTGGAGATCATATCCAGAGTGGGGCTGGAGGTTCTGACAATGATTACCTGATCTTAAACTTGCATATCC  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGTGGCTGGAGATCATATCCAGAGTGGGGCTGGAGGTTCTGACAATGATTACCTGATCTTAAACTTGCATATCC  1480

Query  803  CAGGATTTAAACCACCAACATCTATGACTGGAGCCACGGGTTCTGAACTAGGAAGAATAACATTTGTCTTTGAG  876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CAGGATTTAAACCACCAACATCTATGACTGGAGCCACGGGTTCTGAACTAGGAAGAATAACATTTGTCTTTGAG  1554

Query  877  ACCCTCTGTTCAGCTGACTGTGTTTTGTACTTCATGGTGGATATTAATAGAAAAAGTACAAATGTGGTAGAATC  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ACCCTCTGTTCAGCTGACTGTGTTTTGTACTTCATGGTGGATATTAATAGAAAAAGTACAAATGTGGTAGAATC  1628

Query  951  GTGGGGTGGAACCAAAGAAAAACAAGCTTACACCCATATCATCTTCAAGAATGCAACTTTTACATTTACATGGG  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GTGGGGTGGAACCAAAGAAAAACAAGCTTACACCCATATCATCTTCAAGAATGCAACTTTTACATTTACATGGG  1702

Query 1025  CATTCCAGAGAACTAATCAGGGTCAAGATAATAGACGGTTCATCAATGACATGGTGAAGATTTATTCTATCACA  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CATTCCAGAGAACTAATCAGGGTCAAGATAATAGACGGTTCATCAATGACATGGTGAAGATTTATTCTATCACA  1776

Query 1099  GCCACTAATGCAGTTGATGGGGTGGCGTCCTCATGCCGTGCCTGTGCCCTCGGTTCTGAACAGTCGGGTTCATC  1172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCCACTAATGCAGTTGATGGGGTGGCGTCCTCATGCCGTGCCTGTGCCCTCGGTTCTGAACAGTCGGGTTCATC  1850

Query 1173  GTGTGTCCCCTGCCCTCCAGGCCACTACATTGAGAAAGAAACCAACCAGTGCAAGGAATGTCCACCTGACACCT  1246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GTGTGTCCCCTGCCCTCCAGGCCACTACATTGAGAAAGAAACCAACCAGTGCAAGGAATGTCCACCTGACACCT  1924

Query 1247  ACCTGTCCATACATCAGGTCTATGGCAAAGAGGCTTGTATTCCATGCGGGCCTGGGAGTAAAAACAATCAGGAC  1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ACCTGTCCATACATCAGGTCTATGGCAAAGAGGCTTGTATTCCATGCGGGCCTGGGAGTAAAAACAATCAGGAC  1998

Query 1321  CATTCGGTTTGCTATAGTGACTGCTTTTTCTACCATGAAAAAGAAAATCAGAGTTTGCACTATGACTTTAGCAA  1394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CATTCGGTTTGCTATAGTGACTGCTTTTTCTACCATGAAAAAGAAAATCAGAGTTTGCACTATGACTTTAGCAA  2072

Query 1395  CCTCAGCAGTGTGGGCTCATTAATGAATGGCCCCAGCTTCACCTCCAAAGGAACAAAATACTTCCATTTCTTCA  1468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCTCAGCAGTGTGGGCTCATTAATGAATGGCCCCAGCTTCACCTCCAAAGGAACAAAATACTTCCATTTCTTCA  2146

Query 1469  ATATCAGTTTATGTGGGCATGAGGGGAAGAAGATGGCTCTCTGTACCAACAATATAACAGACTTTACAGTAAAA  1542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  ATATCAGTTTATGTGGGCATGAGGGGAAGAAGATGGCTCTCTGTACCAACAATATAACAGACTTTACAGTAAAA  2220

Query 1543  GAAATAGTGGCAGGGTCAGATGATTACACAAATTTGGTAGGGGCATTTGTATGCCAGTCAACAATTATTCCTTC  1616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GAAATAGTGGCAGGGTCAGATGATTACACAAATTTGGTAGGGGCATTTGTATGCCAGTCAACAATTATTCCTTC  2294

Query 1617  TGAAAGTAAGGGTTTCCGAGCAGCCTTATCATCACAATCCATCATTCTGGCAGATACATTCATAGGAGTCACAG  1690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TGAAAGTAAGGGTTTCCGAGCAGCCTTATCATCACAATCCATCATTCTGGCAGATACATTCATAGGAGTCACAG  2368

Query 1691  TTGAAACCACATTGAAAAATATTAATATAAAAGAAGATATGTTCCCAGTTCCAACAAGCCAAATACCAGATGTG  1764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TTGAAACCACATTGAAAAATATTAATATAAAAGAAGATATGTTCCCAGTTCCAACAAGCCAAATACCAGATGTG  2442

Query 1765  CATTTCTTTTATAAGTCTTCTACAGCAACAACATCTTGTATTAATGGCCGATCAACTGCTGTGAAAATGAGGTG  1838
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CATTTCTTTTATAAGTCTTCTACAGCAACAACATCTTGTATTAATGGCCGATCAACTGCTGTGAAAATGAGGTG  2516

Query 1839  TAATCCTACTAAATCTGGAGCAGGAGTGATTTCAGTCCCCAGCAAGTGCCCAGCAGGTACCTGTGATGGGTGTA  1912
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TAATCCTACTAAATCTGGAGCAGGAGTGATTTCAGTCCCCAGCAAGTGCCCAGCAGGTACCTGTGATGGGTGTA  2590

Query 1913  CGTTCTATTTCCTGTGGGAGAGTGCTGAAGCTTGCCCTCTGTGTACGGAGCATGACTTCCATGAGATTGAGGGA  1986
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  CGTTCTATTTCCTGTGGGAGAGTGCTGAAGCTTGCCCTCTGTGTACGGAGCATGACTTCCATGAGATTGAGGGA  2664

Query 1987  GCCTGCAAGAGAGGATTTCAGGAAACCTTGTATGTGTGGAATGAACCTAAATGGTGCATTAAAGGAATTTCTTT  2060
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GCCTGCAAGAGAGGATTTCAGGAAACCTTGTATGTGTGGAATGAACCTAAATGGTGCATTAAAGGAATTTCTTT  2738

Query 2061  GCCTGAGAAAAAGTTGGCAACCTGTGAAACGGTTGACTTTTGGCTGAAGGTGGGAGCCGGTGTGGGAGCTTTTA  2134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  GCCTGAGAAAAAGTTGGCAACCTGTGAAACGGTTGACTTTTGGCTGAAGGTGGGAGCCGGTGTGGGAGCTTTTA  2812

Query 2135  CTGCCGTTTTGCTGGTGGCTCTGACCTGCTACTTCTGGAAAAAGAATCAAAAACTGGAATACAAATATTCCAAG  2208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      
Sbjct 2813  CTGCCGTTTTGCTGGTGGCTCTGACCTGCTACTTCTGGAAAAAGAATCAAAA----------------------  2864

Query 2209  TTAGTAATGACGACTAACTCAAAAGAGTGTGAACTCCCGGCTGCAGACAGTTGTGCTATCATGGAAGGAGAAGA  2282
                                                                                      
Sbjct 2865  --------------------------------------------------------------------------  2864

Query 2283  TAATGAAGAGGAAGTTGTATATTCCAATAAACAGTCACTACTAGGAAAACTCAAATCTTTGGCAACCAAGGAAA  2356
                                                                                  ||||
Sbjct 2865  ----------------------------------------------------------------------GAAA  2868

Query 2357  AAGAAGACCATTTTGAATCTGTTCAACTGAAAACCTCAAGATCCCCAAATATA  2409
            |||||||||||||||||||||||||||                          
Sbjct 2869  AAGAAGACCATTTTGAATCTGTTCAAC--------------------------  2895