Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13437
- Subject:
- NM_152751.2
- Aligned Length:
- 1443
- Identities:
- 1054
- Gaps:
- 387
Alignment
Query 1 ---------------------------ATGAGAAGATTGCTGAACGACAGCACTGGGCGGATCTATCAGCGAGT 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAAATAAAAAAGCAAATTACAGGGATGAGAAGATTGCTGAACGACAGCACTGGGCGGATCTATCAGCGAGT 74
Query 48 TGGCAAAGAAGGAGAGAAACTAAAAGAAGAGCCCCAGGACCTGGATTTAGTCTGGCCTCCACGTTTGAACTCCT 121
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGGCAAAGAAGGAGAGAAACTAAAAGAAGAGCCCCAGGACCTGGATTTAGTCTGGCCTCCACGTTTGAACTCCT 148
Query 122 CTGCTGAGGCCCCGCAAAGCCTCCACCCGTCTTCACGTGGTGTGTGGAATGAGCTACCGCCCCAGAGTGGACAG 195
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTGCTGAGGCCCCGCAAAGCCTCCACCCGTCTTCACGTGGTGTGTGGAATGAGCTACCGCCCCAGAGTGGACAG 222
Query 196 TTCTCAGGGCAGTATGGCACCCGTTCTAGAACCTTCCAAAGCCAGCCCCACCCTACCACGAGCTCCAATGGTAT 269
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTCTCAGGGCAGTATGGCACCCGTTCTAGAACCTTCCAAAGCCAGCCCCACCCTACCACGAGCTCCAAT----- 291
Query 270 GGTTGTCAACAAACATTCAGAAGGCTCTCATGGGGGAGAACTTCCAGTGGTGAATTCATCAGCTGGATCAAACT 343
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 292 ----------------------------------GGAGAACTTCCAGTGGTGAATTCATCAGCTGGATCAAACT 331
Query 344 GCTGTACTTGTAACTGCCAGTCAACGTTGCAGGCCATTCTACAAGAACTCAAGACCATGAGGAAATTAATGCAA 417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 332 GCTGTACTTGTAACTGCCAGTCAACGTTGCAGGCCATTCTACAAGAACTCAAGACCATGAGGAAATTAATGCAA 405
Query 418 ATTCAAGCAGTTGGAACTCAAAACAGACAACAACCTCCAATTTCCCTTATATGCTCCCAGCGAACTGCTGTCTC 491
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 406 ATTCAAGCAGTTGGAACTCAAAACAGACAACAACCTCCAATTTCCCTTATATGCTCCCAGCGAACTGCTGTCTC 479
Query 492 ACGAAAGAGAAATAAAAAGAAAAAAGTGCCCCCAAAGACTGTGGAACCTCTTACTGTGAAACAGAAGCCCAGTG 565
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 ACGAAAGAGAAATAAAAAGAAAAAAGTGCCCCCAAAGACTGTGGAACCTCTTACTGTGAAACAGAAGCCCAGTG 553
Query 566 GGTCAGAGATGGAGAAAAAGTCGGTGGTGGCCTCTGAGCTATCTGCTCTCCAGGCAGCCGAGCACACCTCCCCG 639
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 554 GGTCAGAGATGGAGAAAAAGTCGGTGGTGGCCTCTGAGCTATCTGCTCTCCAGGCAGCCGAGCACACCTCCCCG 627
Query 640 GAGGAGAGCCGCGTTCTAGGATTCGGCATTGTTCTGGAATCACCTTCCTCAGATCCAGAAGTACAACTTGCTGA 713
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 628 GAGGAGAGCCGCGTTCTAGGATTCGGCATTGTTCTGGAATCACCTTCCTCAGATCCAGAAGTACAACTTGCTGA 701
Query 714 AGGCTTTGACGTGTTTATGCCTAAATCTCAGCTGGACTCTATATTGTCAAACTACACTCGCTCAGGAAGCCTTC 787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 702 AGGCTTTGACGTGTTTATGCCTAAATCTCAGCTGGACTCTATATTGTCAAACTACACTCGCTCAGGAAGCCTTC 775
Query 788 TGTTTAGAAAACTGGTGTGTGCGTTTTTTGATGACAAGACTTTGGCTAACTCCTTACCCAATGGGAAGAGGAAA 861
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 776 TGTTTAGAAAACTGGTGTGTGCGTTTTTTGATGACAAGACTTTGGCTAACTCCTTACCCAATGGGAAGAGGAAA 849
Query 862 AGAGGACTCAATGACAACCGGAAAGGACTAGACCAAAATATTGTGGGTGCAATAAAAGTCTTCACAGAAAAGTA 935
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 850 AGAGGACTCAATGACAACCGGAAAGGACTAGACCAAAATATTGTGGGTGCAATAAAAGTCTTCACAGAAAAGTA 923
Query 936 CTGTACAGCTAACCATGTGGATAAGCTTCCTGGCCCAAGAGATTGGGTGCAGATTCTACAGGATCAAATTAAAC 1009
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 924 CTGTACAGCTAACCATGTGGATAAGCTTCCTGGCCCAAGAGATTGGGTACAGATTCTACAGGATCAAATTAAAC 997
Query 1010 TGGCCAGAAGAAGGTTAAAAAGAGGCT---CAGAGATCGCGGACAGTGATGAAAGACTGGACGGCATTGCTCTA 1080
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 998 TGGCCAGAAGAAGGTTAAAAAGAGGCTCAGCAGAGATCGCGGACAGTGATGAAAGACTGGACGGCATTGCTCTA 1071
Query 1081 CCACCAACA-------GTGGTC---------------------------------------------------- 1095
||||||||| |||||.
Sbjct 1072 CCACCAACAGGTGCTTGTGGTGGGCCCTGCACTGTTCTGCCGGGTGGGAGTGCAGCGGTGACCCTAGTCTTGCA 1145
Query 1096 -------------------------------------------------------------------------- 1095
Sbjct 1146 GAGCTCACCTCAGACAATGTCACAAGAAAAGGGACAGATGGCAGAACCCTGGGAGGAGCAGCATCTCGTGCTCC 1219
Query 1096 -------------------------------------------------------------------------- 1095
Sbjct 1220 TGAACAACCTTACCAGAGACAGAGCTGAAACAGGAGCTTTGTCCCAAACCAGCCAAGACTTCAAGCACCATTCA 1293
Query 1096 -------------------------------------------------------------------------- 1095
Sbjct 1294 TTCCTCATAACTCAGGTCTCAGCTACACTTCATCATCAGAGAGGGATTCGCAACTTTCCCACGCCAGGCTCAGC 1367
Query 1096 ------------------------------------- 1095
Sbjct 1368 CAAGTCTCTTACCCTTCACATCTCTTGCCTCTCTCTC 1404