Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13437
- Subject:
- XM_011238968.2
- Aligned Length:
- 1188
- Identities:
- 907
- Gaps:
- 135
Alignment
Query 1 ---------------------------ATGAGAAGATTGCTGAACGACAGCACTGGGCGGATCTATCAGCGAGT 47
|||||||||||.|||||.|||||||||||..||||.||||||||.||
Sbjct 1 ATGGAAATTAAAAAACAAATTACGGGGATGAGAAGATTACTGAATGACAGCACTGGAAGGATATATCAGCGTGT 74
Query 48 TGGCAAAGAAGGAGAGAAACTAAAAGAAGAGCCCCAGGACCTGGATTTAGTCTGGCCTCCACGTTTGAACTCCT 121
.||||||||||||||.|||.|||||.|||||||.||||...||||||||||||||||||..||.|..|||||.|
Sbjct 75 CGGCAAAGAAGGAGAAAAATTAAAACAAGAGCCGCAGGTTGTGGATTTAGTCTGGCCTCAGCGGTCCAACTCTT 148
Query 122 CTGCTGAGGCCCCGCAAAGCCTCCACCCGTCTTCACGTGGTGTGTGGAATGAGCTACCGCCCCAGAGTGGACAG 195
|..|.||||||.|.||..||||||||.|...|||||||||.|.|||||||||.|||||..||||.||.||.|||
Sbjct 149 CCACCGAGGCCTCACAGGGCCTCCACTCTAATTCACGTGGGGCGTGGAATGAACTACCAACCCAAAGCGGGCAG 222
Query 196 TTCTCAGGGCAGTATGGCACCCGTTCTAGAACCTTCCAAAGCCAGCCCCAC-CCTACCACGAGCTCCAATGGTA 268
|||||||||||||.|||..|.||.||.|||||||||||.|..||||||||| .|| |..|.||.||||||
Sbjct 223 TTCTCAGGGCAGTCTGGTCCACGCTCCAGAACCTTCCAGACTCAGCCCCACATCT-CTGCAAGTTCCAAT---- 291
Query 269 TGGTTGTCAACAAACATTCAGAAGGCTCTCATGGGGGAGAACTTCCAGTGGTGAATTCATCAGCTGGATCAAAC 342
|||||||||||||.||||||||||..||..|||||.|||
Sbjct 292 -----------------------------------GGAGAACTTCCAGGGGTGAATTCAATAGTCGGATCCAAC 330
Query 343 TGCTGTACTTGTAACTGCCAGTCAACGTTGCAGGCCATTCTACAAGAACTCAAGACCATGAGGAAATTAATGCA 416
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 331 TGCTGTACTTGTAACTGCCAGTCAACCTTGCAGGCCATTCTCCAAGAGCTCAAGACCATGAGGAAATTAATGCA 404
Query 417 AATTCAAGCAGTTGGAACTCAAAACAGACAACAACCTCCAATTTCCCTTATATGCTCCCAGCGAACTGCTGTCT 490
..||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct 405 GTTTCAAGCAGTTGGAACTCAAAACAGACAACAACCCCCAATTTCCCTTATGTGCTCCCAGCGAACCGCCGTCT 478
Query 491 CACGAAAGAGAAATAAAAAGAAAAAAGTGCCCCCAAAGACTGTGGAACCTCTTA---CTGTGAAACAGAAGCCC 561
||||.|||||||||||||||||||||||||..||.|||||||||.|||||.|.| |||||.|||..||||||
Sbjct 479 CACGCAAGAGAAATAAAAAGAAAAAAGTGCTTCCGAAGACTGTGCAACCTGTGACGGCTGTGGAACCAAAGCCC 552
Query 562 AGTGGGTCAGAGATGGAGAAAAAGTCGGTGG---TGGCCTCTGAGCTATCTGCTCTCCAGGCAGCCGAGCACAC 632
|||...|..||.|..|||||.|||.|.|..| .||||.|...||.|.|.|.||||||.||.||.||||.|||
Sbjct 553 AGTCCCTTGGAAACTGAGAAGAAGCCAGCAGCCTCGGCCACAAGGCCACCAGGTCTCCAAGCTGCAGAGCGCAC 626
Query 633 CTCCCCGGAGGAGAGCCGCGTTCTAGGATTCGGCATTGTTCTGGAATCACCTTCCTCAGATCCAGAAGTACAAC 706
||||.|.|||||||.||.|||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 627 CTCCACCGAGGAGAACCACGTCCTGGGATTTGGCATTGTTCTGGAATCGCCGTCCTCAGATCCAGAAGTGCAAC 700
Query 707 TTGCTGAAGGCTTTGACGTGTTTATGCCTAAATCTCAGCTGGACTCTATATTGTCAAACTACACTCGCTCAGGA 780
|||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 701 TTGCTGAAGGCTTCGATGTGTTTATGCCCAAATCTCAGCTGGACTCTATACTGTCAAACTACACTCGCTCAGGA 774
Query 781 AGCCTTCTGTTTAGAAAACTGGTGTGTGCGTTTTTTGATGACAAGACTTTGGCTAACTCCTTACCCAATGGGAA 854
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 775 AGCCTTCTGTTTAGAAAACTGGTGTGTGCATTTTTTGACGACAAGACTTTGGCTAACTCCTTACCCAACGGAAA 848
Query 855 GAGGAAAAGAGGACTCAATGACAACCGGAAAGGACTAGACCAAAATATTGTGGGTGCAATAAAAGTCTTCACAG 928
|.||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 849 GCGGAAAAGAGGGTTCAATGACAACCGGAAAGGACTAGACCAAAACATTGTGGGTGCAATAAAAGTCTTTACAG 922
Query 929 AAAAGTACTGTACAGCTAACCATGTGGATAAGCTTCCTGGCCCAAGAGATTGGGTGCAGATTCTACAGGATCAA 1002
||||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 923 AAAATTACTGTACTGCGAATCATGTGGATAAACTTCCTGGCCCCAGAGACTGGGTGCAGATTCTGCAGGATCAG 996
Query 1003 ATTAAACTGGCCAGAAGAAGGTTAAAAAGAGGCT---CAGAGATCGCGGACAGTGATGAAAGACTGGACGGCAT 1073
|||||||||||||||||||||||.|||.|||||| |||||.|.||.|||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 997 ATTAAACTGGCCAGAAGAAGGTTGAAACGAGGCTCAGCAGAGGTAGCTGACGGTGATGAAAGACTGGACCGCAT 1070
Query 1074 TGCTCTACCACCAACAGTGGTC---------------------------------------------------- 1095
..|||||||.|||||| ||||
Sbjct 1071 CTCTCTACCCCCAACA--GGTCATACATTTGTCATCAAGAGAGAGACCCCAGAGGACCCAGAACCAGGTTCCGT 1142
Query 1096 ---- 1095
Sbjct 1143 GGCC 1146