Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13453
• Subject: NM_172856.4
• Aligned Length: 1177
• Identities: 1042
• Gaps: 26

Alignment

Query    1  ATGGCAGGGATCTTAGCCTGGTTCTGGAACGAGAGGTTTTGGCTCCCGCACAATGTCACCTGGGCGGACCTGAA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGGGATCTTAGCCTGGTTCTGGAACGAGCGGTTTTGGCTTCCGCACAATGTCACCTGGGCAGACCTGAA  74

Query   75  GAACACGGAGGAGGCCACCTTCCCGCAGGCTGAGGACCTCTATCTCGCTTTTCCCCTGGCCTTCTGTATCTTCA  148
            ||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||.||||||||||.|||||||
Sbjct   75  GAACACGGAGGAAGCCACCTTTCCGCAGGCGGAGGACCTCTACCTTGCCTTCCCCTTGGCCTTCTGCATCTTCA  148

Query  149  TGGTGCGGCTCATCTTCGAGAGATTTGTAGCCAAACCGTGCGCCATAGCCCTCAACATTCAGGCCAATGGACCA  222
            |||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  149  TGGTGCGGCTCATCTTCGAGAGATTCATAGCCAAACCATGTGCCATAGCCCTCAACATCCAAGCCAATGGACCA  222

Query  223  CAAATTGCTCCGCCCAATGCCATTCTGGAAAAGGTCTTCACTGCAATTACAAAGCATCCTGATGAAAAGAGATT  296
            ||||.|||.|.|||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAAACTGCCCAGCCAAATGCCATTCTGGAAAAGGTTTTCACTGCTATAACAAAGCATCCTGATGAAAAGAGATT  296

Query  297  GGAAGGCCTCTCCAAGCAACTGGACTGGGATGTTCGAAGCATTCAGCGCTGGTTTCGACAAAGACGCAATCAGG  370
            .|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  297  AGAAGGGCTCTCCAAGCAGCTGGACTGGGATGTTCGGAGCATTCAACGCTGGTTTCGACAAAGACGCAACCAGG  370

Query  371  AGAAGCCAAGCACGCTGACGAGGTTCTGTGAGAGCATGTGGAGATTTTCATTTTACCTTTATGTATTTACCTAC  444
            ||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||.||||
Sbjct  371  AGAAACCCAGCACTCTGACCAGGTTCTGTGAGAGCATGTGGAGATTTTCCTTTTACCTCTATGTATTTAGCTAC  444

Query  445  GGAGTCAGATTCCTGAAAAAGACCCCCTGGTTGTGGAATACGAGGCATTGCTGGTACAACTACCCCTATCAGCC  518
            ||||||.|.|||.|||||.|||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct  445  GGAGTCCGGTTCTTGAAACAGACCCCTTGGTTGTGGAATACAAGACACTGCTGGTATAACTACCCTTACCAGCC  518

Query  519  ACTCACAACTGACCTTCACTACTATTACATCCTGGAGCTGTCGTTTTATTGGTCTTTGATGTTTTCTCAGTTCA  592
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.||||.|||||||
Sbjct  519  ACTCACAGCTGACCTTCACTACTATTACATCCTGGAGCTGTCATTTTATTGGTCTTTAATGGTTTCCCAGTTCA  592

Query  593  CTGATATCAAAAGAAAGGACTTTGGCATTATGTTCCTGCACCACCTTGTATCTATTTTCTTGATTACCTTTTCA  666
            |.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|.|.||||||||.||.|||||||||
Sbjct  593  CAGATATCAAAAGGAAGGACTTCGGCATTATGTTCCTGCACCACCTTGCAACAATTTTCTTAATAACCTTTTCA  666

Query  667  TATGTCAACAATATGGCCCGAGTAGGAACGCTGGTCCTTTGTCTTCATGATTCAGCTGATGCTCTTCTGGAGGC  740
            |||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||
Sbjct  667  TATGTCAACAACATGGCCCGAGTAGGAACCCTGGTCCTCTGTCTTCACGACTCAGCCGATGCTCTGCTAGAGGC  740

Query  741  TGCCAAAATGGCAAATTATGCCAAGTTTCAGAAAATGTGTGATCTCCTGTTTGTTATGTTTGCCGTGGTTTTTA  814
            ||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCCAAAATGGCAAATTACGCCAAATTTCAGAAAATGTGTGATCTCCTGTTTGTCATGTTTGCCGTGGTTTTTA  814

Query  815  TCACCACACGACTGGGTATATTTCCTCTCTGGGTGTTAAATACCACATTATTTGAAAGCTGGGAGATCGTTGGA  888
            ||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  815  TCACCACACGGCTGGGCATATTTCCTCTCTGGGTGTTGAATACCACATTATTTGAAAGTTGGGAGATCGTCGGA  888

Query  889  CCTTACCCTTCCTGGTGGGTTTTTAACCTACTGCTATTGCTAGTACAAGGGTTGAACTGCTTCTGGTCTTACTT  962
            ||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  889  CCCTACCCTTCCTGGTGGGTTTTTAACCTGCTGCTCTTGTTACTACAAGGGTTGAACTGCTTCTGGTCTTACCT  962

Query  963  GATTGTGAAAATAGCTTGCAAAGCTGTTTCAAGAGGCAAGGCTGGGAAGTGGAACCCTTTACATGTGTCCAAGG  1036
            ||||||.|||||||||||||||.|||||||||.|||||||                        ||.|||||||
Sbjct  963  GATTGTAAAAATAGCTTGCAAAACTGTTTCAAAAGGCAAG------------------------GTATCCAAGG  1012

Query 1037  ATGATCGAAGTGATATTGAGTCTAGCTCAGATGAGGAGGACTCAGAACCTCCGGGAAAGAATCCCCACACTGCG  1110
            ||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||.||.|.
Sbjct 1013  ATGACCGGAGTGACATTGAATCTAGCTCAGATGATGAGGACTCAGAGCCTCCAGGGAAGAAACCACACTCTTCA  1086

Query 1111  ACAACCACCAATGGGACCAGTGGTACCAACGGGTATCTCCTGACTGGCTCC-TGCTCCATGGATGAT  1176
            |||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||| ||| ||.|||.||||||||
Sbjct 1087  ACAACCACCAACGGAACCAGCGGTACCAATGGGTACCTCCTCACTGG-TCCTTGTTCCGTGGATGAT  1152