Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13480
• Subject: XM_011527885.3
• Aligned Length: 2592
• Identities: 2171
• Gaps: 420

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTGATGTTGATGCTGGTGGCGGCTGTGACCATGTGGCTCCGACCGCTGGTCACAGCTCAGCTCTGTCGTTC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TCGCACAGTGAGGACAGGAAAAGTGTTTAATCTGATACAGGACGTTCAAGGGGACCGCCTGTATTTTCATCCTA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CAACAACACGCTTGATTAAACATCCTTGCGAGAAAAATATAGCACTATATCTAGGGAAACAAGTTTTTTTCACA  222

Query    1  ATGGATAACTTTGAGACTAGTCTCCTTCCATTTACCATCCCTACATCAATGCAGGTCGGCGTACCAGAAGTGAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATGGATAACTTTGAGACTAGTCTCCTTCCATTTACCATCCCTACATCAATGCAGGTCGGCGTACCAGAAGTGAC  296

Query   75  ATCAGCACATTTTGCTGGTTCGTTATTGCTGTTAGTAGTGGATCAAAAAGTCTATATTTATGATTATGAAAATA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATCAGCACATTTTGCTGGTTCGTTATTGCTGTTAGTAGTGGATCAAAAAGTCTATATTTATGATTATGAAAATA  370

Query  149  ATTCTTGGAGCATGTCTTTAGGTATAAAACACCCTGTTACACATGTCTCTGGTGATAATTGTTGTTATACTGGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTCTTGGAGCATGTCTTTAGGTATAAAACACCCTGTTACACATGTCTCTGGTGATAATTGTTGTTATACTGGA  444

Query  223  AGTTTGTTTTGTGTGCATGTCAGTAATTTGGTTTTTGCATATTTCCGTGGAGATCAGATATCCCAGACTTATAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGTTTGTTTTGTGTGCATGTCAGTAATTTGGTTTTTGCATATTTCCGTGGAGATCAGATATCCCAGACTTATAT  518

Query  297  ATATTATTCAAATACTGGGGGATTCAGTTTTTGGAAGTATCACTATGACAGACAGGCAGAAATCATTGGGTCTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATATTATTCAAATACTGGGGGATTCAGTTTTTGGAAGTATCACTATGACAGACAGGCAGAAATCATTGGGTCTT  592

Query  371  TAGGCGGAATCTTCCACTTTTTTTCTTTGTCACAGGTTGCGATGCTTGTAGTGAATCAAGGGAAGGGCATGTTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAGGCGGAATCTTCCACTTTTTTTCTTTGTCACAGGTTGCGATGCTTGTAGTGAATCAAGGGAAGGGCATGTTC  666

Query  445  AAGTACTCAGATCACCCCCTCAACCGGAGTTTCGGGCTGTCTTTTGACTATAATGGGACTCTAGACATCCTCAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGTACTCAGATCACCCCCTCAACCGGAGTTTCGGGCTGTCTTTTGACTATAATGGGACTCTAGACATCCTCAT  740

Query  519  CGCCCCCGGCCAGAGAGGCATCCTGCTCCTATGGTTTGAGAACAGCCTGTTGTTTTCCCATAATGCAGGTCAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGCCCCCGGCCAGAGAGGCATCCTGCTCCTATGGTTTGAGAACAGCCTGTTGTTTTCCCATAATGCAGGTCAGC  814

Query  593  TCGTCGACACCGTCCGGGTGAAAAAAGGAGACCAGACCTTGTTTTCTTCCATTTTTGAAGCCAAGATCACCATC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCGTCGACACCGTCCGGGTGAAAAAAGGAGACCAGACCTTGTTTTCTTCCATTTTTGAAGCCAAGATCACCATC  888

Query  667  CACAACATTGCTGTCACTGAAAATGAACTGGCAGTTATAACTCGGGAGGATAATTTGTATTATGGCAATCTGGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CACAACATTGCTGTCACTGAAAATGAACTGGCAGTTATAACTCGGGAGGATAATTTGTATTATGGCAATCTGGG  962

Query  741  CATCGTGCCAAGTTCCATAATCAAATTTGCAGACCAATACATCTGGTCAGAAGACGTGGCCCTGATGTTCAGGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATCGTGCCAAGTTCCATAATCAAATTTGCAGACCAATACATCTGGTCAGAAGACGTGGCCCTGATGTTCAGGA  1036

Query  815  GCCCAGGGACTCTGGAAATACTGACCCCACTGCGTGACACAGCCTTTCCAGCTTTTGATTTCCAGAAGTGCCTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCCCAGGGACTCTGGAAATACTGACCCCACTGCGTGACACAGCCTTTCCAGCTTTTGATTTCCAGAAGTGCCTC  1110

Query  889  GTGAATATCCAGGCGCTTCTCATGGACCCTGAACTCCACGTTGGAAAGTGCAAGATAGAGTTTCTGACAGGAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTGAATATCCAGGCGCTTCTCATGGACCCTGAACTCCACGTTGGAAAGTGCAAGATAGAGTTTCTGACAGGAGA  1184

Query  963  ATTTATATACAGGATGTATACCATTGACATGCACAGCCAGCTGGAATTGACTGCTTCGTTGATACCCCAGCCAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ATTTATATACAGGATGTATACCATTGACATGCACAGCCAGCTGGAATTGACTGCTTCGTTGATACCCCAGCCAG  1258

Query 1037  GCACATCCCTGATTCCTCTGGTGATGGTGAGCAACCCCCACTCCCTGGGGTTCCAGGCCACCTTCTACGAGAAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCACATCCCTGATTCCTCTGGTGATGGTGAGCAACCCCCACTCCCTGGGGTTCCAGGCCACCTTCTACGAGAAC  1332

Query 1111  GGTTACACATCAGATGGGAACACCAAGTACAAACTGGATATTTTCCTAAAACAGCAGCAGCACTGGGGCAGGAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGTTACACATCAGATGGGAACACCAAGTACAAACTGGATATTTTCCTAAAACAGCAGCAGCACTGGGGCAGGAC  1406

Query 1185  CGACTCCAACTTCACTTCCAGTTTAAAGAAAGCCACCATGTCTACCTTAACTGTGGACATAGCAAACAAGGAAA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CGACTCCAACTTCACTTCCAGTTTAAAGAAAGCCACCATGTCTACCTTAACTGTGGACATAGCAAACAAGGAAA  1480

Query 1259  TTTCATGTGTGGATATCAAGCCACTGTCGGCACTGATTTCAGTTGGCTGCGACCTGGATAAAAAGATCGTCATC  1332
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTTCATGTGTGGATATCAAGCCACTGTCGACACTGATTTCAGTTGGCTGCGACCTGGATAAAAAGATCGTCATC  1554

Query 1333  CAGAACAAAGTTTCCGCCTGTTCCATGGGCATCCTGGACCCCTTGACCCTGCAAGACAATTACAGCTTCATCAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAGAACAAAGTTTCCGCCTGTTCCATGGGCATCCTGGACCCCTTGACCCTGCAAGACAATTACAGCTTCATCAT  1628

Query 1407  CGAGAAGGAATTCTACGACCCCGGCTTCCAGGGGCAGCAGTCCTCCGAGGACCTGCACGTGTTTTACTCCTACC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CGAGAAGGAATTCTACGACCCCGGCTTCCAGGGGCAGCAGTCCTCCGAGGACCTGCACGTGTTTTACTCCTACC  1702

Query 1481  AGCAGCTGGGCTGTCCTCTCCTCGTCTACTATGACACCCTATGGAAGCCCGTGGTGGAGCTGTGGCGAAAAGAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGCAGCTGGGCTGTCCTCTCCTCGTCTACTATGACACCCTATGGAAGCCCGTGGTGGAGCTGTGGCGAAAAGAC  1776

Query 1555  AGTTTCCAGGAGGTCATCGACGCCGAGTATGTGTTACTGGAGGTGAACGGGCAGTTCTCATACTCCTATTCCCT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AGTTTCCAGGAGGTCATCGACGCCGAGTATGTGTTACTGGAGGTGAACGGGCAGTTCTCATACTCCTATTCCCT  1850

Query 1629  GACGGCCCAGTCGGCCATGTGTACCTCCCAGCCGCAGAACTGGACCACCATGATAAAGGAATTCGGGGGGCCCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GACGGCCCAGTCGGCCATGTGTACCTCCCAGCCGCAGAACTGGACCACCATGATAAAGGAATTCGGGGGGCCCT  1924

Query 1703  TCTTCTGGAACAGAG-----------------------------------------------------------  1717
            |||||||||||||||                                                           
Sbjct 1925  TCTTCTGGAACAGAGAGGCTTCAGATGTACCAAATCAGAAGAAACACTGTGCCTGGCTCGTGACCGCCCTCAGC  1998

Query 1718  --------------------------------------------------------------------------  1717
                                                                                      
Sbjct 1999  ATTCCTTCTGGGCGGCAGACGCAGTTTGTCAGTTTGCCAACATTCTGCTTTTATGAGAAAGTTTGCTGTTTACT  2072

Query 1718  -----------------------------------------------------------------AGAACTATG  1726
                                                                             |||||||||
Sbjct 2073  CATATGGCCTCCAGTGGTATACGGAGTTGATCACCACCCTCAATCTTTCGGCCTCCAACAGAGGCAGAACTATG  2146

Query 1727  TGAGCTGCCACGACCCCAACAACAATGCCCCTTTGAGGTGGCCAGACGTCCAGTATCAGATCTTGGGCGGCCGG  1800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TGAGCTGCCACGACCCCAACAACAATGCCCCTTTGAGGTGGCCAGACGTCCAGTATCAGATCTTGGGCGGCCGG  2220

Query 1801  ACAGCAAACCAGATCATTTTCGGCCACAATGGCTTTTATGTCTTCTACATTTCGATCGTGGATCCGTACTACAG  1874
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ACAGCAAACCAGATCATTTTCGGCCACAATGGCTTTTATGTCTTCTACATTTCGATCGTGGATCCGTACTACAG  2294

Query 1875  CTACTGTCAACTGGAGACCATCTTTAGCATCTACGTGTATGGAGCATTCCCCGTGCAGCTGGTCTCTGCTGGAG  1948
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CTACTGTCAACTGGAGACCATCTTTAGCATCTACGTGTATGGAGCATTCCCCGTGCAGCTGGTCTCTGCTGGAG  2368

Query 1949  TCGTCATCCTACTGATCATCTCCAGCATCCTGGGGTCCGTTTGGCTGGCCTACAAGACCCCCAAGCTGCTACGC  2022
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TCGTCATCCTACTGATCATCTCCAGCATCCTGGGGTCCGTTTGGCTGGCCTACAAGACCCCCAAGCTGCTACGC  2442

Query 2023  ACAGCACGCGGCCGCAGGATCAAGAAGTGTGCGACACAGCTGTGTAGGAGATGCAAGACGGTCTGCCAGTTCAG  2096
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  ACAGCACGCGGCCGCAGGATCAAGAAGTGTGCGACACAGCTGTGTAGGAGATGCAAGACGGTCTGCCAGTTCAG  2516

Query 2097  GGCCTCAGCCACAGCCAGGGCAGGCACAGAGCCCCCGGGACGCCACCGCACTCCTCACGGAGGCAGGTCTGACC  2170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GGCCTCAGCCACAGCCAGGGCAGGCACAGAGCCCCCGGGACGCCACCGCACTCCTCACGGAGGCAGGTCTGACC  2590

Query 2171  AC  2172
            ||
Sbjct 2591  AC  2592