Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13551
• Subject: NM_001193318.3
• Aligned Length: 840
• Identities: 812
• Gaps: 21

Alignment

Query   1  ATGGCCAACTGGGTGTTCTGTAATCGCTGCTTCCAGCCGCCCCACAGGACGTCGTGCTTCAGCCTCACCAACTG  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCCAACTGGGTGTTCTGTAATCGCTGCTTCCAGCCGCCCCACAGGACGTCGTGCTTCAGCCTCACCAACTG  74

Query  75  CGGGCACGTGTACTGCGACGCCTGCCTCGGCAAAGGTAAAAAGAATGAATGCTTGATTTGTAAAGCTCCTTGTC  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CGGGCACGTGTACTGCGACGCCTGCCTCGGCAAAGGTAAAAAGAATGAATGCTTGATTTGTAAAGCTCCTTGTC  148

Query 149  GTACAGTTTTGCTTTCAAAGCATACCGACGCAGATATCCAGGCATTCTTCATGAGCATAGACAGTCTGTGTAAG  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  GTACAGTTTTGCTTTCAAAGCATACCGACGCAGATATCCAGGCATTCTTCATGAGCATAGACAGTCTGTGTAAG  222

Query 223  AAGTACTCCAGGGAAACCTCCCAGTATCTCAGGCTTTCCCGAGGCTGTTGCCGTCTCAAGTTATGCCCAGCCAC  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  AAGTACTCCAGGGAAACCTCCCAGTATCTCAGGCTTTCCCGAGGCTGTTGCCGTCTCAAGTTATGCCCAGCCAC  296

Query 297  ATCCTCCAAGGAGGTGCCCAGAGGCTCGACCCATGGAAGCCAAGCAGCAGCCAGAGATCCCCAAGAACACTGGG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  ATCCTCCAAGGAGGTGCCCAGAGGCTCGACCCATGGAAGCCAAGCAGCAGCCAGAGATCCCCAAGAACACTGGG  370

Query 371  TCAGCACAACACGGGCACCCAGACCAGGATGCCGGCGGTCCCAGAGCCAGCCAGAGGCCCATGGAAACACCATC  444
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 371  TCAGCACAACACGGGCACCCAGACCAGGATGCCGGCGGTCCCAGAGCCAGCCAGAGGCCCAGGGAAACACCATC  444

Query 445  CAGGACGCACCTCACCCCCTCACCCTGCTCCATCCCAGCAGGACCCTCATTCACACCAAGTCCCCTTGGGGCCG  518
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 445  CAGGACGCACCTCACCCCCTCACCCTGCTCCATCCCAGCAGGACCCTCATTCACACCAAGTCCCCTTGGGGCCA  518

Query 519  GAAGTTGCTTGAGTTCATAAAACATGTCTGTTATCACAGACATCAGAGCCACAGGCCGTGCGCTCCAGGGTGGT  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  GAAGTTGCTTGAGTTCATAAAACATGTCTGTTATCACAGACATCAGAGCCACAGGCCGTGCGCTCCAGGGTGGT  592

Query 593  TTTGCCAAGTGCTGCAGAGGCCAGGTGCTGTCTCAGGAGAGAAGACCCAGCAGACCCGGCCAGACCCTCCAGCC  666
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 593  TTTGCCAAGTGCTGCAGAGGCCAGGTGCTGTCTCAGGAGAGAAGACCCAGCAGACCCGGCCAGCCCCTCCAGCC  666

Query 667  ACCTGTCTGCTCTGCCTCTCATGCCTCTCAGGCTTCCGGCATGGACCGTGGAGATGGCTGGCTCCAGCCTGGGC  740
           ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|                   
Sbjct 667  ACCTGTCTGCTCTGCCTCTCGTGCCTCTCAGGCTTCCGGCATGGGCCGTGGAGGT-------------------  721

Query 741  AGCACAGGCTCTGCCCAGTGACCTCGTGGCCCCACTGTTTGTCAGTTACACTGTGGAGGTGAGCGTCACAAACG  814
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 722  --CACAGGCTCTGCCCAGTGACCTCGTGGCCCCACTGTTTGTCAGTTACACTGTGGAGGTGAGCATCACAAACG  793

Query 815  CAGGGTGGAGTTTTCCCGCAGCTGTG  840
           ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 794  CAGGGTGGAGTTTTCCCGCAGCTGTG  819