Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13627
• Subject: XM_006540670.3
• Aligned Length: 2671
• Identities: 2115
• Gaps: 206

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCACGTGGGAGCCTGCTGACAAGATGGGCATTCTGCCTGGCTGGTGTCAGGTGGAAGGTCCTCAGCTTCCT  74

Query    1  ---------------------------------------------ATGGAGCAGTACA----------AAC---  16
                                                         .||  ||| |.||          |||   
Sbjct   75  TCTTCAGTTTCTTGTACTCACGCTGCTCAGCGGACACCCCCACCCTTG--GCA-TCCACGACCCCATCAACTCC  145

Query   17  ------------TGCAGAGCGACCGGCTGCGTGAGCAGCAGGAGGAGATGGTGGAACTGCGGCTGCGGTTAGAG  78
                        |||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||..|||||
Sbjct  146  TGGACTGTGTCTTGCAGAGTGACCGCCTGCGGGAGCAGCAGGAAGAGATGGTAGAACTGCGGCTACGCCTAGAG  219

Query   79  CTGGTGCGGCCAGGCTGGGGGGGCCCGCGGCTCCTGAATGGCCTGCCTCCCGGGTCCTTTGTGCCTCGACCTCA  152
            ||||..|.|||.||||||||.|..|||.||||||||.|.|||.||||.||.||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct  220  CTGGCACAGCCTGGCTGGGGTGCACCGGGGCTCCTGCAGGGCTTGCCACCGGGATCCTTTGTGCCCCGGCCTCA  293

Query  153  TACAGCCCCCCTGGGGGGTGCCCACGCCCATGTGCTGGGCATGGTGCCGCCTGCCTGCCTCCCTGGAGATGAAG  226
            .||||||||||||||||||||||||.|.||..|||||||||||.||||..|..|.||.||.||||||||.||||
Sbjct  294  CACAGCCCCCCTGGGGGGTGCCCACACTCACATGCTGGGCATGATGCCCTCGACATGTCTTCCTGGAGAAGAAG  367

Query  227  TTGGCTCTGAGCAGAGGGGAGAGCAGGTGACAAATGGCAGGGAGGCTGGAGCTGAGTTGCTGACTGAGGTGAAC  300
            ||.|||||||||         ||||||||...|.|||||.|||.|....|||.|||.||.||.|..|||.|.||
Sbjct  368  TTAGCTCTGAGC---------AGCAGGTGGTGAGTGGCAAGGAAGTCAAAGCAGAGGTGTTGGCCCAGGCGGAC  432

Query  301  AGGCTGGGAAGTGGCTCTTCAGCTGCTTCAGAGGAGGAAGAGGAGGAG------------------------GA  350
            |...||.|.||||.||||||..||.|.|||||||||||||.|||||||                        ||
Sbjct  433  AAATTGAGGAGTGCCTCTTCCACTACATCAGAGGAGGAAGGGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAAGAAGAAGA  506

Query  351  GGAGCCGCCCAGGCGGACCTTACACCTGCGCAGAAATAGGATCAGCAACTGCAGTCAGAGGGCGGGGGCACGCC  424
            ||||||.|||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||.|||....|.|
Sbjct  507  GGAGCCACCCAGGCGGACCTTATACTTGCGCAGAAATGGGATCAGCAACTGGAGTCAGAGGGCAGGGTTGAGTC  580

Query  425  CAGGGAGTCTGCCAGAGAGGAAGGGCCCAGAGCTTTGCCTTGAGGAGTTGGATGCAGCCATTCCAGGGTCCA--  496
            |||||||.|..||.||.|||||||||||||||.|.||||..||.|||...|.|||.|||||.||||    ||  
Sbjct  581  CAGGGAGCCCACCTGACAGGAAGGGCCCAGAGGTCTGCCCAGAAGAGCCAGCTGCTGCCATCCCAG----CACC  650

Query  497  --GAGCAGTTGGTGGGAGCAAGGCCCGAGTTCAGGCCCGCCAGGTCCCCCCTGCCACAGCCTCAGAGTGGCGGC  568
              .||||||.|||.|..||||||.||.|||||||.|||||||||.|||..||||||..|||||.||||||||.|
Sbjct  651  ACAAGCAGTCGGTAGCGGCAAGGTCCCAGTTCAGACCCGCCAGGCCCCAGCTGCCATGGCCTCTGAGTGGCGAC  724

Query  569  TGGCCCAGGCCCAGCAGAAGATCCGGGAGCTGGCTATCAACATCCGCATGAAGGAGGAGCTTATTGGCGAGCTG  642
            |||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  725  TGGCCCAGGCCCAACAGAAAATCCGGGAACTGGCCATCAACATCCGCATGAAGGAGGAGCTCATTGGTGAGCTG  798

Query  643  GTCCGCACAGGAAAGGCAGCTCAGGCCCTGAACCGCCAGCACAGCCAGCGTATCCGGGAGCTGGAGCAGGAGGC  716
            |||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  799  GTCCGGACAGGGAAGGCGGCCCAGGCCCTGAACCGTCAACACAGCCAGCGCATCCGGGAGCTGGAGCAGGAGGC  872

Query  717  AGAGCAGGTGCGGGCCGAGCTGAGTGAAGGCCAGAGGCAGCTGCGGGAGCTCGAGGGCAAGGAGCTCCAGGATG  790
            .||||..||||||||.||||||.|||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||.|||||.|||.||||
Sbjct  873  TGAGCGTGTGCGGGCGGAGCTGTGTGAAGGGCAGAGGCAGCTTCGAGAGCTGGAGGGCAGGGAGCCCCAAGATG  946

Query  791  CTGGCGAGCGGTCTCGGCTCCAGGAGTTCCGCAGGAGGGTCGCTGCGGCCCAGAGCCAGGTGCAGGTGCTGAAG  864
            |..|||||.||||..||||||||||.|||||.|.|||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  947  CCAGCGAGAGGTCCAGGCTCCAGGAATTCCGTAAGAGAGTGGCTGCAGCCCAAAGCCAGGTGCAGGTGCTGAAG  1020

Query  865  GAGAAGAAGCAGGCTACGGAGCGGCTGGTGTCACTGTCGGCCCAGAGTGAGAAGCGACTGCAGGAGCTCGAGCG  938
            ||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||..||.||.||||||||.|||.|
Sbjct 1021  GAGAAGAAGCAGGCAACAGAGCGACTGGTGTCACTGTCGGCTCAAAGTGAGACTCGGCTACAGGAGCTGGAGAG  1094

Query  939  GAACGTGCAGCTCATGCGGCAGCAGCAGGGACAGCTGCAGAGGCGGCTTCGCGAGGAGACGGAGCAGAAGCGGC  1012
            |||.||||||||||||||||..||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1095  GAATGTGCAGCTCATGCGGCGACAGCAGGGGCAGCTGCAGAGGCGGCTCCGTGAGGAGACAGAGCAGAAGCGGC  1168

Query 1013  GCCTGGAGGCAGAAATGAGCAAGCGGCAGCACCGCGTCAAGGAGCTGGAGCTGAAGCATGAGCAACAGCAGAAG  1086
            ||||.|||.|.||.||||.||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1169  GCCTAGAGACGGAGATGAACAAGCGGCAGCATCGCGTCAAGGAGCTGGAACTGAAGCACGAGCAACAGCAAAAG  1242

Query 1087  ATCCTGAAGATTAAGACGGAAGAGATCGCGGCCTTCCAGAGGAAGAGGCGCAGTGGCAGCAACGGCTCTGTGGT  1160
            ||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1243  ATCCTGAAAATCAAGACAGAAGAGATTGCAGCCTTCCAGAGGAAGAGGCGCAGTGGCAGCAATGGCTCTGTGGT  1316

Query 1161  CAGCCTGGAACAGCAGCAGAAGATTGAGGAGCAGAAGAAGTGGCTGGACCAGGAGATGGAGAAGGTGCTACAGC  1234
            .||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1317  GAGCCTGGAGCAGCAGCAGAAGATCGAGGAGCAGAAGAAGTGGCTGGACCAGGAGATGGAAAAGGTGCTGCAGC  1390

Query 1235  AGCGGCGGGCGCTGGAGGAGCTGGGGGAGGAGCTCCACAAGCGGGAGGCCATCCTGGCCAAGAAGGAGGCCCTG  1308
            ||||||||||||||||||||.||||.||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1391  AGCGGCGGGCGCTGGAGGAGTTGGGAGAGGAGCTTCGCAAGCGGGAGGTCATCCTGGCCAAGAAGGAGGCCCTG  1464

Query 1309  ATGCAGGAGAAGACGGGGCTGGAGATCAAGCGCCTGAGATCCAGCCAGGCCCTCAACGAGGACATCGTGCGAGT  1382
            ||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||
Sbjct 1465  ATGCAGGAGAAGACGGGGCTTGAGAGCAAGCGCCTGAGGTCCAGCCAGGCCCTAAATGAAGACATTGTGCGTGT  1538

Query 1383  GTCCAGCCGGCTGGAGCACCTGGAGAAGGAGCTGTCCGAGAAGAGCGGGCAGCTGCGGCAGGGCAGCGCCCAGA  1456
            |||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1539  GTCCAGCCGCCTAGAACACCTGGAGAAGGAGCTATCTGAGAAGAGTGGGCAGCTGCGGCAAGGCAGCGCCCAGA  1612

Query 1457  GCCAGCAGCAGATCCGCAGGGAGATCGACAGCCTGCGCCAGGAGAAGGACTCACTGCTCAAGCAGCGCCTGGAG  1530
            .|||||||||||||.|..|||||||.||||.|||||||||.|||||||||||||||.|.|||||.|||||||||
Sbjct 1613  ACCAGCAGCAGATCAGAGGGGAGATAGACACCCTGCGCCAAGAGAAGGACTCACTGTTGAAGCAACGCCTGGAG  1686

Query 1531  ATCGACGGCAAGCTGAGGCAGGGGAGTCTGCTGTCCCCCGAGGAGGAGCGGACGCTGTTCCAGTTGGATGAGGC  1604
            ||.||..||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||.||||.|||||||||.|||||||.||
Sbjct 1687  ATTGATAGCAAGCTGAGGCAGGGAAGCCTGCTGTCACCTGAGGAAGAGAGGACACTGTTCCAGCTGGATGAAGC  1760

Query 1605  CATCGAGGCCCTGGATGCTGCCATTGAGTATAAGAATGAGGCCATCACATGCCGCCAGCGGGTGCTTCGGGCCT  1678
            |||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1761  CATCGAGGCCCTGGACGCTGCCATCGAGTACAAGAATGAGGCTATCACATGCCGCCAGCGGGTGCTACGGGCTT  1834

Query 1679  CAGCCTCGTTGCTGTCCCAGTGCGAGATGAACCTCATGGCCAAGCTCAGCTACCTCTCATCCTCAGAGACCAGA  1752
            |.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1835  CGGCCTCCTTGCTGTCCCAGTGTGAGATGAATCTCATGGCAAAGCTCAGCTACCTTTCCTCCTCAGAGACCAGA  1908

Query 1753  GCCCTCCTCTGCAAGTATTTTGACAAGGTGGTGACGCTCCGAGAGGAGCAGCACCAGCAGCAGATTGCCTTCTC  1826
            |||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1909  GCCCTGCTGTGCAAGTATTTTGACAAGGTGGTGACACTCCGAGAGGAGCAACACCAGCAACAGATTGCCTTCTC  1982

Query 1827  GGAACTGGAGATGCAGCTGGAGGAGCAGCAGAGGCTGGTGTACTGGCTGGAGGTGGCCCTGGAGCGGCAGCGCC  1900
            |||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1983  GGAGCTGGAGATGCAGCTGGAGGAGCAGCAGCGGCTGGTGTACTGGCTGGAGGTGGCCCTGGAGCGGCAGCGCC  2056

Query 1901  TGGAGATGGACCGCCAGCTGACCCTGCAGCAGAAGGAGCACGAGCAGAACATGCAGCTGCTCCTGCAGCAGAGT  1974
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||.||||||.|.
Sbjct 2057  TGGAGATGGACCGGCAGCTGACCCTGCAGCAGAAGGAGCACGAGCAGAATGTACAGCTGCTCCTCCAGCAGGGC  2130

Query 1975  CGAGACCACCTCGGTGAAGGGTTAGCAGACAGCAGGAGGCAGTATGAGGCCCGGATTCAAGCTCTGGAGAAGGA  2048
            |||||||||||.||.||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2131  CGAGACCACCTTGGCGAGGGGTTAGCAGACAGCAAGAGGCAGTATGAGGCCCGGATTCACGCTCTGGAGAAGGA  2204

Query 2049  ACTGGGCCGTTACATGTGGATAAACCAGGAACTGAAACAGAAGCTCGGCGGTGTGAA-CGCTGTAGGCCACAGC  2121
            |||.||.||..|||||||||||||||||||.|||||.|||||||||.|.|..| ||| |.|||.||||||.|||
Sbjct 2205  ACTAGGTCGACACATGTGGATAAACCAGGAGCTGAAGCAGAAGCTCAGTGCAG-GAAGCACTGCAGGCCAGAGC  2277

Query 2122  AGGGGTGGGGAGAAGAGGAGCCTGTGCTCGGAGGGCAGACA--GGCTCCTGGAAATGAAGATGAGCTCCACCTG  2193
            .|||||.|.||||.|||.|||||.|||..|||...||||||  |.||  ||||||||||||||.||||||.|..
Sbjct 2278  CGGGGTTGTGAGAGGAGAAGCCTCTGCCTGGAAAACAGACAATGCCT--TGGAAATGAAGATGGGCTCCATCCC  2349

Query 2194  GCA---CCCGAGCTTCTCTGGCTGTCCCCCCTCACT-GAGGGGGCCCCCCGCACCCGGGAGGAGACGCGGGACT  2263
            |||   ||.||.|.||||||||.||||.|||| .|| |||||||...||||.....||||.|||.|.|||||||
Sbjct 2350  GCAGCTCCTGAACCTCTCTGGCAGTCCTCCCT-TCTGGAGGGGGTGTCCCGTGTGTGGGATGAGTCCCGGGACT  2422

Query 2264  TGGTCCACGCTCCGTTACCCTTGACCTGGAAACGCTCGAGCCTGTGTGGTGAG-GAGCAGGGGTCCCCCGAGGA  2336
            |||||||.||.||..|||||.||||.|||||||||||.|||.||||    .|| ||||||||.|||.|.|||||
Sbjct 2423  TGGTCCATGCCCCACTACCCCTGACATGGAAACGCTCAAGCTTGTG----CAGCGAGCAGGGCTCCTCTGAGGA  2492

Query 2337  -ACTGAGGCAGCGGGAGGCGGCTGAGCCCCTGGTGGGGCGGGTGCTTCCTGTGGGTGAGGCAGGCCTGCCCTGG  2409
             .|| |||...||||||.|..||||.||||..||.|||||||||||.|||.|||||||.|..|||||..|||||
Sbjct 2493  GTCT-AGGGTCCGGGAGACAACTGAACCCCCAGTAGGGCGGGTGCTACCTATGGGTGAAGTGGGCCTCTCCTGG  2565

Query 2410  AACTTTGGGCCTTTGTCCAAGCCCCGGCGGGAACTGCGACGAGCCAGCCCGGGGATGATTGATGTCCGGAAAAA  2483
            ||||||||.||.|||.|||||||||||.||||||..|||.||.|||||||.||||||||.||.|||.|||||||
Sbjct 2566  AACTTTGGACCCTTGCCCAAGCCCCGGTGGGAACCCCGAAGAACCAGCCCAGGGATGATCGACGTCAGGAAAAA  2639

Query 2484  CCCCCTG  2490
            ||||.||
Sbjct 2640  CCCCTTG  2646