Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13769
- Subject:
- XM_017011299.2
- Aligned Length:
- 1125
- Identities:
- 834
- Gaps:
- 291
Alignment
Query 1 ATGTTGGTGATACCCCCCGGACTGAGCGAGGAAGAGGAGGCTCTGCAGAAGAAATTCAACAAGCTCAAGAAAAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GAAAAAGGCATTGCTGGCTCTGAAGAAGCAAAGTAGCAGCAGCACAACCAGCCAAGGTGGTGTCAAACGCTCAC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TATCAGAGCAGCCTGTCATGGACACAGCCACAGCAACAGAGCAGGCAAAGCAGCTGGTGAAGTCAGGAGCCATC 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------ATGGACACAGCCACAGCAACAGAGCAGGCAAAGCAGCTGGTGAAGTCAGGAGCCATC 57
Query 223 AGTGCCATCAAGGCTGAGACCAAGAACTCAGGCTTCAAGCGTTCTCGAACCCTTGAGGGGAAGTTAAAGGACCC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 58 AGTGCCATCAAGGCTGAGACCAAGAACTCAGGCTTCAAGCGTTCTCGAACCCTTGAGGGGAAGTTAAAGGACCC 131
Query 297 CGAGAAGGGACCAGTCCCCACTTTCCAGCCGTTCCAGAGGAGCATATCTGCTGATGATGACCTGCAAGAGTCAT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 132 CGAGAAGGGACCAGTCCCCACTTTCCAGCCGTTCCAGAGGAGCATATCTGCTGATGATGACCTGCAAGAGTCAT 205
Query 371 CCAGACGTCCCCAGAGGAAATCTCTGTATGAGAGTGATCGACTTCGAGAACTAGGACCAGATGGAGAAGAGGCA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 206 CCAGACGTCCCCAGAGGAAATCTCTGTATGAGAGTGATCGACTTCGAGAACTAGGACCAGATGGAGAAGAGGCA 279
Query 445 GAGGGCCCAGGGGCTGGTGATGGTCCCCCTCGAAGCTTTGACTGGGGCTATGAAGAACGCAGTGGTGCCCACTC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 280 GAGGGCCCAGGGGCTGGTGATGGTCCCCCTCGAAGCTTTGACTGGGGCTATGAAGAACGCAGTGGTGCCCACTC 353
Query 519 CTCAGCCTCCCCTCCCCGAAGCCGCAGCCGGGACCGCAGCCATGAGAGGAACCGGGACA--------------- 577
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 354 CTCAGCCTCCCCTCCCCGAAGCCGCAGCCGGGACCGCAGCCATGAGAGGAACCGGGACAGAGACCGAGATCGGG 427
Query 578 -------------------------------------------------------------------------- 577
Sbjct 428 AGCGGGATCGAGACCGGGATCGAGACAGAGACAGAGAGCGGGACAGGGATCGGGATCGGGATCGAGATCGAGAC 501
Query 578 -------------------------------------GAGACCGAGAGGGTCCTTTCCGCAGGTCGGATTCATT 614
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 502 CGGGAACGGGACAGGGATCGGGAGCGGGATCGAGACCGAGACCGAGAGGGTCCTTTCCGCAGGTCGGATTCATT 575
Query 615 CCCTGAACGGCGAGCCCCTAGGAAAGGGAATACTCTCTATGTATATGGAGAAGACATGACACCCACCCTTCTCC 688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 576 CCCTGAACGGCGAGCCCCTAGGAAAGGGAATACTCTCTATGTATATGGAGAAGACATGACACCCACCCTTCTCC 649
Query 689 GTGGGGCCTTCTCTCCTTTTGGAAACATCATTGACCTCTCCATGGACCCACCCAGAAACTGTGCCTTCGTCACC 762
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 650 GTGGGGCCTTCTCTCCTTTTGGAAACATCATTGACCTCTCCATGGACCCACCCAGAAACTGTGCCTTCGTCACC 723
Query 763 TATGAAAAGATGGAGTCAGCAGATCAGGCCGTTGCTGAGCTCAACGGGACCCAGGTGGAGTCTGTACAGCTCAA 836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 724 TATGAAAAGATGGAGTCAGCAGATCAGGCCGTTGCTGAGCTCAACGGGACCCAGGTGGAGTCTGTACAGCTCAA 797
Query 837 AGTCAACATAGCCCGAAAACAGCCCATGCTGGATGCCGCTACTGGCAAGTCTGTCTGGGGCTCCCTCGCTGTCC 910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 798 AGTCAACATAGCCCGAAAACAGCCCATGCTGGATGCCGCTACTGGCAAGTCTGTCTGGGGCTCCCTCGCTGTCC 871
Query 911 AGAACAGCCCTAAGGGTTGCCACCGGGACAAGAGGACCCAGATTGTCTACAGTGATGACGTCTACAAGGAAAAC 984
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 872 AGAACAGCCCTAAGGGTTGCCACCGGGACAAGAGGACCCAGATTGTCTACAGTGATGACGTCTACAAGGAAAAC 945
Query 985 CTTGTGGATGGCTTC 999
|||||||||||||||
Sbjct 946 CTTGTGGATGGCTTC 960