Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13825
- Subject:
- XM_017021816.1
- Aligned Length:
- 1288
- Identities:
- 1073
- Gaps:
- 212
Alignment
Query 1 ATGGCCAGTGCTTGGGGCACAGTCTTTTTCATGCTGGTGGTATCCTGTGTTTGCAGCGCTGTCTCCCACAGGAA 74
|||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCACTTCTTGGGGCACAGTCTTTTTCATGCTGGTGGTATCCTGTGTTTGCAGCGCTGTCTCCCACAGGAA 74
Query 75 CCAGCAGACTTGGTTTGAGGGTATCTTCCTGTCTTCCATGTGCCCCATCAATGTCAGCGCCAGCACCTTGTATG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCAGCAGACTTGGTTTGAGGGTATCTTCCTGTCTTCCATGTGCCCCATCAATGTCAGCGCCAGCACCTTGTATG 148
Query 149 GAATTATGTTTGATGCAGGGAGCACTGGAACTCGAATTCATGTTTACACCTTTGTGCAGAAAATGCCAGGACAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GAATTATGTTTGATGCAGGGAGCACTGGAACTCGAATTCATGTTTACACCTTTGTGCAGAAAATGCCAGGACAG 222
Query 223 CTTCCAATTCTAGAAGGGGAAGTTTTTGATTCTGTGAAGCCAGGACTTTCTGCTTTTGTAGATCAACCTAAGCA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTTCCAATTCTAGAAGGGGAAGTTTTTGATTCTGTGAAGCCAGGACTTTCTGCTTTTGTAGATCAACCTAAGCA 296
Query 297 GGGTGCTGAGACCGTTCAAGGGCTCTTAGAGGTGGCCAAAGACTCAATCCCCCGAAGTCACTGGAAAAAGACCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGGTGCTGAGACCGTTCAAGGGCTCTTAGAGGTGGCCAAAGACTCAATCCCCCGAAGTCACTGGAAAAAGACCC 370
Query 371 CAGTGGTCCTAAAGGCAACAGCAGGACTACGCTTACTGCCAGAACACAAAGCCAAGGCTCTGCTCTTTGAGGTA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CAGTGGTCCTAAAGGCAACAGCAGGACTACGCTTACTGCCAGAACACAAAGCCAAGGCTCTGCTCTTTGAGGTA 444
Query 445 AAGGAGATCTTCAGGAAGTCACCTTTCCTGGTACCAAAGGGCAGTGTTAGCATCATGGATGGATCCGACGAAGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAGGAGATCTTCAGGAAGTCACCTTTCCTGGTACCAAAGGGCAGTGTTAGCATCATGGATGGATCCGACGAAGG 518
Query 519 CATATTAGCTTGGGTTACTGTGAATTTTCTGACAGGTCAGCTGCATGGCCACAGACAGGAGACTGTGGGGACCT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CATATTAGCTTGGGTTACTGTGAATTTTCTGACAGGTCAGCTGCATGGCCACAGACAGGAGACTGTGGGGACCT 592
Query 593 TGGACCTAGGGGGAGCCTCCACCCAAATCACGTTCCTGCCCCAGTTTGAGAAAACTCTGGAACAAACTCCTAGG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGGACCTAGGGGGAGCCTCCACCCAAATCACGTTCCTGCCCCAGTTTGAGAAAACTCTGGAACAAACTCCTAGG 666
Query 667 GGCTACCTCACTTCCTTTGAGATGTTTAACAGCACTTATAAGCTCTATACACATAGTTACCTGGGATTTGGATT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGCTACCTCACTTCCTTTGAGATGTTTAACAGCACTTATAAGCTCTATACACATAGTTACCTGGGATTTGGATT 740
Query 741 GAAAGCTGCAAGACTAGCAACCCTGGGAGCCCTGGAGACAGAAGGGACTGATGGGCACACTTTCCGGAGTGCCT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GAAAGCTGCAAGACTAGCAACCCTGGGAGCCCTGGAGACAGAAGGGACTGATGGGCACACTTTCCGGAGTGCCT 814
Query 815 GTTTACCGAGATGGTTGGAAGCAGAGTGGATCTTTGGGGGTGTGAAATACCAGTATGGTGGCAACCAAGAAGGG 888
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTTTACCGAGATGGTTGGAAGCAGAGTGGATCTTTGGGGGTGTGAAATACCAGTATGGTGGCAACCAAGAA--- 885
Query 889 GAGGTGGGCTTTGAGCCCTGCTATGCCGAAGTGCTGAGGGTGGTACGAGGAAAACTTCACCAGCCAGAGGAGGT 962
Sbjct 886 -------------------------------------------------------------------------- 885
Query 963 CCAGAGAGGTTCCTTCTATGCTTTCTCTTACTATTATGACCGAGCTGTTGACACAGACATGATTGATTATGAAA 1036
||||||||||
Sbjct 886 ----------------------------------------------------------------GATTATGAAA 895
Query 1037 AGGGGGGTATTTTAAAAGTTGAAGATTTTGAAAGAAAAGCCAGGGAAGTGTGTGATAACTTGGAAAACTTCACC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 896 AGGGGGGTATTTTAAAAGTTGAAGATTTTGAAAGAAAAGCCAGGGAAGTGTGTGATAACTTGGAAAACTTCACC 969
Query 1111 TCAGGCAGTCCTTTCCTGTGCATGGATCTCAGCTACATCACAGCCCTGTTAAAGGATGGCTTTGGCTTTGCAGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 970 TCAGGCAGTCCTTTCCTGTGCATGGATCTCAGCTACATCACAGCCCTGTTAAAGGATGGCTTTGGCTTTGCAGA 1043
Query 1185 CAGCACAGTCTTACAGC---------------ACATCATCA-------GCTGGG--TAAAT------------- 1221
||||||||||||||||| |||.||| | |||||| | |
Sbjct 1044 CAGCACAGTCTTACAGCTCACAAAGAAAGTGAACAACAT-AGAGACGGGCTGGGCCT---TGGGGGCCACCTTT 1113
Query 1222 ------------------------------ 1221
Sbjct 1114 CACCTGTTGCAGTCTCTGGGCATCTCCCAT 1143