Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13825
• Subject: XM_017021817.1
• Aligned Length: 1221
• Identities: 1078
• Gaps: 141

Alignment

Query    1  ATGGCCAGTGCTTGGGGCACAGTCTTTTTCATGCTGGTGGTATCCTGTGTTTGCAGCGCTGTCTCCCACAGGAA  74
            |||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCACTTCTTGGGGCACAGTCTTTTTCATGCTGGTGGTATCCTGTGTTTGCAGCGCTGTCTCCCACAGGAA  74

Query   75  CCAGCAGACTTGGTTTGAGGGTATCTTCCTGTCTTCCATGTGCCCCATCAATGTCAGCGCCAGCACCTTGTATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAGCAGACTTGGTTTGAGGGTATCTTCCTGTCTTCCATGTGCCCCATCAATGTCAGCGCCAGCACCTTGTATG  148

Query  149  GAATTATGTTTGATGCAGGGAGCACTGGAACTCGAATTCATGTTTACACCTTTGTGCAGAAAATGCCAGGACAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAATTATGTTTGATGCAGGGAGCACTGGAACTCGAATTCATGTTTACACCTTTGTGCAGAAAATGCCAGGACAG  222

Query  223  CTTCCAATTCTAGAAGGGGAAGTTTTTGATTCTGTGAAGCCAGGACTTTCTGCTTTTGTAGATCAACCTAAGCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTCCAATTCTAGAAGGGGAAGTTTTTGATTCTGTGAAGCCAGGACTTTCTGCTTTTGTAGATCAACCTAAGCA  296

Query  297  GGGTGCTGAGACCGTTCAAGGGCTCTTAGAGGTGGCCAAAGACTCAATCCCCCGAAGTCACTGGAAAAAGACCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGGTGCTGAGACCGTTCAAGGGCTCTTAGAGGTGGCCAAAGACTCAATCCCCCGAAGTCACTGGAAAAAGACCC  370

Query  371  CAGTGGTCCTAAAGGCAACAGCAGGACTACGCTTACTGCCAGAACACAAAGCCAAGGCTCTGCTCTTTGAGGTA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGTGGTCCTAAAGGCAACAGCAGGACTACGCTTACTGCCAGAACACAAAGCCAAGGCTCTGCTCTTTGAGGTA  444

Query  445  AAGGAGATCTTCAGGAAGTCACCTTTCCTGGTACCAAAGGGCAGTGTTAGCATCATGGATGGATCCGACGAAGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGGAGATCTTCAGGAAGTCACCTTTCCTGGTACCAAAGGGCAGTGTTAGCATCATGGATGGATCCGACGAAGG  518

Query  519  CATATTAGCTTGGGTTACTGTGAATTTTCTGACAGGTCAGCTGCATGGCCACAGACAGGAGACTGTGGGGACCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATATTAGCTTGGGTTACTGTGAATTTTCTGACAGGTCAGCTGCATGGCCACAGACAGGAGACTGTGGGGACCT  592

Query  593  TGGACCTAGGGGGAGCCTCCACCCAAATCACGTTCCTGCCCCAGTTTGAGAAAACTCTGGAACAAACTCCTAGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGACCTAGGGGGAGCCTCCACCCAAATCACGTTCCTGCCCCAGTTTGAGAAAACTCTGGAACAAACTCCTAGG  666

Query  667  GGCTACCTCACTTCCTTTGAGATGTTTAACAGCACTTATAAGCTCTATACACATAGTTACCTGGGATTTGGATT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCTACCTCACTTCCTTTGAGATGTTTAACAGCACTTATAAGCTCTATACACATAGTTACCTGGGATTTGGATT  740

Query  741  GAAAGCTGCAAGACTAGCAACCCTGGGAGCCCTGGAGACAGAAGGGACTGATGGGCACACTTTCCGGAGTGCCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAAGCTGCAAGACTAGCAACCCTGGGAGCCCTGGAGACAGAAGGGACTGATGGGCACACTTTCCGGAGTGCCT  814

Query  815  GTTTACCGAGATGGTTGGAAGCAGAGTGGATCTTTGGGGGTGTGAAATACCAGTATGGTGGCAACCAAGAAGGG  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct  815  GTTTACCGAGATGGTTGGAAGCAGAGTGGATCTTTGGGGGTGTGAAATACCAGTATGGTGGCAACCAAGAA---  885

Query  889  GAGGTGGGCTTTGAGCCCTGCTATGCCGAAGTGCTGAGGGTGGTACGAGGAAAACTTCACCAGCCAGAGGAGGT  962
                                                                                      
Sbjct  886  --------------------------------------------------------------------------  885

Query  963  CCAGAGAGGTTCCTTCTATGCTTTCTCTTACTATTATGACCGAGCTGTTGACACAGACATGATTGATTATGAAA  1036
                                                                            ||||||||||
Sbjct  886  ----------------------------------------------------------------GATTATGAAA  895

Query 1037  AGGGGGGTATTTTAAAAGTTGAAGATTTTGAAAGAAAAGCCAGGGAAGTGTGTGATAACTTGGAAAACTTCACC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  896  AGGGGGGTATTTTAAAAGTTGAAGATTTTGAAAGAAAAGCCAGGGAAGTGTGTGATAACTTGGAAAACTTCACC  969

Query 1111  TCAGGCAGTCCTTTCCTGTGCATGGATCTCAGCTACATCACAGCCCTGTTAAAGGATGGCTTTGGCTTTGCAGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  970  TCAGGCAGTCCTTTCCTGTGCATGGATCTCAGCTACATCACAGCCCTGTTAAAGGATGGCTTTGGCTTTGCAGA  1043

Query 1185  CAGCACAGTCTTACAGCACATCATCAGCTGGGTAAAT  1221
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1044  CAGCACAGTCTTACAGCACATCATCAGCTGGGTAAAT  1080