Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13825
- Subject:
- XR_001750612.1
- Aligned Length:
- 1452
- Identities:
- 993
- Gaps:
- 456
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ACAAAGGTGAATGCGGTTCATGAGGCTCGCTTGATTAAGAAGAGCTGAAACAGGAGCAAAGAGCAAAAGGCAAC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CTGCAGCGAAAGCAAGGACTCAGGGAACCGGCAGACACAAGCAGCCTCTGCAGGTGTGCGAGCAGGATTGCTTC 148
Query 1 ----------------------------------------ATGGCCAGTGCTTGGGGCACAGTCTTTTTCATGC 34
|||||||.|.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGCAACAAAAGCCTCCACCCAGCCACATCTTGGGAAAAGAATGGCCACTTCTTGGGGCACAGTCTTTTTCATGC 222
Query 35 TGGTGGTATCCTGTGTTTGCAGCGCTGTCTCCCACAGGAACCAGCAGACTTGGTTTGAGGGTATCTTCCTGTCT 108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TGGTGGTATCCTGTGTTTGCAGCGCTGTCTCCCACAGGAACCAGCAGACTTGGTTTGAGGGTATCTTCCTGTCT 296
Query 109 TCCATGTGCCCCATCAATGTCAGCGCCAGCACCTTGTATGGAATTATGTTTGATGCAGGGAGCACTGGAACTCG 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCCATGTGCCCCATCAATGTCAGCGCCAGCACCTTGTATGGAATTATGTTTGATGCAGGGAGCACTGGAACTCG 370
Query 183 AATTCATGTTTACACCTTTGTGCAGAAAATGCCAGGACAGCTTCCAATTCTAGAAGGGGAAGTTTTTGATTCTG 256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AATTCATGTTTACACCTTTGTGCAGAAAATGCCAGGACAGCTTCCAATTCTAGAAGGGGAAGTTTTTGATTCTG 444
Query 257 TGAAGCCAGGACTTTCTGCTTTTGTAGATCAACCTAAGCAGGGTGCTGAGACCGTTCAAGGGCTCTTAGAGGTG 330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TGAAGCCAGGACTTTCTGCTTTTGTAGATCAACCTAAGCAGGGTGCTGAGACCGTTCAAGGGCTCTTAGAGGTG 518
Query 331 GCCAAAGACTCAATCCCCCGAAGTCACTGGAAAAAGACCCCAGTGGTCCTAAAGGCAACAGCAGGACTACGCTT 404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCCAAAGACTCAATCCCCCGAAGTCACTGGAAAAAGACCCCAGTGGTCCTAAAGGCAACAGCAGGACTACGCTT 592
Query 405 ACTGCCAGAACACAAAGCCAAGGCTCTGCTCTTTGAGGTAAAGGAGATCTTCAGGAAGTCACCTTTCCTGGTAC 478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACTGCCAGAACACAAAGCCAAGGCTCTGCTCTTTGAGGTAAAGGAGATCTTCAGGAAGTCACCTTTCCTGGTAC 666
Query 479 CAAAGGGCAGTGTTAGCATCATGGATGGATCCGACGAAGGCATATTAGCTTGGGTTACTGTGAATTTTCTGACA 552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAAAGGGCAGTGTTAGCATCATGGATGGATCCGACGAAGGCATATTAGCTTGGGTTACTGTGAATTTTCTGACA 740
Query 553 GGTCAGCTGCATGGCCACAGACAGGAGACTGTGGGGACCTTGGACCTAGGGGGAGCCTCCACCCAAATCACGTT 626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGTCAGCTGCATGGCCACAGACAGGAGACTGTGGGGACCTTGGACCTAGGGGGAGCCTCCACCCAAATCACGTT 814
Query 627 CCTGCCCCAGTTTGAGAAAACTCTGGAACAAACTCCTAGGGGCTACCTCACTTCCTTTGAGATGTTTAACAGCA 700
||||||||||||||
Sbjct 815 CCTGCCCCAGTTTG------------------------------------------------------------ 828
Query 701 CTTATAAGCTCTATACACATAGTTACCTGGGATTTGGATTGAAAGCTGCAAGACTAGCAACCCTGGGAGCCCTG 774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 829 --------------------AGTTACCTGGGATTTGGATTGAAAGCTGCAAGACTAGCAACCCTGGGAGCCCTG 882
Query 775 GAGACAGAAGGGACTGATGGGCACACTTTCCGGAGTGCCTGTTTACCGAGATGGTTGGAAGCAGAGTGGATCTT 848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 883 GAGACAGAAGGGACTGATGGGCACACTTTCCGGAGTGCCTGTTTACCGAGATGGTTGGAAGCAGAGTGGATCTT 956
Query 849 TGGGGGTGTGAAATACCAGTATGGTGGCAACCAAGAAGGGGAGGTGGGCTTTGAGCCCTGCTATGCCGAAGTGC 922
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 957 TGGGGGTGTGAAATACCAGTATGGTGGCAACCAAGAA------------------------------------- 993
Query 923 TGAGGGTGGTACGAGGAAAACTTCACCAGCCAGAGGAGGTCCAGAGAGGTTCCTTCTATGCTTTCTCTTACTAT 996
Sbjct 994 -------------------------------------------------------------------------- 993
Query 997 TATGACCGAGCTGTTGACACAGACATGATTGATTATGAAAAGGGGGGTATTTTAAAAGTTGAAGATTTTGAAAG 1070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 994 ------------------------------GATTATGAAAAGGGGGGTATTTTAAAAGTTGAAGATTTTGAAAG 1037
Query 1071 AAAAGCCAGGGAAGTGTGTGATAACTTGGAAAACTTCACCTCAGGCAGTCCTTTCCTGTGCATGGATCTCAGCT 1144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1038 AAAAGCCAGGGAAGTGTGTGATAACTTGGAAAACTTCACCTCAGGCAGTCCTTTCCTGTGCATGGATCTCAGCT 1111
Query 1145 ACATCACAGCCCTGTTAAAGGATGGCTTTGGCTTTGCAGACAGCACAGTCTTACAGC---------------AC 1203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1112 ACATCACAGCCCTGTTAAAGGATGGCTTTGGCTTTGCAGACAGCACAGTCTTACAGCTCACAAAGAAAGTGAAC 1185
Query 1204 ATCATCA-------GCTGGG--TAAAT------------------- 1221
|.||| | |||||| | |
Sbjct 1186 AACAT-AGAGACGGGCTGGGCCT---TGGGGGCCACCTTTCACCTG 1227