Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13840
• Subject: XM_011526555.3
• Aligned Length: 1255
• Identities: 943
• Gaps: 305

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTCTCTGTGTTTCTGTCTCCTTATCTGTCTATATGTTGACTATCTCTGCCTCTTTCCTCCTTTCTCCCTCCC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TTCCCCATCCCCTGGCCTCTCCCTGTCTCCTTCTCTCCATCTGCCTTCATTTCCAGGGCCTAGGGAAGGTAAGT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CCCAGGGGAGATGGAAAGGAGGGATCAGCGATGTCCTCTCCCACTTTGCCCTCCACACGCCAGCAGCTGCCTTC  222

Query    1  ---ATGGACAGCATAAGCACAGCCATCTTACTCCTGCTCCTGGCTCTCGTCTGTCTGCTCCTGACCCTAAGCTC  71
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACCATGGACAGCATAAGCACAGCCATCTTACTCCTGCTCCTGGCTCTCGTCTGTCTGCTCCTGACCCTAAGCTC  296

Query   72  AAGAGATAAGGGAAAGCTGCCTCCGGGACCCAGACCCCTCTCAATCCTGGGAAACCTGCTGCTGCTTTGCTCCC  145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAGAGATAAGGGAAAGCTGCCTCCGGGACCCAGACCCCTCTCAATCCTGGGAAACCTGCTGCTGCTTTGCTCCC  370

Query  146  AAGACATGCTGACTTCTCTCACTAAGCTGAGCAAGGAGTATGGCTCCATGTACACAGTGCACCTGGGACCCAGG  219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGACATGCTGACTTCTCTCACTAAGCTGAGCAAGGAGTATGGCTCCATGTACACAGTGCACCTGGGACCCAGG  444

Query  220  CGGGTGGTGGTCCTCAGCGGGTACCAAGCTGTGAAGGAGGCCCTGGTGGACCAGGGAGAGGAGTTTAGTGGCCG  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGGGTGGTGGTCCTCAGCGGGTACCAAGCTGTGAAGGAGGCCCTGGTGGACCAGGGAGAGGAGTTTAGTGGCCG  518

Query  294  CGGTGACTACCCTGCCTTTTTCAACTTTACCAAGGGCAATGGCATCGCCTTCTCCAGTGGGGATCGATGGAAGG  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGGTGACTACCCTGCCTTTTTCAACTTTACCAAGGGCAATGGCATCGCCTTCTCCAGTGGGGATCGATGGAAGG  592

Query  368  TCCTGAGACAGTTCTCTATCCAGATTCTACGGAATTTCGGGATGGGGAAGAGAAGCATTGAGGAGCGAATCCTA  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCTGAGACAGTTCTCTATCCAGATTCTACGGAATTTCGGGATGGGGAAGAGAAGCATTGAGGAGCGAATCCTA  666

Query  442  GAGGAGGGCAGCTTCCTGCTGGCGGAGCTGCGGAAAACTGAAGGCGAGCCCTTTGACCCCACGTTTGTGCTGAG  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGGAGGGCAGCTTCCTGCTGGCGGAGCTGCGGAAAACTGAAGGCGAGCCCTTTGACCCCACGTTTGTGCTGAG  740

Query  516  TCGCTCAGTGTCCAACATTATCTGTTCCGTGCTCTTCGGCAGCCGCTTCGACTATGATGATGAGCGTCTGCTCA  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCGCTCAGTGTCCAACATTATCTGTTCCGTGCTCTTCGGCAGCCGCTTCGACTATGATGATGAGCGTCTGCTCA  814

Query  590  CCATTATCCGCCTTATCAATGACAACTTCCAAATCATGAGCAGCCCCTGGGGCGAGTTGTACGACATCTTCCCG  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCATTATCCGCCTTATCAATGACAACTTCCAAATCATGAGCAGCCCCTGGGGCGAGTTGTACGACATCTTCCCG  888

Query  664  AGCCTCCTGGACTGGGTGCCTGGGCCGCACCAACGCATCTTCCAGAACTTCAAGTGCCTGAGAGACCTCATCGC  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGCCTCCTGGACTGGGTGCCTGGGCCGCACCAACGCATCTTCCAGAACTTCAAGTGCCTGAGAGACCTCATCGC  962

Query  738  CCACAGCGTCCACGACCACCAGGCCTCGCTAGACCCCAGATCTCCCCGGGACTTCATCCAGTGCTTCCTCACCA  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCACAGCGTCCACGACCACCAGGCCTCGCTAGACCCCAGATCTCCCCGGGACTTCATCCAGTGCTTCCTCACCA  1036

Query  812  AGATGGCAGAGGAGAAGGAGGACCCACTGAGGCACTTCCACATGGATACCCTGCTGATGACCACACATAACCTG  885
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGATGGCAGAGGAGAAGGAGGACCCACTGAGCCACTTCCACATGGATACCCTGCTGATGACCACACATAACCTG  1110

Query  886  CTCTTTGGCGGCACCAAGACGCCCGC-----GTGCAGGAGGAGA-TCG-------------------------A  928
            |||||||||||||||||||||..|||     ||||..| ||||| |||                         |
Sbjct 1111  CTCTTTGGCGGCACCAAGACGGGCGCCGTCTGTGCCTG-GGAGAGTCGCTGGCGCGCATGGAGCTCTTTCTGTA  1183

Query  929  CCTCGTGGTGGGACGCG------------------CGCGGCTGCCG------GCGC---------------  960
            ||||        || ||                  |||.||.||||      ||||               
Sbjct 1184  CCTC--------AC-CGCCATCCTGCAGAGCTTTTCGCTGCAGCCGCTGGGTGCGCCCGAGGACATCGACC  1245