Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13846
- Subject:
- NM_001346575.1
- Aligned Length:
- 1329
- Identities:
- 992
- Gaps:
- 336
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCGCAGGCAGGTGATGGCGGCGCTGGTCGTATCCGGGGCAGCGGAGCAGGGCGGCCGAGACGGCCCTGGCAG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AGGTCGGGCCCCTCGGGGCCGCGTGGCCAATCAGATCCCCCCTGAGATCCTGAAGAACCCTCAGCTGCAGGCAG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CAATCCGGGTCCTGCCTTCCAACTACAACTTTGAGATCCCCAAGACCATCTGGAGGATCCAACAAGCCCAGGCC 222
Query 1 ------------------ATGCCGGAAGGCCTCCTCCTCTTTGCCTGTACCATTGTGGATATCTTGGAAAGGTT 56
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAGAAGGTGGCCTTGCAAATGCCGGAAGGCCTCCTCCTCTTTGCCTGTACCATTGTGGATATCTTGGAAAGGTT 296
Query 57 CACGGAGGCCGAAGTGATGGTGATGGGTGACGTGACCTACGGGGCTTGCTGTGTGGATGACTTCACAGCGAGGG 130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CACGGAGGCCGAAGTGATGGTGATGGGTGACGTGACCTACGGGGCTTGCTGTGTGGATGACTTCACAGCGAGGG 370
Query 131 CCCTGGGAGCTGACTTCTTGGTGCACTACGGCCACAGTTGCCTGATTCCCATGGACACCTCGGCCCAAGACTTC 204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCCTGGGAGCTGACTTCTTGGTGCACTACGGCCACAGTTGCCTGATTCCCATGGACACCTCGGCCCAAGACTTC 444
Query 205 CGGGTGCTGTACGTCTTTGTGGACATCCGGATAGACACTACACACCTCCTGGACTCTCTCCGCCTCACCTTTCC 278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CGGGTGCTGTACGTCTTTGTGGACATCCGGATAGACACTACACACCTCCTGGACTCTCTCCGCCTCACCTTTCC 518
Query 279 CCCAGCCACTGCCCTTGCCCTGGTCAGCACCATTCAGTTTGTGTCGACCTTGCAGGCAGCCGCCCAGGAGCTGA 352
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCCAGCCACTGCCCTTGCCCT---------------------------------GGCAGCCGCCCAGGAGCTGA 559
Query 353 AAGCCGAGTATCGTGTGAGTGTCCCACAGTGCAAGCCCCTGTCCCCTGGAGAGATCCTGGGCTGCACATCCCCC 426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 560 AAGCCGAGTATCGTGTGAGTGTCCCACAGTGCAAGCCCCTGTCCCCTGGAGAGATCCTGGGCTGCACATCCCCC 633
Query 427 CGACTGTCCAAAGAGGTGGAGGCCGTTGTGTATCTTGGAGATGGCCGCTTCCATCTGGAGTCTGTCATGATTGC 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 634 CGACTGTCCAAAGAGGTGGAGGCCGTTGTGTATCTTGGAGATGGCCGCTTCCATCTGGAGTCTGTCATGATTGC 707
Query 501 CAACCCCAATGTCCCCGCTTACCGGTATGACCCATATAGCAAAGTCCTATCCAGAGAACACTATGACCACCAGC 574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 708 CAACCCCAATGTCCCCGCTTACCGGTATGACCCATATAGCAAAGTCCTATCCAGAGAACACTATGACCACCAGC 781
Query 575 GCATGCAGGCTGCTCGCCAAGAAGCCATAGCCACTGCCCGCTCAGCTAAGTCCTGGGGCCTTATTCTGGGCACT 648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 782 GCATGCAGGCTGCTCGCCAAGAAGCCATAGCCACTGCCCGCTCA------------------------------ 825
Query 649 TTGGGCCGCCAGGGCAGTCCTAAGATCCTGGAGCACCTGGAATCTCGACTCCGAGCCTTGGGCCTTTCCTTTGT 722
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 826 ---------------------------------CACCTGGAATCTCGACTCCGAGCCTTGGGCCTTTCCTTTGT 866
Query 723 GAGGCTGCTGCTCTCTGAGATCTTCCCCAGCAAGCTTAGCCTACTTCCCGAGGTGGATGTGTGGGTGCAGGTGG 796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 867 GAGGCTGCTGCTCTCTGAGATCTTCCCCAGCAAGCTTAGCCTACTTCCTGAGGTGGATGTGTGGGTGCAGGTGG 940
Query 797 CATGTCCACGTCTCTCCATTGACTGGGGCACAGCCTTCCCCAAGCCGCTGCTGACACCCTATGAGGCGGCCGTG 870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 941 CATGTCCACGTCTCTCCATTGACTGGGGCACAGCCTTCCCCAAGCCGCTGCTGACACCCTATGAGGCGGCCGTG 1014
Query 871 GCTCTGAGGGACATTTCCTGGCAGCAGCCCTACCCGATGGACTTCTACGCTGGCAGCTCCTTGGGGCCCTGGAC 944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 GCTCTGAGGGACATTTCCTGGCAGCAGCCCTACCCGATGGACTTCTACGCTGGCAGCTCCTTGGGGCCCTGGAC 1088
Query 945 GGTGAACCACGGCCAGGACCGCCGTCCCCACGCCCCGGGCCGGCCCGCGCGGGGGAAGGTGCAGGAGGGGTCCG 1018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089 GGTGAACCACGGCCAGGACCGCCGTCCCCACGCCCCGGGCCGGCCCGCGCGGGGGAAGGTGCAGGAGGGGTCCG 1162
Query 1019 CGCGTCCCCCTTCGGCCGTGGCTTGCGAGGACTGCAGCTGCAGGGACGAGAAGGTGGCGCCGCTGGCTCCT 1089
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163 CGCGTCCCCCTTCGGCCGTGGCTTGCGAGGACTGCAGCTGCAGGGACGAGAAGGTGGCGCCGCTGGCTCCT 1233