Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13854
• Subject: NM_001323389.2
• Aligned Length: 1215
• Identities: 1102
• Gaps: 112

Alignment

Query    1  AT-GAACGGCTGCAGAAGCAACCACTTACCTCCCCCGGGAGCGTGAGCCCCTCCCGAGATTCCAGTGTGCCTGG  73
            || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAACGGCTGCAGAAGCAACCACTTACCTCCCCCGGGAGCGTGAGCCCCTCCCGAGATTCCAGTGTGCCTGG  74

Query   74  CTCTCCCTCCAGCATCGTGGCCAAGATGGACAATCAGGTGCTGGGCTACAAGGACCTGGCTGCCATCCCCAAGG  147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCTCCCTCCAGCATCGTGGCCAAGATGGACAATCAGGTGCTGGGCTACAAGGACCTGGCTGCCATCCCCAAGG  148

Query  148  ACAAGGCCATCCTGGACATCGAGCGGCCCGACCTCATGATCTACGAGCCTCACTTTACTTATTCCCTCCTGGAA  221
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACAAGGCCATCCTGGACATCGAGCGGCCCGACCTCATGATCTACGAGCCTCACTTCACTTATTCCCTCCTGGAA  222

Query  222  CACGTGGAGCTGCCTCGCAGCCGCGAGCGCTCGCTGTCACCCAAATCCACATCCCCCCCACCATCCCCAGAGGT  295
            ||||||||||||||||||||||||                                             |||||
Sbjct  223  CACGTGGAGCTGCCTCGCAGCCGC---------------------------------------------GAGGT  251

Query  296  GTGGGCGGACAGCCGGTCGCCTGGAATCATCTCTCAGGCCTCGGCCCCCAGAACCACTGGAACCCCCCGGACCA  369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  252  GTGGGCGGACAGCCGGTCGCCTGGAATCATCTCTCAGGCCTCGGCCCCCAGAACCACTGGAACCCCCCGGACCA  325

Query  370  GCCTGCCCCATTTCCACCACCCTGAGACCTCCCGCCCAGATTCCAACATCTACAAGAAGCCTCCCATCTATAAG  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  326  GCCTGCCCCATTTCCACCACCCTGAGACCTCCCGCCCAGATTCCAACATCTACAAGAAGCCTCCCATCTATAAG  399

Query  444  CAGAGAGAGTCCGTGGGAGGCAGCCCTCAGACCAAGCACCTCATCGAGGATCTCATCATCGAGTCATCCAAGTT  517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  400  CAGAGAGAGTCCGTGGGAGGCAGCCCTCAGACCAAGCACCTCATCGAGGATCTCATCATCGAGTCATCCAAGTT  473

Query  518  TCCTGCAGCCCAGCCCCCAGACCCCAACCAGCCAGCCAAAATCGAAACCGACTACTGGCCATGCCCCCCGTCTC  591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  474  TCCTGCAGCCCAGCCCCCAGACCCCAACCAGCCAGCCAAAATCGAAACCGACTACTGGCCATGCCCCCCGTCTC  547

Query  592  TGGCTGTTGTGGAGACAGAATGGAGGAAGCGGAAGGCGTCTCGGAGGGGAGCAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAA  665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  548  TGGCTGTTGTGGAGACAGAATGGAGGAAGCGGAAGGCGTCTCGGAGGGGAGCAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAA  621

Query  666  GATGACGACTCTGGAGAGGAGATGAAGGCTCTCAGGGAGCGTCAGAGAGAGGAACTCAGTAAGGTTACTTCCAA  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  622  GATGACGACTCTGGAGAGGAGATGAAGGCTCTCAGGGAGCGTCAGAGAGAGGAACTCAGTAAGGTTACTTCCAA  695

Query  740  CTTGGGAAAGATGATCTTGAAAGAAGAGATGGAAAAGTCATTGCCGATCCGAAGGAAAACCCGCTCTCTGCCTG  813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  696  CTTGGGAAAGATGATCTTGAAAGAAGAGATGGAAAAGTCATTGCCGATCCGAAGGAAAACCCGCTCTCTGCCTG  769

Query  814  ACCGGACACCCTTCCATACCTCCTTGCACCAGGGAACGTCTAAATCTTCCTCTCTCCCCGCCTATGGCAGGACC  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  770  ACCGGACACCCTTCCATACCTCCTTGCACCAGGGAACGTCTAAATCTTCCTCTCTCCCCGCCTATGGCAGGACC  843

Query  888  ACCCTGAGCCGGCTACAGTCCACAGAGTTCAGCCCATCAGGGAGTGAGACTGGAAGCCCAGGCCTGC-------  954
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct  844  ACCCTGAGCCGGCTACAGTCCACAGAGTTCAGCCCATCAGGGAGTGAGACTGGAAGCCCAGGCCTGCAGAACGG  917

Query  955  -----------------------------------------------------------AGATCTATCCCTATG  969
                                                                       |||||||||||||||
Sbjct  918  AGAGGGCCAGAGGGGGAGGATGGACCGGGGGAACTCCCTGCCCTGTGTGCTGGAGCAGAAGATCTATCCCTATG  991

Query  970  AAATGCTAGTGGTGACCAACAAGGGGCGAACCAAGCTGCCACCGGGGGTGGATCGGATGCGGCTTGAGAGGCAT  1043
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  992  AAATGCTAGTGGTGACCAACAAGGGGCGAACCAAGCTGCCACCGGGGGTGGATCGGATGCGGCTTGAGAGGCAT  1065

Query 1044  CTGTCTGCCGAGGACTTCTCAAGGGTATTTGCCATGTCCCCTGAAGAGTTTGGCAAGCTGGCTCTGTGGAAGCG  1117
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1066  CTGTCTGCCGAGGACTTCTCAAGGGTATTTGCCATGTCCCCTGAAGAGTTTGGCAAGCTGGCTCTGTGGAAGCG  1139

Query 1118  GAATGAGCTCAAGAAGAAGGCCTCTCTCTTC  1148
            |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140  GAATGAGCTCAAGAAGAAGGCCTCTCTCTTC  1170