Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13854
• Subject: XM_006518541.2
• Aligned Length: 1215
• Identities: 960
• Gaps: 142

Alignment

Query    1  AT-GAACGGCTGCAGAAGCAACCACTTACCTCCCCCGGGAGCGTGAGCCCCTCCCGAGATTCCAGTGTGCCTGG  73
            || |||||.||||||||                                                         
Sbjct    1  ATGGAACGTCTGCAGAA---------------------------------------------------------  17

Query   74  CTCTCCCTCCAGCATCGTGGCCAAGATGGACAATCAGGTGCTGGGCTACAAGGACCTGGCTGCCATCCCCAAGG  147
                              |||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct   18  ------------------GGCCAAGATGGACAACCAGGTGTTGGGCTACAAGGATCTGGCTGCCATCCCCAAGG  73

Query  148  ACAAGGCCATCCTGGACATCGAGCGGCCCGACCTCATGATCTACGAGCCTCACTTTACTTATTCCCTCCTGGAA  221
            |||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct   74  ACAAGGCCATCCTGGACATTGAGCGACCTGACCTCATGATCTATGAGCCCCACTTTACCTATTCCCTCCTGGAA  147

Query  222  CACGTGGAGCTGCCTCGCAGCCGCGAGCGCTCGCTGTCACCCAAATCCACATCCCCCCCACCATCCCCAGAGGT  295
            ||.||.||||||||..|.|||||.|||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  148  CATGTAGAGCTGCCCAGAAGCCGGGAGTGCTCACTGTCACCCAAATCCACATCCCCCCCACCGTCTCCAGAGGT  221

Query  296  GTGGGCGGACAGCCGGTCGCCTGGAATCATCTCTCAGGCCTCGGCCCCCAGAACCACTGGAACCCCCCGGACCA  369
            |||||||||.||||||.|.|.||||||||||||||||||.||..||||.||.|||||.||.||||||.||||||
Sbjct  222  GTGGGCGGAGAGCCGGACTCTTGGAATCATCTCTCAGGCTTCAACCCCAAGGACCACAGGGACCCCCAGGACCA  295

Query  370  GCCTGCCCCATTTCCACCACCCTGAGACCTCCCGCCCAGATTCCAACATCTACAAGAAGCCTCCCATCTATAAG  443
            ||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct  296  GCCTGCCCCACTTCCACCACCCTGAGACTACCCGCCCGGATTCCAACATCTACAAGAAGCCACCCATCTACAAA  369

Query  444  CAGAGAGAGTCCGTGGGAGGCAGCCCTCAGACCAAGCACCTCATCGAGGATCTCATCATCGAGTCATCCAAGTT  517
            ||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct  370  CAGAGAGAATCCGTGGGAGGCAGCCCTCAGAGCAAGCACCTCATCGAGGACCTCATCATCGAATCCTCCAAGTT  443

Query  518  TCCTGCAGCCCAGCCCCCAGACCCCAACCAGCCAGCCAAAATCGAAACCGACTACTGGCCATGCCCCCCGTCTC  591
            |||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  444  TCCTGCAGCGCAGCCCCCTGACCCCAACCAGCCAGCCAAGATAGAGACTGACTACTGGCCATGTCCCCCGTCGC  517

Query  592  TGGCTGTTGTGGAGACAGAATGGAGGAAGCGGAAGGCGTCTCGGAGGGGAGCAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAA  665
            ||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|.|||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct  518  TGGCCGTTGTGGAGACAGAATGGAGGAAACGGAAGGCATCTCGAAAGGGGGCAGAGGAAGAGGAGGAAGAGGAA  591

Query  666  GATGACGACTCTGGAGAGGAGATGAAGGCTCTCAGGGAGCGTCAGAGAGAGGAACTCAGTAAGGTTACTTCCAA  739
            ||.||.|||||||.|||||||||.|||||..|||||||.||.||||.||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  592  GACGATGACTCTGAAGAGGAGATTAAGGCCATCAGGGAACGGCAGAAAGAGGAGCTCAGTAAGGTTACTTCCAA  665

Query  740  CTTGGGAAAGATGATCTTGAAAGAAGAGATGGAAAAGTCATTGCCGATCCGAAGGAAAACCCGCTCTCTGCCTG  813
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  666  CTTGGGAAAGATGATCTTGAAAGAAGAGATGGAAAAGTCATTGCCCATCCGGAGGAAAACACGCTCTCTGCCTG  739

Query  814  ACCGGACACCCTTCCATACCTCCTTGCACCAGGGAACGTCTAAATCTTCCTCTCTCCCCGCCTATGGCAGGACC  887
            ||||||||||||||||||||||||||||...||||||.||||||||.||.||.||.||..||||||||||||||
Sbjct  740  ACCGGACACCCTTCCATACCTCCTTGCATTCGGGAACATCTAAATCCTCTTCGCTTCCTTCCTATGGCAGGACC  813

Query  888  ACCCTGAGCCGGCTACAGTCCACAGAGTTCAGCCCATCAGGGAGTGAGACTGGAAGCCCAGGCCTGC-------  954
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||.||||.|||||||||||||       
Sbjct  814  ACCCTGAGCCGGCTACAGTCCACAGAATTCAGCCCATCGGGAAGTGAGGCTGGGAGCCCAGGCCTGCAGAACGG  887

Query  955  -----------------------------------------------------------AGATCTATCCCTATG  969
                                                                       |||||||||||||||
Sbjct  888  AGAGGGCCAGAGGGGGAGGATGGATCGGGGGAACTCCCTGCCCTGTGTGCTGGAGCAGAAGATCTATCCCTATG  961

Query  970  AAATGCTAGTGGTGACCAACAAGGGGCGAACCAAGCTGCCACCGGGGGTGGATCGGATGCGGCTTGAGAGGCAT  1043
            |.|||||.|||||||||||.||||||.||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||.||||||||||||||
Sbjct  962  AGATGCTGGTGGTGACCAATAAGGGGAGAACTAAGCTGCCTCCGGGTGTGGACCGCATGAGGCTTGAGAGGCAT  1035

Query 1044  CTGTCTGCCGAGGACTTCTCAAGGGTATTTGCCATGTCCCCTGAAGAGTTTGGCAAGCTGGCTCTGTGGAAGCG  1117
            .||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1036  TTGTCAGCAGAGGACTTCTCTAGGGTCTTCGCCATGTCTCCCGAGGAGTTTGGCAAGCTGGCCCTGTGGAAGCG  1109

Query 1118  GAATGAGCTCAAGAAGAAGGCCTCTCTCTTC  1148
            |||.||.||.||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1110  GAACGAACTTAAGAAGAAAGCTTCCCTCTTC  1140