Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13863
• Subject: XM_011539720.2
• Aligned Length: 2616
• Identities: 1826
• Gaps: 789

Alignment

Query    1  ATGGTAGCGCTGACGCTGTGGCTTCTCCCCTGGATATGCCAGTGCGTGTCGGTGCGGGCCGACTCCATCATCCA  74
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAGCGCTGACGCTGTGGCTTCTCCCCTGGATATGCCAGTGCGTGTCGGTGCGGGCCGACTCCATCATCCA  74

Query   75  CATCGGTGCCATCTTCGAGGAGAACGCGGCCAAGGACGACAGGGTGTTCCAGTTGGCGGTATCCGACCTGAGCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATCGGTGCCATCTTCGAGGAGAACGCGGCCAAGGACGACAGGGTGTTCCAGTTGGCGGTATCCGACCTGAGCC  148

Query  149  TCAACGATGACATCCTGCAGAGCGAGAAGATCACCTACTCCATCAAGGTCATCGAGGCCAACAACCCATTCCAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCAACGATGACATCCTGCAGAGCGAGAAGATCACCTACTCCATCAAGGTCATCGAGGCCAACAACCCATTCCAG  222

Query  223  GCTGTGCAGGAAGCCTGTGACCTCATGACCCAGGGGATTTTGGCCTTGGTCACGTCCACTGGCTGTGCATCTGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCTGTGCAGGAAGCCTGTGACCTCATGACCCAGGGGATTTTGGCCTTGGTCACGTCCACTGGCTGTGCATCTGC  296

Query  297  CAATGCCCTGCAGTCCCTCACGGATGCCATGCACATCCCACACCTCTTTGTCCAGCGCAACCCGGGAGGGTCGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAATGCCCTGCAGTCCCTCACGGATGCCATGCACATCCCACACCTCTTTGTCCAGCGCAACCCGGGAGGGTCGC  370

Query  371  CACGCACCGCATGCCACCTGAACCCCAGCCCCGATGGTGAGGCCTACACACTGGCTTCGAGACCACCCGTCCGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CACGCACCGCATGCCACCTGAACCCCAGCCCCGATGGTGAGGCCTACACACTGGCTTCGAGACCACCCGTCCGC  444

Query  445  CTCAATGATGTCATGCTCAGGCTGGTGACGGAGCTGCGCTGGCAGAAGTTCGTCATGTTCTACGACAGCGAGTA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTCAATGATGTCATGCTCAGGCTGGTGACGGAGCTGCGCTGGCAGAAGTTCGTCATGTTCTACGACAGCGAGTA  518

Query  519  TGATATCCGTGGGCTTCAAAGCTTTCTGGACCAGGCCTCGCGGCTGGGCCTTGACGTCTCTTTACAAAAGGTGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGATATCCGTGGGCTTCAAAGCTTTCTGGACCAGGCCTCGCGGCTGGGCCTTGACGTCTCTTTACAAAAGGTGG  592

Query  593  ACAAGAACATTAGCCACGTATTCACCAGCCTCTTCACCACGATGAAGACAGAGGAGCTGAATCGCTACCGGGAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAAGAACATTAGCCACGTATTCACCAGCCTCTTCACCACGATGAAGACAGAGGAGCTGAATCGCTACCGGGAC  666

Query  667  ACGCTTCGCCGCGCCATCCTGCTGCTCAGCCCACAGGGAGCCCACTCCTTCATCAACGAGGCCGTGGAGACCAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACGCTTCGCCGCGCCATCCTGCTGCTCAGCCCACAGGGAGCCCACTCCTTCATCAACGAGGCCGTGGAGACCAA  740

Query  741  CCTGGCTTCCAAGGACAGCCACTGGGTCTTTGTGAATGAGGAAATCAGTGACCCGGAGATCCTGGATCTGGTCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTGGCTTCCAAGGACAGCCACTGGGTCTTTGTGAATGAGGAAATCAGTGACCCGGAGATCCTGGATCTGGTCC  814

Query  815  ATAGTGCCCTTGGAAGGATGACCGTGGTCCGGCAAATCTTTCCGTCTGCAAAGGACAATCAGAAATGCACGAGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATAGTGCCCTTGGAAGGATGACCGTGGTCCGGCAAATCTTTCCGTCTGCAAAGGACAATCAGAAATGCACGAGG  888

Query  889  AACAACCACCGCATCTCCTCCCTGCTCTGCGACCCCCAGGAAGGCTACCTCCAGATGCTGCAGATCTCCAACCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AACAACCACCGCATCTCCTCCCTGCTCTGCGACCCCCAGGAAGGCTACCTCCAGATGCTGCAGATCTCCAACCT  962

Query  963  CTATCTGTATGACAGTGTTCTGATGCTGGCCAACGCCTTTCACAGGAAGCTGGAGGACCGGAAGTGGCATAGCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTATCTGTATGACAGTGTTCTGATGCTGGCCAACGCCTTTCACAGGAAGCTGGAGGACCGGAAGTGGCATAGCA  1036

Query 1037  TGGCGAGCCTCAACTGCATACGGAAATCCACTAAGCCATGGAATGGTGGGAGGTCCATGCTGGATACCATCAAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGCGAGCCTCAACTGCATACGGAAATCCACTAAGCCATGGAATGGTGGGAGGTCCATGCTGGATACCATCAAA  1110

Query 1111  AAGGGCCACATCACTGGCCTCACTGGGGTGATGGAGTTTCGGGAGGACAGTTCGAATCCCTATGTCCAGTTTGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGGGCCACATCACTGGCCTCACTGGGGTGATGGAGTTTCGGGAGGACAGTTCGAATCCCTATGTCCAGTTTGA  1184

Query 1185  AATCCTTGGCACTACCTATAGTGAGACTTTTGGCAAAGACATGCGCAAGTTGGCGACATGGGACTCAGAGAAGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AATCCTTGGCACTACCTATAGTGAGACTTTTGGCAAAGACATGCGCAAGTTGGCGACATGGGACTCAGAGAAGG  1258

Query 1259  GCTTGAATGGCAGCTTGCAAGAGAGGCCCATGGGCAGCCGCCTCCAAGGATTGACTCTTAAAGTGGTGACTGTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCTTGAATGGCAGCTTGCAAGAGAGGCCCATGGGCAGCCGCCTCCAAGGATTGACTCTTAAAGTGGTGACTGTC  1332

Query 1333  TTGGAAGAGCCTTTCGTGATGGTGGCTGAGAACATCCTAGGACAGCCCAAGCGCTACAAAGGGTTCTCCATAGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTGGAAGAGCCTTTCGTGATGGTGGCTGAGAACATCCTAGGACAGCCCAAGCGCTACAAAGGGTTCTCCATAGA  1406

Query 1407  TGTCCTGGATGCACTGGCCAAGGCTCTGGGCTTTAAATATGAGATTTACCAAGCCCCTGATGGCAGGTACGGTC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGTCCTGGATGCACTGGCCAAGGCTCTGGGCTTTAAATATGAGATTTACCAAGCCCCTGATGGCAGGTACGGTC  1480

Query 1481  ACCAGCTCCATAACACCTCCTGGAACGGGATGATCGGGGAGCTCATCAGCAAGAGAGCAGACTTGGCCATCTCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACCAGCTCCATAACACCTCCTGGAACGGGATGATCGGGGAGCTCATCAGCAAGAGAGCAGACTTGGCCATCTCT  1554

Query 1555  GCCATCACCATCACCCCAGAGAGGGAGAGCGTTGTGGACTTCAGCAAGCGGTACATGGACTATTCAGTGGGGAT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GCCATCACCATCACCCCAGAGAGGGAGAGCGTTGTGGACTTCAGCAAGCGGTACATGGACTATTCAGTGGGGAT  1628

Query 1629  TCTAATTAAGAAGCCCGAGGAGAAAATCAGCATCTTCTCCCTCTTTGCTCCATTTGATTTCGCTGTGTGGGCCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TCTAATTAAGAAGCCCGAGGAGAAAATCAGCATCTTCTCCCTCTTTGCTCCATTTGATTTCGCTGTGTGGGCCT  1702

Query 1703  GCATTGCAGCAGCCATCCCTGTGGTTGGTGTGCTGATATTTGTGTTGAACAGGATACAGGCTGTGAGGGCTCAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCATTGCAGCAGCCATCCCTGTGGTTGGTGTGCTGATATTTGTGTTGAACAGGATACAGGCTGTGAGGGCTCAG  1776

Query 1777  AGTGCTGCCCAGCCCAGGCCGTCAGCTTCTGCCACTCTGCACAGCGCCATC-----------------------  1827
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
Sbjct 1777  AGTGCTGCCCAGCCCAGGCCGTCAGCTTCTGCCACTCTGCACAGCGCCATCTGGATTGTCTATGGAGCCTTCGT  1850

Query 1828  --------------------------------------------------------------------------  1827
                                                                                      
Sbjct 1851  ACAGCAAGGTGGCGAATCTTCCGTGAACTCCATGGCCATGCGCATCGTGATGGGCAGCTGGTGGCTCTTCACGC  1924

Query 1828  --------------------------------------------------------------------------  1827
                                                                                      
Sbjct 1925  TCATTGTGTGCTCCTCCTACACAGCCAACCTTGCTGCCTTCCTCACAGTGTCCAGGATGGACAACCCCATAAGG  1998

Query 1828  --------------------------------------------------------------------------  1827
                                                                                      
Sbjct 1999  ACTTTCCAGGACCTGTCCAAACAAGTGGAAATGTCTTATGGCACTGTCCGGGATTCTGCTGTATATGAGTACTT  2072

Query 1828  --------------------------------------------------------------------------  1827
                                                                                      
Sbjct 2073  CCGAGCCAAGGGCACCAACCCCCTGGAGCAGGACAGCACGTTTGCTGAACTCTGGCGGACCATCAGCAAGAACG  2146

Query 1828  --------------------------------------------------------------------------  1827
                                                                                      
Sbjct 2147  GAGGGGCTGACAACTGCGTGTCCAGTCCTTCAGAAGGCATCAGGAAGGCAAAGAAGGGGAACTACGCCTTCCTG  2220

Query 1828  --------------------------------------------------------------------------  1827
                                                                                      
Sbjct 2221  TGGGATGTGGCCGTGGTGGAATACGCAGCCCTGACGGATGACGACTGCTCGGTGACTGTCATCGGCAACAGCAT  2294

Query 1828  --------------------------------------------------------------------------  1827
                                                                                      
Sbjct 2295  CAGCAGCAAGGGTTACGGGATTGCCCTGCAGCATGGCAGCCCCTACAGGGACCTCTTCTCCCAGAGGATCCTGG  2368

Query 1828  --------------------------------------------------------------------------  1827
                                                                                      
Sbjct 2369  AGCTGCAGGACACAGGGGACCTGGATGTGCTGAAGCAGAAGTGGTGGCCGCACATGGGCCGCTGTGACCTCACC  2442

Query 1828  --------------------------------------------------------------------------  1827
                                                                                      
Sbjct 2443  AGCCATGCCAGCGCCCAGGCCGACGGCAAATCCCTCAAGCTGCACAGCTTCGCCGGGGTCTTCTGCATCCTGGC  2516

Query 1828  --------------------------------------------------------------------------  1827
                                                                                      
Sbjct 2517  CATTGGCCTGCTCCTGGCCTGCCTGGTGGCTGCCCTGGAGTTGTGGTGGAACAGCAACCGGTGCCACCAGGAGA  2590

Query 1828  --------------------------  1827
                                      
Sbjct 2591  CCCCCAAGGAGAGCAGGACAAAGAAG  2616