Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13880
• Subject: NM_008323.1
• Aligned Length: 1182
• Identities: 1038
• Gaps: 5

Alignment

Query    1  ATGGCGCTTGAAGGTAGCGACCGTCGCCGGCAGCGCCGCGAAGGCGGTGCTCGGGCCAGCCCTTCTCTGCCGTC  74
            ||||||| |||||||.||||..|..||.|||.|.||.||.|||||..|||||..||||.|.||.||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGC-TGAAGGTGGCGATAGCTGCTGGCGGTGCTGCAAAGGCAATGCTCAAGCCAACTCTCCTCTGCCGTC  73

Query   75  CCTGGGAGGTTCTAGGC-GCCCACGAGGTCCCCTCG-AGGAACATCTTTTCAGAACAAACAATTCCTCCGTCCG  146
            |.||||||||||| ||| |||||.|.|| ||||.|| ||||.|||.|..|||.||||||||||||||||.||.|
Sbjct   74  CTTGGGAGGTTCT-GGCTGCCCATGTGG-CCCCCCGAAGGAGCATTTCCTCACAACAAACAATTCCTCCATCTG  145

Query  147  CTAAGTATGGCGGGCGGCACACGGTGACCATGATCCCAGGGGATGGCATCGGGCCAGAGCTCATGCTGCATGTC  220
            ||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.
Sbjct  146  CTAAGTATGGTGGGCGGCATACAGTGACTATGATCCCAGGGGATGGCATCGGCCCAGAGCTCATGTTGCATGTT  219

Query  221  AAGTCCGTCTTCAGGCACGCATGTGTACCAGTGGACTTTGAAGAGGTGCACGTGAGTTCCAATGCTGATGAAGA  294
            |||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||
Sbjct  220  AAGTCTGTATTCAGGCATGCATGTGTGCCGGTGGACTTTGAAGAGGTGCATGTAAGCTCCAACGCTGATGAGGA  293

Query  295  GGACATTCGCAATGCCATCATGGCCATCCGCCGGAACCGCGTGGCCCTGAAGGGCAACATCGAAACCAACCATA  368
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct  294  GGACATCCGCAATGCCATCATGGCCATCCGCCGGAACCGTGTGGCCCTGAAGGGCAACATTGAAACAAATCATA  367

Query  369  ACCTGCCACCGTCGCACAAATCTCGAAACAACATCCTTCGCACCAGCCTGGACCTCTATGCCAACGTCATCCAC  442
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  ACCTGCCACCATCCCACAAATCTCGAAACAACATCCTTCGCACCAGCCTAGACCTCTATGCCAACGTCATCCAC  441

Query  443  TGTAAGAGCCTTCCAGGCGTGGTGACCCGGCACAAGGACATAGACATCCTCATTGTCCGGGAGAACACAGAGGG  516
            |||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct  442  TGTAAGAGCCTGCCAGGAGTGGTGACCCGGCACAAGGACATAGACATCCTCATTGTACGGGAAAACACAGAAGG  515

Query  517  CGAGTACAGCAGCCTGGAGCATGAGAGTGTGGCGGGAGTGGTGGAGAGCCTGAAGATCATCACCAAGGCCAAGT  590
            |||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  516  CGAGTACAGCAGCCTGGAGCATGAGAGCGTAGCAGGAGTGGTGGAGAGCTTGAAGATTATCACCAAAGCCAAGT  589

Query  591  CCCTGCGCATTGCCGAGTATGCCTTCAAGCTGGCGCAGGAGAGCGGGCGCAAGAAAGTGACGGCCGTGCACAAG  664
            |||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  590  CCCTGCGCATTGCTGAATATGCTTTCAAGCTGGCCCAGGAGAGTGGGCGTAAGAAAGTGACGGCTGTGCACAAG  663

Query  665  GCCAACATCATGAAACTGGGCGATGGGCTTTTCCTCCAGTGCTGCAGGGAGGTGGCAGCCCGCTACCCTCAGAT  738
            ||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||.||||||||||||
Sbjct  664  GCCAACATCATGAAACTGGGTGATGGACTCTTCCTCCAGTGCTGCAGGGAAGTAGCAGCCCACTACCCTCAGAT  737

Query  739  CACCTTCGAGAACATGATTGTGGATAACACCACCATGCAGCTGGTGTCCCGGCCCCAGCAGTTTGATGTCATGG  812
            ||||||.||.|.|||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  738  CACCTTTGACAGCATGATTGTAGACAACACAACAATGCAGCTGGTATCCCGGCCTCAGCAGTTTGATGTCATGG  811

Query  813  TGATGCCCAATCTCTATGGCAACATCGTCAACAATGTCTGCGCGGGACTGGTCGGGGGCCCAGGCCTTGTGGCT  886
            |||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  812  TGATGCCTAATCTCTATGGTAACATTGTCAACAACGTCTGTGCAGGGCTAGTTGGAGGCCCAGGCCTTGTGGCT  885

Query  887  GGGGCCAACTATGGCCATGTGTACGCGGTGTTTGAAACAGCTACGAGGAACACCGGCAAGAGTATCGCCAATAA  960
            |||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct  886  GGGGCCAACTATGGCCATGTGTATGCAGTATTCGAGACAGCTACAAGGAACACAGGCAAAAGTATTGCCAATAA  959

Query  961  GAACATCGCCAACCCCACGGCCACCCTGCTGGCCAGCTGCATGATGCTGGACCACCTCAAGCTGCACTCCTATG  1034
            ||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  960  GAACATTGCTAACCCGACTGCCACACTGCTAGCAAGCTGCATGATGCTAGACCACCTCAAGCTCCACTCCTATG  1033

Query 1035  CCACCTCCATCCGTAAGGCTGTCCTGGCATCCATGGACAATGAGAATATGCACACTCCGGACATCGGGGGCCAG  1108
            ||||.||||||||.||.||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||.||.||||||
Sbjct 1034  CCACTTCCATCCGCAAAGCTGTCTTAGCATCCATGGACAATGAAAATATGCATACCCCAGATATTGGAGGCCAG  1107

Query 1109  GGCACAACATCTGAAGCCATCCAGGACGTCATCCGCCACATCCGCGTCATCAACGGCCGGGCCGTGGAGGCC  1180
            |||||.|||||..||||||||||||||.||||.||.||.||||||.||||.||.||.|||||.||||||||.
Sbjct 1108  GGCACCACATCCCAAGCCATCCAGGACATCATTCGTCATATCCGCATCATTAATGGACGGGCTGTGGAGGCT  1179