Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13880
• Subject: NM_174869.3
• Aligned Length: 1191
• Identities: 1118
• Gaps: 62

Alignment

Query    1  ATGGCGCTTGAAGGTAGCGACCGTCGCCGGCAGCGCCGCGAAGGCGGTGCTCGGGCCAGCCCTTCTCTGCCGTC  74
            ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGC-TGAAGGTAGCGACCGTCGCCGGCAGCGCCGCGAAGGCGGTGCTCGGGCCAGCCCTTCTCTGCCGTC  73

Query   75  CCTGGGAGGTTCTAGGCGCCCACGAGGTCCCCTCGAGGAACATCTTTTCAGAACAAACAATTCCTCCGTCCGCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   74  CCTGGGAGGTTCTAGGCGCCCACGAGGTCCCCTCGAGGAACATCTTTTCAGAACAAACAATTCCTCCGTCCGCT  147

Query  149  AAGTATGGCGGGCGGCACACGGTGACCATGATCCCAGGGGATGGCATCGGGCCAGAGCTCATGCTGCATGTCAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  AAGTATGGCGGGCGGCACACGGTGACCATGATCCCAGGGGATGGCATCGGGCCAGAGCTCATGCTGCATGTCAA  221

Query  223  GTCCGTCTTCAGGCACGCATGTGTACCAGTGGACTTTGAAGAGGTGCACGTGAGTTCCAATGCTGATGAAGAGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  GTCCGTCTTCAGGCACGCATGTGTACCAGTGGACTTTGAAGAGGTGCACGTGAGTTCCAATGCTGATGAAGAGG  295

Query  297  ACATTCGCAATGCCATCATGGCCATCCGCCGGAACCGCGTGGCCCTGAAGGGCAACATCGAAACCAACCATAAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  ACATTCGCAATGCCATCATGGCCATCCGCCGGAACCGCGTGGCCCTGAAGGGCAACATCGAAACCAACCATAAC  369

Query  371  CTGCCACCGTCGCACAAATCTCGAAACAACATCCTTCGCACCAGCCTGGACCTCTATGCCAACGTCATCCACTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  CTGCCACCGTCGCACAAATCTCGAAACAACATCCTTCGCACCAGCCTGGACCTCTATGCCAACGTCATCCACTG  443

Query  445  TAAGAGCCTTCCAGGCGTGGTGACCCGGCACAAGGACATAGACATCCTCATTGTCCGGGAGAACACAGAGGGCG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  TAAGAGCCTTCCAGGCGTGGTGACCCGGCACAAGGACATAGACATCCTCATTGTCCGGGAGAACACAGAGGGCG  517

Query  519  AGTACAGCAGCCTGGAGCATGAGAGTGTGGCGGGAGTGGTGGAGAGCCTGAAGATCATCACCAAGGCCAAGTCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  AGTACAGCAGCCTGGAGCATGAGAGTGTGGCGGGAGTGGTGGAGAGCCTGAAGATCATCACCAAGGCCAAGTCC  591

Query  593  CTGCGCATTGCCGAGTATGCCTTCAAGCTGGCGCAGGAGAGCGGGCGCAAGAAAGTGACGGCCGTGCACAAGGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  CTGCGCATTGCCGAGTATGCCTTCAAGCTGGCGCAGGAGAGCGGGCGCAAGAAAGTGACGGCCGTGCACAAGGC  665

Query  667  CAACATCATGAAACTGGGCGATGGGCTTTTCCTCCAGTGCTGCAGGGAGGTGGCAGCCCGCTACCCTCAGATCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  CAACATCATGAAACTGGGCGATGGGCTTTTCCTCCAGTGCTGCAGGGAGGTGGCAGCCCGCTACCCTCAGATCA  739

Query  741  CCTTCGAGAACATGATTGTGGATAACACCACCATGCAGCTGGTGTCCCGGCCCCAGCAGTTTGATGTCATGGTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  CCTTCGAGAACATGATTGTGGATAACACCACCATGCAGCTGGTGTCCCGGCCCCAGCAGTTTGATGTCATGGTG  813

Query  815  ATGCCCAATCTCTATGGCAACATCGTCAACAATGTCTGCGCGGGACTGGTCGGGGGCCCAGGCCTTGTGGCTGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  ATGCCCAATCTCTATGGCAACATCGTCAACAATGTCTGCGCGGGACTGGTCGGGGGCCCAGGCCTTGTGGCTGG  887

Query  889  GGCCAACTATGGCCATGTGTACGCGGTGTTTGAAACAGCTACGAGGAACACCGGCAAGAGTATCGCCAATAAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  GGCCAACTATGGCCATGTGTACGCGGTGTTTGAAACAGCTACGAGGAACACCGGCAAGAGTATCGCCAATAAGA  961

Query  963  ACATCGCCAACCCCACGGCCACCCTGCTGGCCAGCTGCATGATGCTGGACCACCTCAAGCTGCACTCCTATGCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  ACATCGCCAACCCCACGGCCACCCTGCTGGCCAGCTGCATGATGCTGGACCACCTCAAGCTGCACTCCTATGCC  1035

Query 1037  ACCTCCATCCGTAAGGCTGTCCTGGCATCCATGGACAATGAGAATATGCACACTCCGGACATCGGGGGCCAGGG  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|| |...|||   |.|||          
Sbjct 1036  ACCTCCATCCGTAAGGCTGTCCTGGCATCCATGGACAATGAGAATGTG-AGGTTCC---CCTCG----------  1095

Query 1111  CACAACAT---CTGAAGCCATCCAGGACGTCATCCGCCACA---TCCGCGTCATCAACGGCCGGGCCGTGGAGG  1178
              ||.|.|   |||..|||              ||||| ||   |||                  ||.||.| |
Sbjct 1096  --CACCCTACCCTGCTGCC--------------CCGCC-CAGTCTCC------------------CCCTGCA-G  1133

Query 1179  CC-----  1180
            ||     
Sbjct 1134  CCTCCTG  1140