Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13880
• Subject: XM_006527843.3
• Aligned Length: 1182
• Identities: 1027
• Gaps: 17

Alignment

Query    1  ATGGCGCTTGAAGGTAGCGACCGTCGCCGGCAGCGCCGCGAAGGCGGTGCTCGGGCCAGCCCTTCTCTGCCGTC  74
            ||||||| |||||||.||||..|..||.|||.|.||.||.|||||..|||||..||||.|.||.||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGC-TGAAGGTGGCGATAGCTGCTGGCGGTGCTGCAAAGGCAATGCTCAAGCCAACTCTCCTCTGCCGTC  73

Query   75  CCTGGGAGGTTCTAGGC-GCCCACGAGGTCCCCTCG-AGGAACATCTTTTCAGAACAAACAATTCCTCCGTCCG  146
            |.||||||||||| ||| |||||.|.|| ||||.|| ||||.|||.|..|||            |||||.||.|
Sbjct   74  CTTGGGAGGTTCT-GGCTGCCCATGTGG-CCCCCCGAAGGAGCATTTCCTCA------------CCTCCATCTG  133

Query  147  CTAAGTATGGCGGGCGGCACACGGTGACCATGATCCCAGGGGATGGCATCGGGCCAGAGCTCATGCTGCATGTC  220
            ||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.
Sbjct  134  CTAAGTATGGTGGGCGGCATACAGTGACTATGATCCCAGGGGATGGCATCGGCCCAGAGCTCATGTTGCATGTT  207

Query  221  AAGTCCGTCTTCAGGCACGCATGTGTACCAGTGGACTTTGAAGAGGTGCACGTGAGTTCCAATGCTGATGAAGA  294
            |||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||
Sbjct  208  AAGTCTGTATTCAGGCATGCATGTGTGCCGGTGGACTTTGAAGAGGTGCATGTAAGCTCCAACGCTGATGAGGA  281

Query  295  GGACATTCGCAATGCCATCATGGCCATCCGCCGGAACCGCGTGGCCCTGAAGGGCAACATCGAAACCAACCATA  368
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct  282  GGACATCCGCAATGCCATCATGGCCATCCGCCGGAACCGTGTGGCCCTGAAGGGCAACATTGAAACAAATCATA  355

Query  369  ACCTGCCACCGTCGCACAAATCTCGAAACAACATCCTTCGCACCAGCCTGGACCTCTATGCCAACGTCATCCAC  442
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  356  ACCTGCCACCATCCCACAAATCTCGAAACAACATCCTTCGCACCAGCCTAGACCTCTATGCCAACGTCATCCAC  429

Query  443  TGTAAGAGCCTTCCAGGCGTGGTGACCCGGCACAAGGACATAGACATCCTCATTGTCCGGGAGAACACAGAGGG  516
            |||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct  430  TGTAAGAGCCTGCCAGGAGTGGTGACCCGGCACAAGGACATAGACATCCTCATTGTACGGGAAAACACAGAAGG  503

Query  517  CGAGTACAGCAGCCTGGAGCATGAGAGTGTGGCGGGAGTGGTGGAGAGCCTGAAGATCATCACCAAGGCCAAGT  590
            |||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  504  CGAGTACAGCAGCCTGGAGCATGAGAGCGTAGCAGGAGTGGTGGAGAGCTTGAAGATTATCACCAAAGCCAAGT  577

Query  591  CCCTGCGCATTGCCGAGTATGCCTTCAAGCTGGCGCAGGAGAGCGGGCGCAAGAAAGTGACGGCCGTGCACAAG  664
            |||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  578  CCCTGCGCATTGCTGAATATGCTTTCAAGCTGGCCCAGGAGAGTGGGCGTAAGAAAGTGACGGCTGTGCACAAG  651

Query  665  GCCAACATCATGAAACTGGGCGATGGGCTTTTCCTCCAGTGCTGCAGGGAGGTGGCAGCCCGCTACCCTCAGAT  738
            ||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||.||||||||||||
Sbjct  652  GCCAACATCATGAAACTGGGTGATGGACTCTTCCTCCAGTGCTGCAGGGAAGTAGCAGCCCACTACCCTCAGAT  725

Query  739  CACCTTCGAGAACATGATTGTGGATAACACCACCATGCAGCTGGTGTCCCGGCCCCAGCAGTTTGATGTCATGG  812
            ||||||.||.|.|||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  726  CACCTTTGACAGCATGATTGTAGACAACACAACAATGCAGCTGGTATCCCGGCCTCAGCAGTTTGATGTCATGG  799

Query  813  TGATGCCCAATCTCTATGGCAACATCGTCAACAATGTCTGCGCGGGACTGGTCGGGGGCCCAGGCCTTGTGGCT  886
            |||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  800  TGATGCCTAATCTCTATGGTAACATTGTCAACAACGTCTGTGCAGGGCTAGTTGGAGGCCCAGGCCTTGTGGCT  873

Query  887  GGGGCCAACTATGGCCATGTGTACGCGGTGTTTGAAACAGCTACGAGGAACACCGGCAAGAGTATCGCCAATAA  960
            |||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct  874  GGGGCCAACTATGGCCATGTGTATGCAGTATTCGAGACAGCTACAAGGAACACAGGCAAAAGTATTGCCAATAA  947

Query  961  GAACATCGCCAACCCCACGGCCACCCTGCTGGCCAGCTGCATGATGCTGGACCACCTCAAGCTGCACTCCTATG  1034
            ||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  948  GAACATTGCTAACCCGACTGCCACACTGCTAGCAAGCTGCATGATGCTAGACCACCTCAAGCTCCACTCCTATG  1021

Query 1035  CCACCTCCATCCGTAAGGCTGTCCTGGCATCCATGGACAATGAGAATATGCACACTCCGGACATCGGGGGCCAG  1108
            ||||.||||||||.||.||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||.||.||||||
Sbjct 1022  CCACTTCCATCCGCAAAGCTGTCTTAGCATCCATGGACAATGAAAATATGCATACCCCAGATATTGGAGGCCAG  1095

Query 1109  GGCACAACATCTGAAGCCATCCAGGACGTCATCCGCCACATCCGCGTCATCAACGGCCGGGCCGTGGAGGCC  1180
            |||||.|||||..||||||||||||||.||||.||.||.||||||.||||.||.||.|||||.||||||||.
Sbjct 1096  GGCACCACATCCCAAGCCATCCAGGACATCATTCGTCATATCCGCATCATTAATGGACGGGCTGTGGAGGCT  1167