Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13880
• Subject: XM_006527844.1
• Aligned Length: 1180
• Identities: 898
• Gaps: 175

Alignment

Query    1  ATGGCGCTTGAAGGTAGCGACCGTCGCCGGCAGCGCCGCGAAGGCGGTGCTCGGGCCAGCCCTTCTCTGCCGTC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCTGGGAGGTTCTAGGCGCCCACGAGGTCCCCTCGAGGAACATCTTTTCAGAACAAACAATTCCTCCGTCCGCT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AAGTATGGCGGGCGGCACACGGTGACCATGATCCCAGGGGATGGCATCGGGCCAGAGCTCATGCTGCATGTCAA  222
                                       |||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.||
Sbjct    1  ---------------------------ATGATCCCAGGGGATGGCATCGGCCCAGAGCTCATGTTGCATGTTAA  47

Query  223  GTCCGTCTTCAGGCACGCATGTGTACCAGTGGACTTTGAAGAGGTGCACGTGAGTTCCAATGCTGATGAAGAGG  296
            |||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||
Sbjct   48  GTCTGTATTCAGGCATGCATGTGTGCCGGTGGACTTTGAAGAGGTGCATGTAAGCTCCAACGCTGATGAGGAGG  121

Query  297  ACATTCGCAATGCCATCATGGCCATCCGCCGGAACCGCGTGGCCCTGAAGGGCAACATCGAAACCAACCATAAC  370
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct  122  ACATCCGCAATGCCATCATGGCCATCCGCCGGAACCGTGTGGCCCTGAAGGGCAACATTGAAACAAATCATAAC  195

Query  371  CTGCCACCGTCGCACAAATCTCGAAACAACATCCTTCGCACCAGCCTGGACCTCTATGCCAACGTCATCCACTG  444
            ||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  196  CTGCCACCATCCCACAAATCTCGAAACAACATCCTTCGCACCAGCCTAGACCTCTATGCCAACGTCATCCACTG  269

Query  445  TAAGAGCCTTCCAGGCGTGGTGACCCGGCACAAGGACATAGACATCCTCATTGTCCGGGAGAACACAGAGGGCG  518
            |||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct  270  TAAGAGCCTGCCAGGAGTGGTGACCCGGCACAAGGACATAGACATCCTCATTGTACGGGAAAACACAGAAGGCG  343

Query  519  AGTACAGCAGCCTGGAGCATGAGAGTGTGGCGGGAGTGGTGGAGAGCCTGAAGATCATCACCAAGGCCAAGTCC  592
            |||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  344  AGTACAGCAGCCTGGAGCATGAGAGCGTAGCAGGAGTGGTGGAGAGCTTGAAGATTATCACCAAAGCCAAGTCC  417

Query  593  CTGCGCATTGCCGAGTATGCCTTCAAGCTGGCGCAGGAGAGCGGGCGCAAGAAAGTGACGGCCGTGCACAAGGC  666
            |||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  418  CTGCGCATTGCTGAATATGCTTTCAAGCTGGCCCAGGAGAGTGGGCGTAAGAAAGTGACGGCTGTGCACAAGGC  491

Query  667  CAACATCATGAAACTGGGCGATGGGCTTTTCCTCCAGTGCTGCAGGGAGGTGGCAGCCCGCTACCCTCAGATCA  740
            ||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||.||||||||||||||
Sbjct  492  CAACATCATGAAACTGGGTGATGGACTCTTCCTCCAGTGCTGCAGGGAAGTAGCAGCCCACTACCCTCAGATCA  565

Query  741  CCTTCGAGAACATGATTGTGGATAACACCACCATGCAGCTGGTGTCCCGGCCCCAGCAGTTTGATGTCATGGTG  814
            ||||.||.|.|||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  566  CCTTTGACAGCATGATTGTAGACAACACAACAATGCAGCTGGTATCCCGGCCTCAGCAGTTTGATGTCATGGTG  639

Query  815  ATGCCCAATCTCTATGGCAACATCGTCAACAATGTCTGCGCGGGACTGGTCGGGGGCCCAGGCCTTGTGGCTGG  888
            |||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  640  ATGCCTAATCTCTATGGTAACATTGTCAACAACGTCTGTGCAGGGCTAGTTGGAGGCCCAGGCCTTGTGGCTGG  713

Query  889  GGCCAACTATGGCCATGTGTACGCGGTGTTTGAAACAGCTACGAGGAACACCGGCAAGAGTATCGCCAATAAGA  962
            |||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct  714  GGCCAACTATGGCCATGTGTATGCAGTATTCGAGACAGCTACAAGGAACACAGGCAAAAGTATTGCCAATAAGA  787

Query  963  ACATCGCCAACCCCACGGCCACCCTGCTGGCCAGCTGCATGATGCTGGACCACCTCAAGCTGCACTCCTATGCC  1036
            ||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  788  ACATTGCTAACCCGACTGCCACACTGCTAGCAAGCTGCATGATGCTAGACCACCTCAAGCTCCACTCCTATGCC  861

Query 1037  ACCTCCATCCGTAAGGCTGTCCTGGCATCCATGGACAATGAGAATATGCACACTCCGGACATCGGGGGCCAGGG  1110
            ||.||||||||.||.||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||.||.||||||||
Sbjct  862  ACTTCCATCCGCAAAGCTGTCTTAGCATCCATGGACAATGAAAATATGCATACCCCAGATATTGGAGGCCAGGG  935

Query 1111  CACAACATCTGAAGCCATCCAGGACGTCATCCGCCACATCCGCGTCATCAACGGCCGGGCCGTGGAGGCC  1180
            |||.|||||..||||||||||||||.||||.||.||.||||||.||||.||.||.|||||.||||||||.
Sbjct  936  CACCACATCCCAAGCCATCCAGGACATCATTCGTCATATCCGCATCATTAATGGACGGGCTGTGGAGGCT  1005