Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13895
- Subject:
- NM_002343.6
- Aligned Length:
- 2133
- Identities:
- 2128
- Gaps:
- 3
Alignment
Query 1 ATGAAACTTGTCTTCCTCGTCCTGCTGTTCCTCGGGGCCCTCGGACTGTGTCTGGCTGGCCGTAGGAGAAGGAG 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1 ATGAAACTTGTCTTCCTCGTCCTGCTGTTCCTCGGGGCCCTCGGACTGTGTCTGGCTGGCCGTAGG---AGGAG 71
Query 75 TGTTCAGTGGTGCGCCGTATCCCAACCCGAGGCCACAAAATGCTTCCAATGGCAAAGGAATATGAGAAAAGTGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 72 TGTTCAGTGGTGCGCCGTATCCCAACCCGAGGCCACAAAATGCTTCCAATGGCAAAGGAATATGAGAAAAGTGC 145
Query 149 GTGGCCCTCCTGTCAGCTGCATAAAGAGAGACTCCCCCATCCAGTGTATCCAGGCCATTGCGGAAAACAGGGCC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 146 GTGGCCCTCCTGTCAGCTGCATAAAGAGAGACTCCCCCATCCAGTGTATCCAGGCCATTGCGGAAAACAGGGCC 219
Query 223 GATGCTGTGACCCTTGATGGTGGTTTCATATACGAGGCAGGCCTGGCCCCCTACAAACTGCGACCTGTAGCGGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 220 GATGCTGTGACCCTTGATGGTGGTTTCATATACGAGGCAGGCCTGGCCCCCTACAAACTGCGACCTGTAGCGGC 293
Query 297 GGAAGTCTACGGGACCGAAAGACAGCCACGAACTCACTATTATGCCGTGGCTGTGGTGAAGAAGGGCGGCAGCT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 294 GGAAGTCTACGGGACCGAAAGACAGCCACGAACTCACTATTATGCCGTGGCTGTGGTGAAGAAGGGCGGCAGCT 367
Query 371 TTCAGCTGAACGAACTGCAAGGTCTGAAGTCCTGCCACACAGGCCTTCGCAGGACCGCTGGATGGAATGTCCCT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 368 TTCAGCTGAACGAACTGCAAGGTCTGAAGTCCTGCCACACAGGCCTTCGCAGGACCGCTGGATGGAATGTCCCT 441
Query 445 ATAGGGACACTTCGTCCATTCTTGAATTGGACGGGTCCACCTGAGCCCATTGAGGCAGCTGTGGCCAGGTTCTT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 442 ATAGGGACACTTCGTCCATTCTTGAATTGGACGGGTCCACCTGAGCCCATTGAGGCAGCTGTGGCCAGGTTCTT 515
Query 519 CTCAGCCAGCTGTGTTCCCGGTGCAGATAAAGGACAGTTCCCCAACCTGTGTCGCCTGTGTGCGGGGACAGGGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516 CTCAGCCAGCTGTGTTCCCGGTGCAGATAAAGGACAGTTCCCCAACCTGTGTCGCCTGTGTGCGGGGACAGGGG 589
Query 593 AAAACAAATGTGCCTTCTCCTCCCAGGAACCGTACTTCAGCTACTCTGGTGCCTTCAAGTGTCTGAGAGACGGG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 590 AAAACAAATGTGCCTTCTCCTCCCAGGAACCGTACTTCAGCTACTCTGGTGCCTTCAAGTGTCTGAGAGACGGG 663
Query 667 GCTGGAGACGTGGCTTTTATCAGAGAGAGCACAGTGTTTGAGGACCTGTCAGACGAGGCTGAAAGGGACGAGTA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 GCTGGAGACGTGGCTTTTATCAGAGAGAGCACAGTGTTTGAGGACCTGTCAGACGAGGCTGAAAGGGACGAGTA 737
Query 741 TGAGTTACTCTGCCCAGACAACACTCGGAAGCCAGTGGACAAGTTCAAAGACTGCCATCTGGCCCGGGTCCCTT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 738 TGAGTTACTCTGCCCAGACAACACTCGGAAGCCAGTGGACAAGTTCAAAGACTGCCATCTGGCCCGGGTCCCTT 811
Query 815 CTCATGCCGTTGTGGCACGAAGTGTGAATGGCAAGGAGGATGCCATCTGGAATCTTCTCCGCCAGGCACAGGAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 812 CTCATGCCGTTGTGGCACGAAGTGTGAATGGCAAGGAGGATGCCATCTGGAATCTTCTCCGCCAGGCACAGGAA 885
Query 889 AAGTTTGGAAAGGACAAGTCACCGAAATTCCAGCTCTTTGGCTCCCCTAGTGGGCAGAAAGATCTGCTGTTCAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 886 AAGTTTGGAAAGGACAAGTCACCGAAATTCCAGCTCTTTGGCTCCCCTAGTGGGCAGAAAGATCTGCTGTTCAA 959
Query 963 GGACTCTGCCATTGGGTTTTCGAGGGTGCCCCCGAGGATAGATTCTGGGCTGTACCTTGGCTCCGGCTACTTCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 GGACTCTGCCATTGGGTTTTCGAGGGTGCCCCCGAGGATAGATTCTGGGCTGTACCTTGGCTCCGGCTACTTCA 1033
Query 1037 CTGCCATCCAGAACTTGAGGAAAAGTGAGGAGGAAGTGGCTGCCCGGCGTGCGCGGGTCGTGTGGTGTGCGGTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034 CTGCCATCCAGAACTTGAGGAAAAGTGAGGAGGAAGTGGCTGCCCGGCGTGCGCGGGTCGTGTGGTGTGCGGTG 1107
Query 1111 GGCGAGCAGGAGCTGCGCAAGTGTAACCAGTGGAGTGGCTTGAGCGAAGGCAGCGTGACCTGCTCCTCGGCCTC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108 GGCGAGCAGGAGCTGCGCAAGTGTAACCAGTGGAGTGGCTTGAGCGAAGGCAGCGTGACCTGCTCCTCGGCCTC 1181
Query 1185 CACCACAGAGGACTGCATCGCCCTGGTGCTGAAAGGAGAAGCTGATGCCATGAGTTTGGATGGAGGATATGTGT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182 CACCACAGAGGACTGCATCGCCCTGGTGCTGAAAGGAGAAGCTGATGCCATGAGTTTGGATGGAGGATATGTGT 1255
Query 1259 ACACTGCAGGCAAATGTGGTTTGGTGCCTGTCCTGGCAGAGAACTACAAATCCCAACAAAGCAGTGACCCTGAT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256 ACACTGCAGGCAAATGTGGTTTGGTGCCTGTCCTGGCAGAGAACTACAAATCCCAACAAAGCAGTGACCCTGAT 1329
Query 1333 CCTAACTGTGTGGATAGACCTGTGGAAGGATATCTTGCTGTGGCGGTGGTTAGGAGATCAGACACTAGCCTTAC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330 CCTAACTGTGTGGATAGACCTGTGGAAGGATATCTTGCTGTGGCGGTGGTTAGGAGATCAGACACTAGCCTTAC 1403
Query 1407 CTGGAACTCTGTGAAAGGCAAGAAGTCCTGCCACACCGCCGTGGACAGGACTGCAGGCTGGAATATCCCCATGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404 CTGGAACTCTGTGAAAGGCAAGAAGTCCTGCCACACCGCCGTGGACAGGACTGCAGGCTGGAATATCCCCATGG 1477
Query 1481 GCCTGCTCTTCAACCAGACGGGCTCCTGCAAATTTGATGAATATTTCAGTCAAAGCTGTGCCCCTGGGTCTGAC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478 GCCTGCTCTTCAACCAGACGGGCTCCTGCAAATTTGATGAATATTTCAGTCAAAGCTGTGCCCCTGGGTCTGAC 1551
Query 1555 CCGAGATCTAATCTCTGTGCTCTGTGTATTGGCGACGAGCAGGGTGAGAATAAGTGCGAGCCCAACAGCAACGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1552 CCGAGATCTAATCTCTGTGCTCTGTGTATTGGCGACGAGCAGGGTGAGAATAAGTGCGTGCCCAACAGCAACGA 1625
Query 1629 GAGATACTACGGCTACACTGGGGCTTTCCGGTGCCTGGCTGAGAATGCTGGAGACGTTGCATTTGTGAAAGATG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 GAGATACTACGGCTACACTGGGGCTTTCCGGTGCCTGGCTGAGAATGCTGGAGACGTTGCATTTGTGAAAGATG 1699
Query 1703 TCACTGTCTTGCAGAACACTGATGGAAATAACAATGAGGCATGGGCTAAGGATTTGAAGCTGGCAGACTTTGCG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700 TCACTGTCTTGCAGAACACTGATGGAAATAACAATGAGGCATGGGCTAAGGATTTGAAGCTGGCAGACTTTGCG 1773
Query 1777 CTGCTGTGCCTCGATGGCAAACGGAAGCCTGTGACTGAGGCTAGAAGCTGCCATCTTGCCATGGCCCCGAATCA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 CTGCTGTGCCTCGATGGCAAACGGAAGCCTGTGACTGAGGCTAGAAGCTGCCATCTTGCCATGGCCCCGAATCA 1847
Query 1851 TGCCGTGGTGTCTCGGATGGATAAGGTGGAACGCCTGAAACAGGTGCTGCTCCACCAACAGGCTAAATTTGGGA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 TGCCGTGGTGTCTCGGATGGATAAGGTGGAACGCCTGAAACAGGTGTTGCTCCACCAACAGGCTAAATTTGGGA 1921
Query 1925 GAAATGGATCTGACTGCCCGGACAAGTTTTGCTTATTCCAGTCTGAAACCAAAAACCTTCTGTTCAATGACAAC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922 GAAATGGATCTGACTGCCCGGACAAGTTTTGCTTATTCCAGTCTGAAACCAAAAACCTTCTGTTCAATGACAAC 1995
Query 1999 ACTGAGTGTCTGGCCAGACTCCATGGCAAAACAACATATGAAAAATATTTGGGACCACAGTATGTCGCAGGCAT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996 ACTGAGTGTCTGGCCAGACTCCATGGCAAAACAACATATGAAAAATATTTGGGACCACAGTATGTCGCAGGCAT 2069
Query 2073 TACTAATCTGAAAAAGTGCTCAACCTCCCCCCTCCTGGAAGCCTGTGAATTCCTCAGGAAG 2133
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070 TACTAATCTGAAAAAGTGCTCAACCTCCCCCCTCCTGGAAGCCTGTGAATTCCTCAGGAAG 2130