Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13896
- Subject:
- NM_029705.3
- Aligned Length:
- 1113
- Identities:
- 935
- Gaps:
- 51
Alignment
Query 1 ATGGAGTCCATCTTCCACGAGAAACAAGAAGGCTCACTTTGTGCTCAACATTGCCTGAATAACTTATTGCAAGG 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGTCCATCTTCCACGAGAAACAAGAAGGCTCACTTTGTGCTCAGCATTGCCTGAATAACCTATTGCAAGG 74
Query 75 AGAATATTTTAGCCCCGTGGAATTATCCTCAATTGCACATCAGCTGGATGAGGAGGAGAGGATGAGAATGGCAG 148
|||.|||||||||||.|||||..||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||||||||||
Sbjct 75 AGAGTATTTTAGCCCTGTGGAGCTATCCTCAATTGCACACCAGCTGGATGAAGAGGAGAGGCTGAGAATGGCAG 148
Query 149 AAGGAGGAGTTACTAGTGAAGATTATCGCACGTTTTTACAGCAGCCTTCTGGAAATATGGATGACAGTGGTTTT 222
||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 149 AAGGGGGAGTCACTAGTGAAGACTACCGCACATTTTTACAGCAGCCTTCTGGAAATATGGATGACAGCGGCTTT 222
Query 223 TTCTCTATTCAGGTTATAAGCAATGCCTTGAAAGTTTGGGGTTTAGAACTAATCCTGTTCAACAGTCCAGAGTA 296
|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTCTCTATTCAAGTTATAAGCAATGCTTTGAAAGTTTGGGGTTTAGAACTAATCCTGTTCAACAGTCCAGAGTA 296
Query 297 TCAGAGGCTCAGGATCGATCCTATAAATGAAAGATCATTTATATGCAATTATAAGGAACACTGGTTTACAGTTA 370
.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCAGAGGCTCAGAATTGATCCTATAAACGAAAGATCCTTTATATGCAATTATAAAGAACACTGGTTTACAGTTA 370
Query 371 GAAAATTAGGAAAACAGTGGTTTAACTTGAATTCTCTCTTGACGGGTCCAGAATTAATATCAGATACATATCTT 444
||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 371 GAAAATTAGGCAAGCAGTGGTTTAACTTGAATTCTCTGTTGACGGGTCCAGAATTAATATCAGATACATACCTC 444
Query 445 GCACTTTTCTTGGCTCAATTACAACAGGAAGGTTATTCTATATTTGTCGTTAAGGGTGATCTGCCAGATTGCGA 518
|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 445 GCACTATTCTTGGCTCAATTACAGCAAGAAGGTTATTCTATATTTGTTGTTAAGGGTGATCTGCCAGATTGTGA 518
Query 519 AGCTGACCAACTCCTGCAGATGATTAGGGTCCAACAGATGCATCGACCAAAACTTATTGGAGAAGAATTAGCAC 592
||||||||||||..||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||||
Sbjct 519 AGCTGACCAACTTTTGCAGATGATCAAGGTCCAACAGATGCATCGACCAAAACTTATTGGAGAGGAACTTGCAC 592
Query 593 AACTAAAAGAGCAAAGAGTCCATAAAACAGACCTGGAACGAGTGTTAGAAGCAAATGATGGCTCAGGAATGTTA 666
|.||.||||||||.||.|.||..|||.||||||||||.||.||.|||||||||..||||||.||.||.||.||.
Sbjct 593 ATCTGAAAGAGCAGAGTGCCCTCAAAGCAGACCTGGAGCGCGTCTTAGAAGCAGCTGATGGGTCGGGCATATTT 666
Query 667 GACGAAGATGAGGAGGATTTGCAGAGGGCTCTGGCACTAAGTCGCCAAGAAATTGACATGGAAGATGAGGAAGC 740
||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||..||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 667 GATGAAGATGAGGATGATTTACAGAGGGCTCTAGCCATAAGTCGCCAGGAAATCGACATGGAGGATGAAGAAGC 740
Query 741 AGATCTCCGCAGGGCTATTCAGCTAAGTATGCAAGGTAGTTCCAGAAACATATCTCAAGATATGACACAGACAT 814
.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||..||.|.|.||.|||...|||||||||
Sbjct 741 TGATCTCCGCAGGGCCATTCAGCTCAGTATGCAAGGTAGTTCCAGAAGTATGTGTGAAAATAGTCCACAGACAT 814
Query 815 CAGGTACAAATCTTACTTCAGAAGAGCTTCGGAAGAGACGAGAAGCCTACTTTGAAAAACAGCAGCAAAAGCAG 888
||.||.||.||||..|||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CAAGTCCAGATCTCTCTTCAGAAGAGCTGCGGAGGAGACGAGAAGCCTACTTTGAAA----------------- 871
Query 889 CAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGGGGACCTATCAGGACAGAG 962
||||.|||||||||||||||.|||..||||.|.|.||||....
Sbjct 872 -------------------------------AGCAACAGCAGCAGCAGCAGGAGGTAGACCGACCTGGACCCCT 914
Query 963 TTCACATCCATGTGAAAGGCCAGCCACCAGTTCAGGAGCACTTGGGAGTGATC---TAGGTGATGCTATGAGTG 1033
||||.|||||.|||||||.||..||||.||||||||||.||.|.||||.||.| .|||.||.|||.||||||
Sbjct 915 TTCATATCCACGTGAAAGACCGACCACAAGTTCAGGAGGACGTAGGAGCGACCAAGGAGGCGACGCTGTGAGTG 988
Query 1034 AAGAAGACATGCTTCAGGCAGCTGTGACCATGTCTTTAGAAACTGTCAGAAATGATTAGAAAACAAAAGGAAAA 1107
||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|.|.|..|.|.||||.||.||.|||||
Sbjct 989 AAGAGGACATGCTTCGGGCAGCTGTGACCATGTCTTTAGAAACTGCTAAAGACAACTTGAAAGCAGAAAGAAAA 1062
Query 1108 AAA 1110
|||
Sbjct 1063 AAA 1065