Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13930
• Subject: NM_002780.5
• Aligned Length: 1284
• Identities: 909
• Gaps: 307

Alignment

Query    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACAGAGCACATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||..|||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGGTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCAAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
            ||||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAATCCGCCCACAACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATCAGGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.|...||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTGCTGGCTACATTTGGTACAAAGGGCAAATGACATAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAATAATTATATATGGGCCTGCATATAGTGGACGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||.||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAAGAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA  296

Query  297  AACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370
            ||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAGAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACGCAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA  370

Query  371  TCATAAAGCGAGGTGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGATATTTCACCTTCACCTTATACCTGGAGACTCCCAAG  444
            |||||||||||.|.|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  371  TCATAAAGCGACGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGACATTTCACCTTCACCTTACACCTGGAGACTCCCAAG  444

Query  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAAACTGTGATCTTAACCTGTGATCCTGAGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGATCTTAACCTGTGATCCTGCGAC  518

Query  519  TCCGGACACAAGCTACCAGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGGTTTCAGCTGTCCGAAA  592
            |||.|.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||
Sbjct  519  TCCAGCCGCAAGCTACCAGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA  592

Query  593  CCAACAGGACCCTCTTTCTATTTGGTGTCACAAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACTCA  666
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  593  CCAACAGGACCCTCTTTATATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666

Query  667  GGGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCC-------------------------------  709
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCAAAGCTGTCCAAGCCCTACATCACAATCAA  740

Query  710  --------------------------------------------------------------------------  709
                                                                                      
Sbjct  741  CAACTTAAACCCCAGAGAGAATAAGGATGTCTTAACCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTAAGAACTACACCTACA  814

Query  710  --------------------------------------------------------------------------  709
                                                                                      
Sbjct  815  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCTGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  888

Query  710  --------------------------------------------------------------------------  709
                                                                                      
Sbjct  889  CTACCCAATGTCACGAGAAATGAAACAGGACCTTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  962

Query  710  --------------------------ATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTCACCCTTCATACACCAATTACCGTT  757
                                      |||||||||||||||||||.|||.|||||||||.||||.|||||||||
Sbjct  963  TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1036

Query  758  CAGGAGATAACCTCTACTTGTCTTGCTTCGCGAACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGGG  831
            |||||||.||||||||||||||.||||||||..|.||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCCGAGTCTAACCCACGGGCACAATATTCTTGGACAATTAATGGG  1110

Query  832  AAGTTTCAGCAATCAGGACAAAATCTGTTTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGTTTGCTC  905
            ||||||||||.||||||||||||.||.|.||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||.||||||
Sbjct 1111  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATAACTACAAAGCATAGTGGGCTCTATGCTTGCTC  1184

Query  906  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCGAGGAAAGCTCCACGTCGTTGACAGTCAAAGTCTCTG-CTTCTACAAGAATA  978
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||..||..|.|||||||||||||||| ||       |.|||
Sbjct 1185  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATCACAGTCAAAGTCTCTGACT-------GGATA  1251

Query  979  GGACTTCTTCCTCTCCTTATCCAACA  1004
                            |||.||    
Sbjct 1252  ----------------TTACCC----  1257