Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13930
• Subject: XM_017027007.2
• Aligned Length: 1318
• Identities: 912
• Gaps: 324

Alignment

Query    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACAGAGCACATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            ||||||||||||.||||||||.||||||||.|||.|||||..||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCCCAGCCCCTTCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCAAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
            ||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAACCCGCCCACCACTGCCGAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATCAGGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||.|.||||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTCCTGGCTACTTCTGGTACAAAGGGGAAATGACGGAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAATAATTATATATGGGCCTGCATATAGTGGACGAGA  296
            ||||||||||||||||.|||.|||.||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||||||.||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTATATCGTATATAGTTGATGGTAAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA  296

Query  297  AACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370
            |||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.|||||||||||||||
Sbjct  297  AACAGTATATTCCAACGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGAAGGATGCAGGAACCTACACCTTACACA  370

Query  371  TCATAAAGCGAGGTGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGATATTTCACCTTCACCTTATACCTGGAGACTCCCAAG  444
            ||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  371  TCATAAAGCGAGGTGATGAGACTAGAGAAGAAATTCGACATTTCACCTTCACCTTATACTTGGAGACTCCCAAG  444

Query  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAAACTGTGATCTTAACCTGTGATCCTGAGAC  518
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||..|||||.|||||||||||||||
Sbjct  445  CCCTACATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGAC  518

Query  519  TCCGGACACAAGCTACCAGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGGTTTCAGCTGTCCGAAA  592
            ||.||||.|||||||||..|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||.|||
Sbjct  519  TCTGGACGCAAGCTACCTATGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTGTGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA  592

Query  593  CCAACAGGACCCTCTTTCTATTTGGTGTCACAAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACTCA  666
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  593  CCAACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666

Query  667  GGGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCC-------------------------------  709
            |.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct  667  GTGAGTGCCAGTCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCATCCCCTACATCACCATCAA  740

Query  710  --------------------------------------------------------------------------  709
                                                                                      
Sbjct  741  CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814

Query  710  --------------------------------------------------------------------------  709
                                                                                      
Sbjct  815  TTTGGTGGCTAAACGGTCAGAGCCTCCCCGTCAGTCCCGGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATACTCATT  888

Query  710  --------------------------------------------------------------------------  709
                                                                                      
Sbjct  889  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCCTCCGCAG  962

Query  710  --------------------------ATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTCACCCTTCATACACCAATTACCGTT  757
                                      |||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||.|||||||||
Sbjct  963  TAACCCAGTCATCCTAAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1036

Query  758  CAGGAGATAACCTCTACTTGTCTTGCTTCGCGAACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGGG  831
            |||||||.||||||.|||||||.||||||.||.|.|||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTCACGGAATCTAACCCACCGGCAGAGTATTTTTGGACAATTAATGGG  1110

Query  832  AAGTTTCAGCAATCAGGACAAAATCTGTTTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGTTTGCTC  905
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1111  AAGTTTCAGCAATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTAGAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC  1184

Query  906  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCGAGGAAAGCTCCACGTCGTTGACAGTCAAAGTCTCTGCTTCTACA-AGAAT-  977
            |||||.||||||||||||||||.||||||.|||||..||..||||||||||||||||||     |.| ||.|| 
Sbjct 1185  TGTTCATAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGACAGTCAAAGTCTCTG-----AGACAGCATC  1253

Query  978  -----AGGACTTCTT-CCTCTCCTTATCC-AACA--------------------------  1004
                 |||     || |||.|.||..||| ||||                          
Sbjct 1254  TCCCCAGG-----TTACCTATGCTGGTCCAAACACCTGGTCTCAAGAAATCCTTCTGCTG  1308