Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13957
- Subject:
- NM_000578.4
- Aligned Length:
- 1658
- Identities:
- 1280
- Gaps:
- 370
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGACAGGTGACAAGGGTCCCCAAAGGCTAAGCGGGTCCAGCTATGGTTCCATCTCCAGCCCGACCAGCCCGAC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CAGCCCAGGGCCACAGCAAGCACCTCCCAGAGAGACCTACCTGAGTGAGAAGATCCCCATCCCAGACACAAAAC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CGGGCACCTTCAGCCTGCGGAAGCTATGGGCCTTCACGGGGCCTGGCTTCCTCATGAGCATTGCTTTCCTGGAC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CCAGGAAACATCGAGTCAGATCTTCAGGCTGGCGCCGTGGCGGGATTCAAACTTCTCTGGGTGCTGCTCTGGGC 296
Query 1 ----------------------------------------------------------------ATGGTGCGAT 10
.||| ||||.
Sbjct 297 CACCGTGTTGGGCTTGCTCTGCCAGCGACTGGCTGCACGTCTGGGCGTGGTGACAGGCAAGGACTTGG-GCGAG 369
Query 11 GTCAGCTCACTGCAACCTCTACCTCCC--AGGTGCCCCGCACCGTCCTCTGGCTGACCATCGAGCTAGCCATTG 82
|| ||||.|.||||||..||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 GT-------CTGCCATCTCTACTACCCTAAGGTGCCCCGCACCGTCCTCTGGCTGACCATCGAGCTAGCCATTG 436
Query 83 TGGGCTCCGACATGCAGGAAGTCATCGGCACGGCCATTGCATTCAATCTGCTCTCAGCTGGACGAATCCCACTC 156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 437 TGGGCTCCGACATGCAGGAAGTCATCGGCACGGCCATTGCATTCAATCTGCTCTCAGCTGGACGAATCCCACTC 510
Query 157 TGGGGTGGCGTCCTCATCACCATCGTGGACACCTTCTTCTTCCTCTTCCTCGATAACTACGGGCTGCGGAAGCT 230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 511 TGGGGTGGCGTCCTCATCACCATCGTGGACACCTTCTTCTTCCTCTTCCTCGATAACTACGGGCTGCGGAAGCT 584
Query 231 GGAAGCTTTTTTTGGACTCCTTATAACCATTATGGCCTTGACCTTTGGCTATGAGTATGTGGTGGCGCGTCCTG 304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 585 GGAAGCTTTTTTTGGACTCCTTATAACCATTATGGCCTTGACCTTTGGCTATGAGTATGTGGTGGCGCGTCCTG 658
Query 305 AGCAGGGAGCGCTTCTTCGGGGCCTGTTCCTGCCCTCGTGCCCGGGCTGCGGCCACCCCGAGCTGCTGCAGGCG 378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 AGCAGGGAGCGCTTCTTCGGGGCCTGTTCCTGCCCTCGTGCCCGGGCTGCGGCCACCCCGAGCTGCTGCAGGCG 732
Query 379 GTGGGCATTGTTGGCGCCATCATCATGCCCCACAACATCTACCTGCACTCGGCCCTGGTCAAGTCTCGAGAGAT 452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 733 GTGGGCATTGTTGGCGCCATCATCATGCCCCACAACATCTACCTGCACTCGGCCCTGGTCAAGTCTCGAGAGAT 806
Query 453 AGACCGGGCCCGCCGAGCGGACATCAGAGAAGCCAACATGTACTTCCTGATTGAGGCCACCATCGCCCTGTCCG 526
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 807 AGACCGGGCCCGCCGAGCAGACATCAGAGAAGCCAACATGTACTTCCTGATTGAGGCCACCATCGCCCTGTCCG 880
Query 527 TCTCCTTTATCATCAACCTCTTTGTCATGGCTGTCTTTGGGCAGGCCTTCTACCAGAAAACCAACCAGGCTGCG 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 881 TCTCCTTTATCATCAACCTCTTTGTCATGGCTGTCTTTGGGCAGGCCTTCTACCAGAAAACCAACCAGGCTGCG 954
Query 601 TTCAACATCTGTGCCAACAGCAGCCTCCACGACTACGCCAAGATCTTCCCCATGAACAACGCCACCGTGGCCGT 674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 TTCAACATCTGTGCCAACAGCAGCCTCCACGACTACGCCAAGATCTTCCCCATGAACAACGCCACCGTGGCCGT 1028
Query 675 GGACATTTACCAGGGGGGCGTGATCCTGGGCTGCCTGTTCGGCCCCGCGGCCCTCTACATCTGGGCCATAGGTC 748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029 GGACATTTACCAGGGGGGCGTGATCCTGGGCTGCCTGTTCGGCCCCGCGGCCCTCTACATCTGGGCCATAGGTC 1102
Query 749 TCCTGGCGGCTGGGCAGAGCTCCACCATGACGGGCACCTACGCGGGACAGTTCGTGATGGAGGGCTTCCTGAGG 822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1103 TCCTGGCGGCTGGGCAGAGCTCCACCATGACGGGCACCTACGCGGGACAGTTCGTGATGGAGGGCTTCCTGAGG 1176
Query 823 CTGCGGTGGTCACGCTTCGCCCGTGTCCTCCTCACCCGCTCCTGCGCCATCCTGCCCACCGTGCTCGTGGCTGT 896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1177 CTGCGGTGGTCACGCTTCGCCCGTGTCCTCCTCACCCGCTCCTGCGCCATCCTGCCCACCGTGCTCGTGGCTGT 1250
Query 897 CTTCCGGGACCTGAGGGACTTGTCGGGCCTCAATGATCTGCTCAACGTGCTGCAGAGCCTGCTGCTCCCGTTCG 970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251 CTTCCGGGACCTGAGGGACTTGTCGGGCCTCAATGATCTGCTCAACGTGCTGCAGAGCCTGCTGCTCCCGTTCG 1324
Query 971 CCGTGCTGCCCATCCTCACGTTCACCAGCATGCCCACCCTCATGCAGGAGTTTGCCAATGGCCTGCTGAACAAG 1044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325 CCGTGCTGCCCATCCTCACGTTCACCAGCATGCCCACCCTCATGCAGGAGTTTGCCAATGGCCTGCTGAACAAG 1398
Query 1045 GTCGTCACCTCTTCCATCATGGTGCTAGTCTGCGCCATCAACCTCTACTTCGTGGTCAGCTATCTGCCCAGCCT 1118
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1399 GTCGTCACCTCTTCCATCATGGTGCTAGTCTGCGCCATCAACCTCTACTTCGTGGTCAGCTATCTGCCCAGCCT 1472
Query 1119 GCCCCACCCTGCCTACTTCGGCCTTGCAGCCTTGCTGGCCGCAGCCTACCCGGGCCTCAGCACCTACCTGGTCT 1192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1473 GCCCCACCCTGCCTACTTCGGCCTTGCAGCCTTGCTGGCCGCAGCCTACCTGGGCCTCAGCACCTACCTGGTCT 1546
Query 1193 GGACCTGTTGCCTTGCCCACGGAGCCACCTTTCTGGCCCACAGCTCCCACCACCACTTCCTGTATGGGCTCCTT 1266
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1547 GGACCTGTTGCCTTGCCCACGGAGCCACCTTTCTGGCCCACAGCTCCCACCACCACTTCCTGTATGGGCTCCTT 1620
Query 1267 GAAGAGGACCAGAAAGGGGAGACCTCTGGC 1296
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 GAAGAGGACCAGAAAGGGGAGACCTCTGGC 1650