Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13957
• Subject: XM_006712711.4
• Aligned Length: 1296
• Identities: 1201
• Gaps: 93

Alignment

Query    1  ATGGTGCGATGTCAGCTCACTGCAACCTCTACCTCCCAGGTGCCCCGCACCGTCCTCTGGCTGACCATCGAGCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGCCATTGTGGGCTCCGACATGCAGGAAGTCATCGGCACGGCCATTGCATTCAATCTGCTCTCAGCTGGACGAA  148
                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------ATGCAGGAAGTCATCGGCACGGCCATTGCATTCAATCTGCTCTCAGCTGGACGAA  55

Query  149  TCCCACTCTGGGGTGGCGTCCTCATCACCATCGTGGACACCTTCTTCTTCCTCTTCCTCGATAACTACGGGCTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   56  TCCCACTCTGGGGTGGCGTCCTCATCACCATCGTGGACACCTTCTTCTTCCTCTTCCTCGATAACTACGGGCTG  129

Query  223  CGGAAGCTGGAAGCTTTTTTTGGACTCCTTATAACCATTATGGCCTTGACCTTTGGCTATGAGTATGTGGTGGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  130  CGGAAGCTGGAAGCTTTTTTTGGACTCCTTATAACCATTATGGCCTTGACCTTTGGCTATGAGTATGTGGTGGC  203

Query  297  GCGTCCTGAGCAGGGAGCGCTTCTTCGGGGCCTGTTCCTGCCCTCGTGCCCGGGCTGCGGCCACCCCGAGCTGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  204  GCGTCCTGAGCAGGGAGCGCTTCTTCGGGGCCTGTTCCTGCCCTCGTGCCCGGGCTGCGGCCACCCCGAGCTGC  277

Query  371  TGCAGGCGGTGGGCATTGTTGGCGCCATCATCATGCCCCACAACATCTACCTGCACTCGGCCCTGGTCAAGTCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  278  TGCAGGCGGTGGGCATTGTTGGCGCCATCATCATGCCCCACAACATCTACCTGCACTCGGCCCTGGTCAAGTCT  351

Query  445  CGAGAGATAGACCGGGCCCGCCGAGCGGACATCAGAGAAGCCAACATGTACTTCCTGATTGAGGCCACCATCGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  352  CGAGAGATAGACCGGGCCCGCCGAGCAGACATCAGAGAAGCCAACATGTACTTCCTGATTGAGGCCACCATCGC  425

Query  519  CCTGTCCGTCTCCTTTATCATCAACCTCTTTGTCATGGCTGTCTTTGGGCAGGCCTTCTACCAGAAAACCAACC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  426  CCTGTCCGTCTCCTTTATCATCAACCTCTTTGTCATGGCTGTCTTTGGGCAGGCCTTCTACCAGAAAACCAACC  499

Query  593  AGGCTGCGTTCAACATCTGTGCCAACAGCAGCCTCCACGACTACGCCAAGATCTTCCCCATGAACAACGCCACC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  500  AGGCTGCGTTCAACATCTGTGCCAACAGCAGCCTCCACGACTACGCCAAGATCTTCCCCATGAACAACGCCACC  573

Query  667  GTGGCCGTGGACATTTACCAGGGGGGCGTGATCCTGGGCTGCCTGTTCGGCCCCGCGGCCCTCTACATCTGGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  574  GTGGCCGTGGACATTTACCAGGGGGGCGTGATCCTGGGCTGCCTGTTCGGCCCCGCGGCCCTCTACATCTGGGC  647

Query  741  CATAGGTCTCCTGGCGGCTGGGCAGAGCTCCACCATGACGGGCACCTACGCGGGACAGTTCGTGATGGAGGGCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  648  CATAGGTCTCCTGGCGGCTGGGCAGAGCTCCACCATGACGGGCACCTACGCGGGACAGTTCGTGATGGAGGGCT  721

Query  815  TCCTGAGGCTGCGGTGGTCACGCTTCGCCCGTGTCCTCCTCACCCGCTCCTGCGCCATCCTGCCCACCGTGCTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  722  TCCTGAGGCTGCGGTGGTCACGCTTCGCCCGTGTCCTCCTCACCCGCTCCTGCGCCATCCTGCCCACCGTGCTC  795

Query  889  GTGGCTGTCTTCCGGGACCTGAGGGACTTGTCGGGCCTCAATGATCTGCTCAACGTGCTGCAGAGCCTGCTGCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  796  GTGGCTGTCTTCCGGGACCTGAGGGACTTGTCGGGCCTCAATGATCTGCTCAACGTGCTGCAGAGCCTGCTGCT  869

Query  963  CCCGTTCGCCGTGCTGCCCATCCTCACGTTCACCAGCATGCCCACCCTCATGCAGGAGTTTGCCAATGGCCTGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  870  CCCGTTCGCCGTGCTGCCCATCCTCACGTTCACCAGCATGCCCACCCTCATGCAGGAGTTTGCCAATGGCCTGC  943

Query 1037  TGAACAAGGTCGTCACCTCTTCCATCATGGTGCTAGTCTGCGCCATCAACCTCTACTTCGTGGTCAGCTATCTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  944  TGAACAAGGTCGTCACCTCTTCCATCATGGTGCTAGTCTGCGCCATCAACCTCTACTTCGTGGTCAGCTATCTG  1017

Query 1111  CCCAGCCTGCCCCACCCTGCCTACTTCGGCCTTGCAGCCTTGCTGGCCGCAGCCTACCCGGGCCTCAGCACCTA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1018  CCCAGCCTGCCCCACCCTGCCTACTTCGGCCTTGCAGCCTTGCTGGCCGCAGCCTACCTGGGCCTCAGCACCTA  1091

Query 1185  CCTGGTCTGGACCTGTTGCCTTGCCCACGGAGCCACCTTTCTGGCCCACAGCTCCCACCACCACTTCCTGTATG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1092  CCTGGTCTGGACCTGTTGCCTTGCCCACGGAGCCACCTTTCTGGCCCACAGCTCCCACCACCACTTCCTGTATG  1165

Query 1259  GGCTCCTTGAAGAGGACCAGAAAGGGGAGACCTCTGGC  1296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1166  GGCTCCTTGAAGAGGACCAGAAAGGGGAGACCTCTGGC  1203