Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13958
• Subject: XM_011514818.2
• Aligned Length: 1615
• Identities: 1263
• Gaps: 331

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGGCTAAACTTGGTAATCCTAGAAAGTCAATATTGTGTAAAGTTGAGAGAAAAGTCTTCACAGCGGAAGAA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GAAATCACTTTTTTGTCCCGAATCAGTGGGTGGAGGCAAAACCCTTCAGCAAGAAGAGAAGCAACTTCAGCCGT  148

Query    1  --ATGCAAATGGATAACCGGTTGCCTCCCAAAAAAGTTCCAGGTTTCTGTTCCTTTCGCTATGGATTGTCTTTC  72
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTATGCAAATGGATAACCGGTTGCCTCCCAAAAAAGTTCCAGGTTTCTGTTCCTTTCGCTATGGATTGTCTTTC  222

Query   73  CTTGTGCACTGTTGTAATGTTATAATAACAGCACAGCGTGCGTGCCTGAACCTCACAATGGTAGTCATGGTGAA  146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTGTGCACTGTTGTAATGTTATAATAACAGCACAGCGTGCGTGCCTGAACCTCACAATGGTAGTCATGGTGAA  296

Query  147  TAGCACAGATCCACATGGTTTGCCCAACACCTCCACAAAGAAGCTCCTGGATAATATAAAGAACCCTATGTATA  220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAGCACAGATCCACATGGTTTGCCCAACACCTCCACAAAGAAGCTCCTGGATAATATAAAGAACCCTATGTATA  370

Query  221  ATTGGAGCCCAGATATCCAGGGAATCATCTTGAGTTCCACCTCCTATGGTGTCATCATCATCCAAGTTCCTGTT  294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTGGAGCCCAGATATCCAGGGAATCATCTTGAGTTCCACCTCCTATGGTGTCATCATCATCCAAGTTCCTGTT  444

Query  295  GGATACTTCTCTGGAATATATTCTACAAAGAAAATGATTGGCTTTGCATTATGCCTCAGCTCTGTGTTAAGCCT  368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGATACTTCTCTGGAATATATTCTACAAAGAAAATGATTGGCTTTGCATTATGCCTCAGCTCTGTGTTAAGCCT  518

Query  369  GCTCATCCCACCAGCAGCTGGAATTGGAGTAGCTTGGGTCGTTGTATGTCGAGCAGTTCAGGGAGCAGCCCAGG  442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTCATCCCACCAGCAGCTGGAATTGGAGTAGCTTGGGTCGTTGTATGTCGAGCAGTTCAGGGAGCAGCCCAGG  592

Query  443  GGATAGTTGCAACAGCCCAGTTTGAAATATATGTCAAATGGGCTCCTCCCCTGGAACGAGGCCGACTTACTTCT  516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGATAGTTGCAACAGCCCAGTTTGAAATATATGTCAAATGGGCTCCTCCCCTGGAACGAGGCCGACTTACTTCT  666

Query  517  ATGAGTACATCAGGGTTTTTGCTGGGACCCTTTATTGTCCTACTTGTGACTGGAGTTATCTGTGAATCTCTGGG  590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATGAGTACATCAGGGTTTTTGCTGGGACCCTTTATTGTCCTACTTGTGACTGGAGTTATCTGTGAATCTCTGGG  740

Query  591  CTGGCCCATGGTCTTCTATATTTTTGGTGCTTGTGGCTGTGCCGTATGTCTTCTCTGGTTCGTTCTGTTTTATG  664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGGCCCATGGTCTTCTATATTTTTGGTGCTTGTGGCTGTGCCGTATGTCTTCTCTGGTTCGTTCTGTTTTATG  814

Query  665  ATGACCCCAAAGACCACCCATGTATAAGCATCAGTGAAAAGGAATACATCACATCCTCCCTGGTCCAGCAGGTC  738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGACCCCAAAGACCACCCATGTATAAGCATCAGTGAAAAGGAATACATCACATCCTCCCTGGTCCAGCAGGTC  888

Query  739  AGTTCAAGTAGACAATCTCTGCCTATCAAGGCTATACTTAAGTCGCTTCCAGTCTGGGCTATTTCCACTGGTAG  812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGTTCAAGTAGACAATCTCTGCCTATCAAGGCTATACTTAAGTCGCTTCCAGTCTGGGCTATTTCCACTGGTAG  962

Query  813  TTTTACGTTTTTCTGGTCACATAACATCATGACACTATACACTCCAATGTTTATCAACTCCATGCTTCATGTTA  886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTTTACGTTTTTCTGGTCACATAACATCATGACACTATACACTCCAATGTTTATCAACTCCATGCTTCATGTTA  1036

Query  887  ATATAAAAGAGAATGGGTTCTTGTCTTCCCCTTCCCTATTTGTTTGCCTGGATCTGTGGTAACCTAGCAGGTCA  960
            ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATATAAAAGAGAATGGGTTCTTGTCTT-CCCTTCCCTATTTGTTTGCCTGGATCTGTGGTAACCTAGCAGGTCA  1109

Query  961  GTTATCAGACTTCTTCCTGACCAGGAATATTCTCAGCGTAATTGCTGTCCGGAAACCCTTCACAGCAGCAGGAT  1034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1110  GTTATCAGACTTCTTCCTGACCAGGAATATTCTCAGCGTAATTGCTGTCCGGAAACTCTTCACAGCAGCAGGAT  1183

Query 1035  TTCTCCTTCCTGCAATCTTTGGTGTCTGCCTGCCTTACCTGAGTTCCACCTTCTACAGCATTGTCATTTTCCTA  1108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  TTCTCCTTCCTGCAATCTTTGGTGTCTGCCTGCCTTACCTGAGTTCCACCTTCTACAGCATTGTCATTTTCCTA  1257

Query 1109  ATACTTGCTGGTGCAACAGGCAGCTTTTGCTTGGGTGGAGTGTTTATAAATGGCTTGGATATTGCTCCCAGATA  1182
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct 1258  ATACTTGCTGGTGCAACAGGCAGCTTTTGCTTGGGTGGAGTGTTTATAAATGGCTTGGATATTGCTCCCAG---  1328

Query 1183  TTTTGGATTTATTAAAGCATGTTCA----ACTTTAA----CTGG------------AATGATAGGA----GGAC  1232
                     |.|.|||       ||    ||||..|    ||||            |.|||..|||    ||||
Sbjct 1329  ---------TGTGAAA-------CAGAGCACTTGCAGAGCCTGGGACAACCTCCTTATTGAAGGGAAGAGGGAC  1386

Query 1233  TAATTGCTTCCACTTTGA--CTG-GATTGA-------TCCTTAAGCAGGATCCGGAA-----------------  1279
            .|       .||| .|||  ||| |..|||       ||    |.|||.|.|.||||                 
Sbjct 1387  CA-------GCAC-ATGAGGCTGAGGCTGAGGGGCAGTC----ACCAGCACCAGGAAGAAGGTGGTAGGAGGAG  1448

Query 1280  TCC-----GCCTGGTTTAAAACCTTC------ATCCTGATG-GCAGCCATTAATGTGACTGGCCTAATTTTCTA  1341
            |||     |||.|.|||   |||.||      |||||| || |||.|       ||           ||||   
Sbjct 1449  TCCTAGGGGCCAGTTTT---ACCCTCCCACATATCCTG-TGTGCATC-------GT-----------TTTT---  1497

Query 1342  CCTTATAGTTGCTACAGCAGAAATTCAGGACTGGGCTAAAGAAAAACAACACACACGTCTC  1402
                                                                         
Sbjct 1498  -------------------------------------------------------------  1497