Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13958
• Subject: XM_011514820.2
• Aligned Length: 1552
• Identities: 1238
• Gaps: 313

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGGCTAAACTTGGTAATCCTAGAAAGTCAATATTGTGTAAAGTTGAGAGAAAAGTCTTCACAGCGGAAGAA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GAAATCACTTTTTTGTCCCGAATCAGTGGGTGGAGGCAAAACCCTTCAGCAAGAAGAGAAGCAACTTCAGCCGT  148

Query    1  --ATGCAAATGGATAACCGGTTGCCTCCCAAAAAAGTTCCAGGTTTCTGTTCCTTTCGCTATGGATTGTCTTTC  72
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTATGCAAATGGATAACCGGTTGCCTCCCAAAAAAGTTCCAGGTTTCTGTTCCTTTCGCTATGGATTGTCTTTC  222

Query   73  CTTGTGCACTGTTGTAATGTTATAATAACAGCACAGCGTGCGTGCCTGAACCTCACAATGGTAGTCATGGTGAA  146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTGTGCACTGTTGTAATGTTATAATAACAGCACAGCGTGCGTGCCTGAACCTCACAATGGTAGTCATGGTGAA  296

Query  147  TAGCACAGATCCACATGGTTTGCCCAACACCTCCACAAAGAAGCTCCTGGATAATATAAAGAACCCTATGTATA  220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAGCACAGATCCACATGGTTTGCCCAACACCTCCACAAAGAAGCTCCTGGATAATATAAAGAACCCTATGTATA  370

Query  221  ATTGGAGCCCAGATATCCAGGGAATCATCTTGAGTTCCACCTCCTATGGTGTCATCATCATCCAAGTTCCTGTT  294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTGGAGCCCAGATATCCAGGGAATCATCTTGAGTTCCACCTCCTATGGTGTCATCATCATCCAAGTTCCTGTT  444

Query  295  GGATACTTCTCTGGAATATATTCTACAAAGAAAATGATTGGCTTTGCATTATGCCTCAGCTCTGTGTTAAGCCT  368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGATACTTCTCTGGAATATATTCTACAAAGAAAATGATTGGCTTTGCATTATGCCTCAGCTCTGTGTTAAGCCT  518

Query  369  GCTCATCCCACCAGCAGCTGGAATTGGAGTAGCTTGGGTCGTTGTATGTCGAGCAGTTCAGGGAGCAGCCCAGG  442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTCATCCCACCAGCAGCTGGAATTGGAGTAGCTTGGGTCGTTGTATGTCGAGCAGTTCAGGGAGCAGCCCAGG  592

Query  443  GGATAGTTGCAACAGCCCAGTTTGAAATATATGTCAAATGGGCTCCTCCCCTGGAACGAGGCCGACTTACTTCT  516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGATAGTTGCAACAGCCCAGTTTGAAATATATGTCAAATGGGCTCCTCCCCTGGAACGAGGCCGACTTACTTCT  666

Query  517  ATGAGTACATCAGGGTTTTTGCTGGGACCCTTTATTGTCCTACTTGTGACTGGAGTTATCTGTGAATCTCTGGG  590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATGAGTACATCAGGGTTTTTGCTGGGACCCTTTATTGTCCTACTTGTGACTGGAGTTATCTGTGAATCTCTGGG  740

Query  591  CTGGCCCATGGTCTTCTATATTTTTGGTGCTTGTGGCTGTGCCGTATGTCTTCTCTGGTTCGTTCTGTTTTATG  664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGGCCCATGGTCTTCTATATTTTTGGTGCTTGTGGCTGTGCCGTATGTCTTCTCTGGTTCGTTCTGTTTTATG  814

Query  665  ATGACCCCAAAGACCACCCATGTATAAGCATCAGTGAAAAGGAATACATCACATCCTCCCTGGTCCAGCAGGTC  738
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct  815  ATGACCCCAAAGACCACCCATGTATAAGCATCAGTGAAAAGGAATACATCACATCCTCCCTGGTCCAGC-----  883

Query  739  AGTTCAAGTAGACAATCTCTGCCTATCAAGGCTATACTTAAGTCGCTTCCAGTCTGGGCTATTTCCACTGGTAG  812
                                                                                      
Sbjct  884  --------------------------------------------------------------------------  883

Query  813  TTTTACGTTTTTCTGGTCACATAACATCATGACACTATACACTCCAATGTTTATCAACTCCATGCTTCATGTTA  886
                                                                                      
Sbjct  884  --------------------------------------------------------------------------  883

Query  887  ATATAAAAGAGAATGGGTTCTTGTCTTCCCCTTCCCTATTTGTTTGCCTGGATCTGTGGTAACCTAGCAGGTCA  960
                     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  884  ---------AGAATGGGTTCTTGTCTT-CCCTTCCCTATTTGTTTGCCTGGATCTGTGGTAACCTAGCAGGTCA  947

Query  961  GTTATCAGACTTCTTCCTGACCAGGAATATTCTCAGCGTAATTGCTGTCCGGAAACCCTTCACAGCAGCAGGAT  1034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  948  GTTATCAGACTTCTTCCTGACCAGGAATATTCTCAGCGTAATTGCTGTCCGGAAACTCTTCACAGCAGCAGGAT  1021

Query 1035  TTCTCCTTCCTGCAATCTTTGGTGTCTGCCTGCCTTACCTGAGTTCCACCTTCTACAGCATTGTCATTTTCCTA  1108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1022  TTCTCCTTCCTGCAATCTTTGGTGTCTGCCTGCCTTACCTGAGTTCCACCTTCTACAGCATTGTCATTTTCCTA  1095

Query 1109  ATACTTGCTGGTGCAACAGGCAGCTTTTGCTTGGGTGGAGTGTTTATAAATGGCTTGGATATTGCTCCCAGATA  1182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1096  ATACTTGCTGGTGCAACAGGCAGCTTTTGCTTGGGTGGAGTGTTTATAAATGGCTTGGATATTGCTCCCAGATA  1169

Query 1183  TTTTGGATTTATTAAAGCATGTTCAACTTTAACTGGAATGATAGGAGGACTAATTGCTTCCACTTTGACTGGAT  1256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1170  TTTTGGATTTATTAAAGCATGTTCAACTTTAACTGGAATGATAGGAGGACTAATTGCTTCCACTTTGACTGGAT  1243

Query 1257  TGATCCTTAAGCAGGATCCGGAATCCGCCTGGTTTAAAACCTTCATCCTGATGGCAGCCATTAATGTGACTGGC  1330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1244  TGATCCTTAAGCAGGATCCGGAATCCGCCTGGTTTAAAACCTTCATCCTGATGGCAGCCATTAATGTGACTGGC  1317

Query 1331  CTAATTTTCTACCTTATAGTTGCTACAGCAGAAATTCAGGACTGGGCTAAAGAAAAACAACACACACGTCTC  1402
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318  CTAATTTTCTACCTTATAGTTGCTACAGCAGAAATTCAGGACTGGGCTAAAGAAAAACAACACACACGTCTC  1389