Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_13995
Subject:
NM_003624.3
Aligned Length:
604
Identities:
348
Gaps:
249

Alignment

Query   1  MVDLANEEKPAIAPPVFVFQKDKGQK------------------------------------------------  26
           |.||||||||||||||||||||||||                                                
Sbjct   1  MADLANEEKPAIAPPVFVFQKDKGQKSPAEQKNLSDSGEEPRGEAEAPHHGTGHPESAGEHALEPPAPAGASAS  74

Query  27  --------------------RSAGGSSPEGGEDSDREDGNYCPPVKRERTSSLTQFPPSQSEERSSGFRLKPPT  80
                               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TPPPPAPEAQLPPFPRELAGRSAGGSSPEGGEDSDREDGNYCPPVKRERTSSLTQFPPSQSEERSSGFRLKPPT  148

Query  81  LIHGQAPSAGLPSQKPKEQQRSVLRPAVLQAPQPKALSQTVPSSGTNGVSLPADCTGAVPAASPDTAAWRSPSE  154
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  LIHGQAPSAGLPSQKPKEQQRSVLRPAVLQAPQPKALSQTVPSSGTNGVSLPADCTGAVPAASPDTAAWRSPSE  222

Query 155  AADEVCALEEKEPQKNESSNASEEEACEKKDPATQQAFVFGQNLRDRVKLINESVDEADMENAGHPSADTPTAT  228
           |||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  AAD-----EEKEPQKNESSNASEEEACEKKDPATQQAFVFGQNLRDRVKLINESVDEADMENAGHPSADTPTAT  291

Query 229  NYFLQYISSSLENSTNSADASSNKFVFGQNMSERVLSPPKLNEVSSDANRENAAAESGSESSSQEATPEKESLA  302
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 292  NYFLQYISSSLENSTNSADASSNKFVFGQNMSERVLSPPKLNEVSSDANRENAAAESGSESSSQEATPEKESLA  365

Query 303  ESAAAYTKATARKCLLEKVEVITGEEAESNVLQMQCKLFVFDKTSQSWLLRHPHPSHPAVGPCLCGEQPALCPC  376
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|                       
Sbjct 366  ESAAAYTKATARKCLLEKVEVITGEEAESNVLQMQCKLFVFDKTSQSWVER-----------------------  416

Query 377  PGLPNYRPGTPAQLGGLLVRV-----------------------------------------------------  397
                         |..|.|.                                                     
Sbjct 417  --------------GRGLLRLNDMASTDDGTLQSRLVMRTQGSLRLILNTKLWAQMQIDKASEKSIRITAMDTE  476

Query 398  --------------------------------------------------------------------------  397
                                                                                     
Sbjct 477  DQGVKVFLISASSKDTGQLYAALHHRILALRSRVEQEQEAKMPAPEPGAAPSNEEDDSDDDDVLAPSGATAAGA  550

Query 398  ------------  397
                       
Sbjct 551  GDEGDGQTTGST  562