Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14020
• Subject: NM_001347585.1
• Aligned Length: 1391
• Identities: 1103
• Gaps: 139

Alignment

Query    1  ATGGAGCAGGGGCTGGAGGAGGAAGA-----------------AGAGGTGGATCC-------------------  38
            |||||       ||||    |..|||                 ||.|.|||..||                   
Sbjct    1  ATGGA-------CTGG----GCCAGAACTGTTATGGCCTCTACAGGGCTGGCCCCAGCTTCTGCTGCTCCTCAC  63

Query   39  -CCGGATCCAGGG---AGAACTG---------GAGAAGTTAAATCAGT----CCAC---------GGATGATAT  86
             ||||.|||.|.|   ||..|||         |    |.|   .|.||    ||||         ||.|  |||
Sbjct   64  ACCGGCTCCCGTGCCCAGCCCTGCCTCTTTTTG----GCT---CCTGTGCCCCCACACTTTGCTTGGTT--TAT  128

Query   87  C----------------------------------AACAGACGG-GAGACTGAA--CTTG--------------  109
            |                                  .||||.||| .||..|.||  |.||              
Sbjct  129  CTTCCTGGACCCTGCTCTACCCTGCTCTACTCTGGCACAGTCGGTCAGCTTCAAACCCTGCTGTGGGGTCGTAA  202

Query  110  AGGATGCTCGTCAGAAGTTCCGCTCTGTTCTGGTTGAAGCAACGGTGAAACTGGATGAACTGGTGAAGAAAATT  183
            |||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||..||||||||.
Sbjct  203  AGGATGCACGCCAGAAGTTCCGATCTGTCCTGGTCGAGGCAACGGTGAAACTAGACGAACTGGCAAAGAAAATC  276

Query  184  GGCAAAGCTGTGGAAGACTCCAAGCCCTACTGGGAGGCACGGAGGGTGGCGAGGCAGGCTCAGCTGGAAGCTCA  257
            ||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct  277  GGCAAAGCCGTGGAGGACTCGAAGCCCTACTGGGAGGCCCGGAGGGTGGCAAGGCAGGCTCAGCTGGAGGCGCA  350

Query  258  GAAAGCCACGCAGGACTTCCAGAGGGCCACAGAGGTGCTCCGTGCCGCCAAGGAGACCATCTCCCTGGCCGAGC  331
            |||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||
Sbjct  351  GAAGGCCACACAGGACTTCCAGAGGGCCACCGAGGTACTCCGTGCAGCCAAGGAAACAATCTCTCTGGCTGAGC  424

Query  332  AGCGGCTGCTGGAGGATGACAAGCGGCAGTTCGACTCCGCCTGGCAGGAGATGCTGAATCACGCCACTCAGAGG  405
            ||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct  425  AGCGGCTGTTGGAGGATGACAAGCGGCAGTTTGACTCTGCTTGGCAGGAAATGCTGAACCATGCTACTCAGAGG  498

Query  406  GTCATGGAGGCGGAGCAGACCAAGACCAGGAGCGAGCTGGTGCATAAGGAGACGGCAGCCAGGTACAATGCCGC  479
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  499  GTCATGGAGGCCGAGCAGACCAAGACAAGGAGTGAGCTAGTACACAAGGAGACGGCAGCCAGGTACAACGCTGC  572

Query  480  CATGGGCCGCATGCGACAGCTGGAGAAGAAACTCAAGAGAGCCATCAACAAGTCCAAGCCTTATTTTGAACTCA  553
            ||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  573  CATGGGTCGCATGCGCCAGCTGGAGAAGAAACTCAAGCGAGCCATCAACAAGTCCAAGCCTTATTTTGAGCTAA  646

Query  554  AGGCAAAGTACTATGTGCAGCTCGAGCAACTGAAAAAGACTGTGGATGACCTGCAGGCCAAACTGACCCTGGCA  627
            |||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||.||||||||
Sbjct  647  AGGCAAAGTACTACGTGCAGCTTGAGCAACTGAAGAAGACGGTGGATGACCTTCAGGCCAAGCTGGCCCTGGCA  720

Query  628  AAAGGCGAGTACAAGATGGCCCTGAAGAACCTGGAGATGATCTCAGATGAGATCCACGAGCGGCGGCGCTCCAG  701
            ||.||||||||||||...||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||.||||.
Sbjct  721  AAGGGCGAGTACAAGGCAGCCCTGAAGAGCCTGGAGAGGATCTCAGATGAGATACACGAGCGGCGGCGTTCCAA  794

Query  702  TGCCATGGGGCCTCGGGGATGCGGTGTTGGTGCTGAGGGCAGCAGCACATCTGTGGAGGATCTGCCAGGGAGCA  775
            ||||||||||||.|||||.||.||.||.||.||.||||||||||.|.|.||.||||||.|.|||||.|..||||
Sbjct  795  TGCCATGGGGCCCCGGGGCTGTGGCGTGGGGGCAGAGGGCAGCATCGCCTCAGTGGAGAACCTGCCTGTAAGCA  868

Query  776  AACCTGAGCCTGATGCCATTTCTGTGGCCTCGGAGGCCTTTGAAGATGACAGCTGTAGCAACTTTGTGTCTGAA  849
            |||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||.|||.||||||||.|||||||||
Sbjct  869  AACCTGAGCCTGACGCCATTTCTGTGGCATCAGAAGCCTTTGAAGATGACAACTGCAGCAACTTGGTGTCTGAA  942

Query  850  GATGACTCGGAAACCCAGTCCGTGTCCAGCTTTAGTTCAGGACCAACAAGCCCGTCTGAGATGCCTGACCAGTT  923
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  943  GATGACTCGGAAACCCAGTCTGTGTCCAGCTTTAGTTCGGGACCGACGAGTCCGTCTGAAATGCCTGATCAGTT  1016

Query  924  CCCTGCGGTTGTGAGGCCTGGCAGCCTGGATCTGCCCAGCCCTGTGTCCCTGTCAGAGTTTGGGATGATGTTCC  997
            ||||||.||.|..|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1017  CCCTGCAGTGGCAAGGCCTGGCAGTCTGGATCTGCCTAGCCCTGTGTCCCTGTCAGAATTTGGGATGATGTTCC  1090

Query  998  CAGTGTTGGGCCCTCGAAGTGAATGCAGCGGGGCCTCCTCCCCTGAATGTGAAGTAGAACGAGGAGACAGGGCA  1071
            ||.|..||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1091  CAATACTGGGTCCTCGAAGTGAATGCAGTGGGGCCTCCTCCCCTGAATGTGAGGTTGAACGAGGAGACAGAGCA  1164

Query 1072  GAAGGGGCAGAGAATAAAACAAGTGACAAAGCCAACAACAACCGGGGCCTCAGCAGTAGCA---GTGGCAGTGG  1142
            ||||||||.||||||||||..|||||||||||||||||||||||.|..|||.||||.|.||   ||||||   |
Sbjct 1165  GAAGGGGCCGAGAATAAAATGAGTGACAAAGCCAACAACAACCGTGTTCTCGGCAGCACCAACGGTGGCA---G  1235

Query 1143  TGGCAGCAGTAAGAGCCAAAGCAGCACCTCCCCTGAGGGCCAGGCCTTGGAGAACCGGATGAAGCAGCTCTCCC  1216
            ||||||.||.|.|||||||||||||||.||||.||||.|||||||||||||.|.||||||||||||||||||||
Sbjct 1236  TGGCAGGAGCAGGAGCCAAAGCAGCACGTCCCTTGAGAGCCAGGCCTTGGAAACCCGGATGAAGCAGCTCTCCC  1309

Query 1217  TACAGTGCTCAAAGGGAAGAGATGGAATTATTGCTGACATAAAAATGGTGCAGATTGGC  1275
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1310  TACAGTGCTCAAAAGGAAGAGATGGAATTATTGCTGACATAAAAATGGTGCAGATTGGC  1368