Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14035
• Subject: NM_005486.3
• Aligned Length: 1429
• Identities: 1038
• Gaps: 391

Alignment

Query    1  ATGGCGTTTGGCAAGAGTCACCGGGATCCCTACGCGACCTCCGTGGGCCACCTCATAGAAAAGGCTACATTTGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTTTGGCAAGAGTCACCGGGATCCCTACGCGACCTCCGTGGGCCACCTCATAGAAAAGGCTACATTTGC  74

Query   75  TGGAGTTCAGACTGAAGATTGGGGCCAGTTCATGCACATCTGTGACATAATTAACACTACCCAGGATGGGCCAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGAGTTCAGACTGAAGATTGGGGCCAGTTCATGCACATCTGTGACATAATTAACACTACCCAGGATGGGCCAA  148

Query  149  AAGATGCAGTGAAAGCTTTGAAGAAAAGGATTTCCAAAAACTACAATCATAAAGAAATCCAACTTACCTTGTCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGATGCAGTGAAAGCTTTGAAGAAAAGGATTTCCAAAAACTACAATCATAAAGAAATCCAACTTACCTTGTCA  222

Query  223  CTTATTGACATGTGTGTGCAGAACTGTGGTCCAAGTTTCCAGTCTCTGATTGTGAAGAAGGAATTTGTTAAAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTATTGACATGTGTGTGCAGAACTGTGGTCCAAGTTTCCAGTCTCTGATTGTGAAGAAGGAATTTGTTAAAGA  296

Query  297  GAATTTAGTTAAGCTACTGAATCCCAGATACAACTTGCCATTAGACATTCAGAATAGAATCTTGAATTTCATTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAATTTAGTTAAGCTACTGAATCCCAGATACAACTTGCCATTAGACATTCAGAATAGAATCTTGAATTTCATTA  370

Query  371  AGACTTGGTCACAGGGCTTCCCAGGAGGTGTGGATGTAAGCGAAGTCAAAGAAGTATACCTCGACCTGGTTAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGACTTGGTCACAGGGCTTCCCAGGAGGTGTGGATGTAAGCGAAGTCAAAGAAGTATACCTCGACCTGGTTAAG  444

Query  445  AAAGGCGTTCAGTTTCCTCCCTCAGAAGCAGAGGCTGAAACAGCAAGACAAGAGACTGCTCAAATCTCATCAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAGGCGTTCAGTTTCCTCCCTCAGAAGCAGAGGCTGAAACAGCAAGACAAGAGACTGCTCAAATCTCATCAAA  518

Query  519  TCCTCCAACATCTGTCCCTACTGCACCAGCTCTTTCTTCTGTAATTGCTCCAAAGAACTCGACTGTTACATTGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCTCCAACATCTGTCCCTACTGCACCAGCTCTTTCTTCTGTAATTGCTCCAAAGAACTCGACTGTTACATTGG  592

Query  593  TCCCAGAACAGATTGGAAAACTGCACAGTGAATTGGATATGGTGAAAATGAATGTGCGAGTGATGTCCGCCATA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCCAGAACAGATTGGAAAACTGCACAGTGAATTGGATATGGTGAAAATGAATGTGCGAGTGATGTCCGCCATA  666

Query  667  TTGATGGAGAATACTCCTGGGTCTGAAAACCATGAAGACATAGAGCTTCTGCAGAAACTCTATAAAACAGGTCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTGATGGAGAATACTCCTGGGTCTGAAAACCATGAAGACATAGAGCTTCTGCAGAAACTCTATAAAACAGGTCG  740

Query  741  GGAGATGCAGGAGAGGATCATGGACCTGCTTGTGGTGGTGGAGAACGAAGATGTAACTGTTGAGCTAATTCAGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAGATGCAGGAGAGGATCATGGACCTGCTTGTGGTGGTGGAGAACGAAGATGTAACTGTTGAGCTAATTCAGG  814

Query  815  TGAATGAGGATTTGAATAATGCTATCCTTGGATATGAGAGGTTTACTAGAAACCAACAAAGGATTTTGGAGCAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGAATGAGGATTTGAATAATGCTATCCTTGGATATGAGAGGTTTACTAGAAACCAACAAAGGATTTTGGAGCAA  888

Query  889  AATAAGAACCAGAAGGAAGCCACCAATACTACCAGTGAGCCTTCTGCCCCATCTCAAGATCTCCTCGACCTAAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AATAAGAACCAGAAGGAAGCCACCAATACTACCAGTGAGCCTTCTGCCCCATCTCAAGATCTCCTCGACCTAAG  962

Query  963  TCCCAGTCCCCGGATGCCTAGGGCCACTCTGGGAGAACTCAACACCATGAATAATCCAACTTTCAGGCTTAAAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCCCAGTCCCCGGATGCCTAGGGCCACTCTGGGAGAACTCAACACCATGAATAAT-CAACTTTCAGGCTTAAAT  1035

Query 1037  --------------------------AAA---------------------------------------------  1039
                                      |||                                             
Sbjct 1036  TTCAGCCTTCCAAGTTCTGATGTAACAAACAACTTAAAACCCAGTCTTCATCCACAGATGAACTTGCTAGCCTT  1109

Query 1040  --------------------------------------------------------------------------  1039
                                                                                      
Sbjct 1110  GGAGAATACAGAGATACCCCCGTTTGCCCAAAGGACCAGCCAAAACCTCACCTCAAGCCACGCATATGATAATT  1183

Query 1040  --------------------------------------------------------------------------  1039
                                                                                      
Sbjct 1184  TTCTGGAACATTCAAATTCAGTGTTTCTACAGCCAGTTAGTCTACAAACCATTGCAGCAGCACCATCAAACCAG  1257

Query 1040  --------------------------------------------------------------------------  1039
                                                                                      
Sbjct 1258  AGTCTGCCACCTTTGCCCAGCAATCATCCAGCGATGACAAAAAGTGATCTCCAGCCACCTAATTACTACGAGGT  1331

Query 1040  --------------------------------------------------------------------------  1039
                                                                                      
Sbjct 1332  AATGGAGTTTGATCCCTTAGCTCCTGCTGTCACTACAGAAGCTATTTATGAAGAAATTGATGCTCACCAGCACA  1405

Query 1040  -----------------------  1039
                                   
Sbjct 1406  AAGGAGCTCAAAATGATGGTGAC  1428