Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14060
• Subject: NM_011845.2
• Aligned Length: 2055
• Identities: 1932
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAAACACTGGAGTCTGAATTGACCTGTCCAATCTGCCTAGAGTTGTTTGAAGACCCCCTTCTGCTCCCTTG  74
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGAAACACTGGAGTCAGAATTGACCTGTCCAATCTGCCTCGAGTTGTTTGAAGACCCCCTTCTGCTTCCTTG  74

Query   75  TGCTCACAGCCTCTGCTTCAGCTGTGCCCATCGCATTTTGGTATCAAGCTGCAGCTCTGGTGAATCCATTGAAC  148
            ||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCTCACAGCCTATGTTTTAGCTGTGCCCACCGCATCTTGGTCTCAAGCTGCAGCTCTGGTGAATCCATTGAAC  148

Query  149  CCATTACTGCTTTCCAGTGTCCTACCTGCAGGTATGTTATCTCGCTGAACCACCGGGGCCTGGATGGCCTCAAG  222
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCATTACTGCTTTCCAGTGTCCTACATGCAGGTATGTTATCTCGCTGAATCACCGGGGCCTGGATGGCCTCAAG  222

Query  223  AGGAATGTGACTCTGCAGAACATTATTGATCGCTTCCAGAAGGCTTCAGTCAGTGGGCCCAATTCCCCTAGTGA  296
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  223  AGGAATGTGACCCTGCAGAACATTATTGATCGCTTCCAGAAGGCTTCAGTCAGTGGGCCCAATTCTCCAAGTGA  296

Query  297  GAGCCGCCGGGAAAGGACTTACAGGCCCACCACTGCCATGTCTAGCGAGCGAATTGCTTGCCAATTCTGTGAGC  370
            ||||||||||||.||||||||||||||.|.|.|.||||||||.||.|||.|||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  297  GAGCCGCCGGGAGAGGACTTACAGGCCTAGCTCCGCCATGTCGAGTGAGAGAATTGCATGTCAATTCTGTGAGC  370

Query  371  AGGACCCGCCAAGGGATGCAGTAAAAACATGCATCACCTGTGAGGTCTCCTACTGTGACCGTTGCCTGCGGGCC  444
            |||||||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  371  AGGACCCTCCGAGAGATGCTGTAAAGACGTGCATCACCTGTGAGGTCTCCTACTGTGACCGTTGCCTTCGGGCC  444

Query  445  ACGCACCCCAACAAGAAACCTTTCACCAGCCACCGCCTGGTGGAACCAGTGCCAGACACACATCTTCGAGGGAT  518
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACACACCCCAACAAGAAACCTTTCACCAGCCATCGCCTGGTGGAACCAGTTTCAGACACACATCTTCGAGGGAT  518

Query  519  CACCTGCCTGGACCATGAGAATGAGAAAGTGAACATGTACTGTGTATCTGATGACCAATTGATCTGTGCCTTAT  592
            .||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  519  TACCTGCCTGGACCACGAGAATGAGAAGGTGAACATGTACTGTGTATCTGATGATCAATTGATCTGTGCCTTAT  592

Query  593  GCAAACTGGTGGGTCGTCACCGAGACCATCAGGTCGCATCCCTGAATGATCGATTTGAGAAACTCAAGCAAACT  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  593  GCAAACTGGTGGGTCGTCACCGAGACCATCAGGTCGCTTCTCTGAATGATCGATTTGAGAAACTAAAGCAAACT  666

Query  667  CTGGAGATGAACCTCACCAACCTGGTTAAGCGCAACAGCGAACTAGAAAATCAAATGGCCAAACTAATACAGAT  740
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTCGAGATGAACCTCACCAACCTGGTTAAGCGCAACAGTGAACTAGAAAATCAAATGGCCAAACTAATACAGAT  740

Query  741  CTGCCAGCAGGTTGAGGTGAATACTGCTATGCATGAGGCAAAACTTATGGAAGAATGTGACGAGTTGGTAGAGA  814
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGCCAGCAAGTTGAGGTGAATACTGCTATGCATGAGGCAAAACTTATGGAAGAATGTGACGAGTTGGTAGAGA  814

Query  815  TCATCCAGCAGAGGAAGCAAATGATCGCTGTCAAAATCAAAGAGACAAAGGTTATGAAACTGAGAAAGTTGGCA  888
            ||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCATCCAGCAGAGGAAACAAATGATTGCTGTCAAAATCAAAGAGACAAAGGTTATGAAACTGAGAAAGTTGGCA  888

Query  889  CAGCAGGTTGCTAATTGCCGCCAGTGTCTTGAACGGTCAACAGTCCTCATCAACCAAGCTGAGCATATCCTGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  889  CAGCAGGTTGCTAATTGCCGCCAGTGTCTTGAGCGGTCAACAGTCCTCATCAACCAAGCTGAGCATATCCTAAA  962

Query  963  AGAAAATGACCAGGCACGGTTTCTACAGTCTGCAAAAAATATTGCTGAGAGGGTCGCTATGGCAACTGCATCTT  1036
            .|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAAAATGACCAAGCACGGTTTCTGCAGTCTGCAAAAAACATTGCCGAGAGGGTCGCTATGGCAACTGCATCTT  1036

Query 1037  CTCAAGTTCTGATTCCAGACATCAATTTTAATGATGCCTTTGAAAACTTTGCTTTAGATTTTTCCAGAGAAAAG  1110
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037  CGCAAGTTCTGATTCCAGACATCAATTTTAATGATGCCTTTGAAAACTTTGCTTTAGATTTTTCTAGAGAAAAG  1110

Query 1111  AAACTGCTAGAGGGGTTAGATTATTTAACAGCCCCAAACCCACCATCTATCCGAGAAGAACTCTGTACTGCCTC  1184
            |||||..|.||||||.||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1111  AAACTATTGGAGGGGCTAGACTATTTAACAGCTCCAAACCCACCATCTATCCGAGAAGAGCTCTGTACTGCTTC  1184

Query 1185  CCATGACACCATTACAGTCCACTGGATCTCGGATGATGAGTTCAGCATCAGCTCCTATGAGCTTCAGTACACCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCATGACACCATTACAGTCCACTGGATCTCAGACGACGAATTCAGCATCAGCTCCTATGAGCTTCAGTACACCA  1258

Query 1259  TATTCACTGGCCAGGCTAACTTCATCAGCCTGTATAATTCAGTAGACAGCTGGATGATTGTTCCCAACATTAAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1259  TATTCACTGGCCAGGCTAACTTCATCAGCCTGTACAATTCAGTGGATAGCTGGATGATTGTGCCCAACATTAAG  1332

Query 1333  CAGAACCATTACACAGTGCATGGACTCCAGAGCGGGACTCGCTACATCTTCATCGTTAAAGCCATAAACCAAGC  1406
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1333  CAGAACCATTACACAGTTCATGGACTCCAGAGTGGGACACGCTACATCTTTATCGTGAAAGCCATAAATCAAGC  1406

Query 1407  CGGCAGCCGGAACAGTGAACCTACCCGACTAAAAACAAACAGCCAACCCTTTAAATTGGATCCCAAAATGACTC  1480
            .||||||||||||||.|||||.|||.||||||||||.|||||||||||.||||||.|.||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGGCAGCCGGAACAGCGAACCCACCAGACTAAAAACGAACAGCCAACCATTTAAACTAGATCCCAAAATGACTC  1480

Query 1481  ACAAGAAGTTGAAGATCTCCAATGATGGATTGCAGATGGAGAAGGATGAAAGCTCTCTAAAGAAGAGCCACACC  1554
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1481  ACAAGAAGTTGAAGATCTCCAATGATGGATTGCAGATGGAGAAGGATGAGAGCTCTCTGAAGAAGAGCCACACT  1554

Query 1555  CCAGAGAGGTTTAGTGGCACAGGGTGCTATGGGGCAGCAGGAAATATATTCATTGACAGTGGCTGCCACTATTG  1628
            ||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1555  CCGGAGAGATTTAGTGGCACAGGGTGTTATGGGGCAGCAGGAAATATATTCATCGACAGTGGCTGCCACTACTG  1628

Query 1629  GGAGGTGGTCATGGGTTCCTCAACATGGTATGCAATTGGCATTGCCTACAAATCAGCTCCAAAGAATGAATGGA  1702
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1629  GGAGGTGGTCATGGGTTCTTCAACATGGTATGCTATTGGTATTGCCTACAAATCAGCTCCAAAGAATGAGTGGA  1702

Query 1703  TTGGCAAGAATGCCTCCTCATGGGTCTTCTCTCGCTGCAATAGTAACTTCGTGGTGAGACACAACAACAAGGAA  1776
            ||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..|.|||||||||||||||
Sbjct 1703  TTGGCAAGAATGCCTCTTCCTGGGTCTTCTCTCGATGCAACAGTAACTTCGTGGTTCGGCACAACAACAAGGAA  1776

Query 1777  ATGCTGGTGGATGTGCCCCCACACCTGAAGCGTCTGGGTGTCCTCCTGGATTATGACAACAATATGCTGTCTTT  1850
            |||||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1777  ATGCTGGTGGATGTGCCCCCACAGTTGAAGCGTCTAGGTGTCCTTCTGGATTATGACAACAACATGCTGTCTTT  1850

Query 1851  CTATGACCCAGCTAACTCTCTCCATCTTCATACTTTTGATGTGACCTTCATTCTTCCAGTTTGTCCAACATTTA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1851  CTATGACCCAGCTAACTCTCTCCATCTTCATACTTTTGATGTTACCTTCATTCTTCCAGTTTGTCCAACATTCA  1924

Query 1925  CAATCTGGAACAAATCCCTAATGATCCTGTCTGGCTTGCCTGCCCCAGATTTTATTGATTACCCTGAGCGGCAG  1998
            |||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1925  CAATCTGGAACAAATCCCTAATGATTCTTTCTGGCTTGCCTGCCCCTGATTTTATTGATTATCCTGAGCGGCAG  1998

Query 1999  GAATGCAACTGCAGGCCTCAAGAATCCCCTTATGTTTCTGGGATGAAAATCTGTCAT  2055
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||...||.|||
Sbjct 1999  GAATGCAACTGCAGGCCTCAAGAATCCCCTTATGTGTCAGGGATGAAAGCTTGCCAT  2055