Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14060
• Subject: NM_052817.3
• Aligned Length: 2115
• Identities: 2054
• Gaps: 60

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------------ATGGAAACACTGGA  14
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGTGAAAGCCCAGCCTCCGTGGTTCTTAATGCCTCAGGAGGACTATTTTCACTAAAGATGGAAACACTGGA  74

Query   15  GTCTGAATTGACCTGTCCAATCTGCCTAGAGTTGTTTGAAGACCCCCTTCTGCTCCCTTGTGCTCACAGCCTCT  88
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTCTGAATTGACCTGTCCAATCTGCCTAGAGTTGTTTGAAGACCCCCTTCTGCTCCCTTGTGCTCACAGCCTCT  148

Query   89  GCTTCAGCTGTGCCCATCGCATTTTGGTATCAAGCTGCAGCTCTGGTGAATCCATTGAACCCATTACTGCTTTC  162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCTTCAGCTGTGCCCATCGCATTTTGGTATCAAGCTGCAGCTCTGGTGAATCCATTGAACCCATTACTGCTTTC  222

Query  163  CAGTGTCCTACCTGCAGGTATGTTATCTCGCTGAACCACCGGGGCCTGGATGGCCTCAAGAGGAATGTGACTCT  236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGTGTCCTACCTGCAGGTATGTTATCTCGCTGAACCACCGGGGCCTGGATGGCCTCAAGAGGAATGTGACTCT  296

Query  237  GCAGAACATTATTGATCGCTTCCAGAAGGCTTCAGTCAGTGGGCCCAATTCCCCTAGTGAGAGCCGCCGGGAAA  310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAGAACATTATTGATCGCTTCCAGAAGGCTTCAGTCAGTGGGCCCAATTCCCCTAGTGAGAGCCGCCGGGAAA  370

Query  311  GGACTTACAGGCCCACCACTGCCATGTCTAGCGAGCGAATTGCTTGCCAATTCTGTGAGCAGGACCCGCCAAGG  384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGACTTACAGGCCCACCACTGCCATGTCTAGCGAGCGAATTGCTTGCCAATTCTGTGAGCAGGACCCGCCAAGG  444

Query  385  GATGCAGTAAAAACATGCATCACCTGTGAGGTCTCCTACTGTGACCGTTGCCTGCGGGCCACGCACCCCAACAA  458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATGCAGTAAAAACATGCATCACCTGTGAGGTCTCCTACTGTGACCGTTGCCTGCGGGCCACGCACCCCAACAA  518

Query  459  GAAACCTTTCACCAGCCACCGCCTGGTGGAACCAGTGCCAGACACACATCTTCGAGGGATCACCTGCCTGGACC  532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAACCTTTCACCAGCCACCGCCTGGTGGAACCAGTGCCAGACACACATCTTCGAGGGATCACCTGCCTGGACC  592

Query  533  ATGAGAATGAGAAAGTGAACATGTACTGTGTATCTGATGACCAATTGATCTGTGCCTTATGCAAACTGGTGGGT  606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGAGAATGAGAAAGTGAACATGTACTGTGTATCTGATGACCAATTGATCTGTGCCTTATGCAAACTGGTGGGT  666

Query  607  CGTCACCGAGACCATCAGGTCGCATCCCTGAATGATCGATTTGAGAAACTCAAGCAAACTCTGGAGATGAACCT  680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGTCACCGAGACCATCAGGTCGCATCCCTGAATGATCGATTTGAGAAACTCAAGCAAACTCTGGAGATGAACCT  740

Query  681  CACCAACCTGGTTAAGCGCAACAGCGAACTAGAAAATCAAATGGCCAAACTAATACAGATCTGCCAGCAGGTTG  754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CACCAACCTGGTTAAGCGCAACAGCGAACTAGAAAATCAAATGGCCAAACTAATACAGATCTGCCAGCAGGTTG  814

Query  755  AGGTGAATACTGCTATGCATGAGGCAAAACTTATGGAAGAATGTGACGAGTTGGTAGAGATCATCCAGCAGAGG  828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGTGAATACTGCTATGCATGAGGCAAAACTTATGGAAGAATGTGACGAGTTGGTAGAGATCATCCAGCAGAGG  888

Query  829  AAGCAAATGATCGCTGTCAAAATCAAAGAGACAAAGGTTATGAAACTGAGAAAGTTGGCACAGCAGGTTGCTAA  902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGCAAATGATCGCTGTCAAAATCAAAGAGACAAAGGTTATGAAACTGAGAAAGTTGGCACAGCAGGTTGCTAA  962

Query  903  TTGCCGCCAGTGTCTTGAACGGTCAACAGTCCTCATCAACCAAGCTGAGCATATCCTGAAAGAAAATGACCAGG  976
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTGCCGCCAGTGTCTTGAACGGTCAACAGTCCTCATCAACCAAGCTGAGCATATCCTGAAAGAAAATGACCAGG  1036

Query  977  CACGGTTTCTACAGTCTGCAAAAAATATTGCTGAGAGGGTCGCTATGGCAACTGCATCTTCTCAAGTTCTGATT  1050
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CACGGTTTCTACAGTCTGCAAAAAATATTGCTGAGAGGGTCGCTATGGCAACTGCATCTTCTCAAGTTCTGATT  1110

Query 1051  CCAGACATCAATTTTAATGATGCCTTTGAAAACTTTGCTTTAGATTTTTCCAGAGAAAAGAAACTGCTAGAGGG  1124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCAGACATCAATTTTAATGATGCCTTTGAAAACTTTGCTTTAGATTTTTCCAGAGAAAAGAAACTGCTAGAGGG  1184

Query 1125  GTTAGATTATTTAACAGCCCCAAACCCACCATCTATCCGAGAAGAACTCTGTACTGCCTCCCATGACACCATTA  1198
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTTAGATTATTTAACAGCCCCAAACCCACCATCTATCCGAGAAGAACTCTGTACTGCCTCCCATGACACCATTA  1258

Query 1199  CAGTCCACTGGATCTCGGATGATGAGTTCAGCATCAGCTCCTATGAGCTTCAGTACACCATATTCACTGGCCAG  1272
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGTCCACTGGATCTCGGATGATGAGTTCAGCATCAGCTCCTATGAGCTTCAGTACACCATATTCACTGGCCAG  1332

Query 1273  GCTAACTTCATCAGCCTGTATAATTCAGTAGACAGCTGGATGATTGTTCCCAACATTAAACAGAACCATTACAC  1346
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCTAACTTCATCAGCCTGTATAATTCAGTAGACAGCTGGATGATTGTTCCCAACATTAAACAGAACCATTACAC  1406

Query 1347  AGTGCATGGACTCCAGAGCGGGACTCGCTACATCTTCATCGTTAAAGCCATAAACCAAGCCGGCAGCCGGAACA  1420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGTGCATGGACTCCAGAGCGGGACTCGCTACATCTTCATCGTTAAAGCCATAAACCAAGCCGGCAGCCGGAACA  1480

Query 1421  GTGAACCTACCCGACTAAAAACAAACAGCCAACCCTTTAAATTGGATCCCAAAATGACTCACAAGAAGTTGAAG  1494
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTGAACCTACCCGACTAAAAACAAACAGCCAACCCTTTAAATTGGATCCCAAAATGACTCACAAGAAGTTGAAG  1554

Query 1495  ATCTCCAATGATGGATTGCAGATGGAGAAGGATGAAAGCTCTCTAAAGAAGAGCCACACCCCAGAGAGGTTTAG  1568
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATCTCCAATGATGGATTGCAGATGGAGAAGGATGAAAGCTCTCTAAAGAAGAGCCACACCCCAGAGAGGTTTAG  1628

Query 1569  TGGCACAGGGTGCTATGGGGCAGCAGGAAATATATTCATTGACAGTGGCTGCCACTATTGGGAGGTGGTCATGG  1642
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGGCACAGGGTGCTATGGGGCAGCAGGAAATATATTCATTGACAGTGGCTGCCACTATTGGGAGGTGGTCATGG  1702

Query 1643  GTTCCTCAACATGGTATGCAATTGGCATTGCCTACAAATCAGCTCCAAAGAATGAATGGATTGGCAAGAATGCC  1716
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTTCCTCAACATGGTATGCAATTGGCATTGCCTACAAATCAGCTCCAAAGAATGAATGGATTGGCAAGAATGCC  1776

Query 1717  TCCTCATGGGTCTTCTCTCGCTGCAATAGTAACTTCGTGGTGAGACACAACAACAAGGAAATGCTGGTGGATGT  1790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TCCTCATGGGTCTTCTCTCGCTGCAATAGTAACTTCGTGGTGAGACACAACAACAAGGAAATGCTGGTGGATGT  1850

Query 1791  GCCCCCACACCTGAAGCGTCTGGGTGTCCTCCTGGATTATGACAACAATATGCTGTCTTTCTATGACCCAGCTA  1864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCCCCCACACCTGAAGCGTCTGGGTGTCCTCCTGGATTATGACAACAATATGCTGTCTTTCTATGACCCAGCTA  1924

Query 1865  ACTCTCTCCATCTTCATACTTTTGATGTGACCTTCATTCTTCCAGTTTGTCCAACATTTACAATCTGGAACAAA  1938
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ACTCTCTCCATCTTCATACTTTTGATGTGACCTTCATTCTTCCAGTTTGTCCAACATTTACAATCTGGAACAAA  1998

Query 1939  TCCCTAATGATCCTGTCTGGCTTGCCTGCCCCAGATTTTATTGATTACCCTGAGCGGCAGGAATGCAACTGCAG  2012
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TCCCTAATGATCCTGTCTGGCTTGCCTGCCCCAGATTTTATTGATTACCCTGAGCGGCAGGAATGCAACTGCAG  2072

Query 2013  GCCTCAAGAATCCCCTTATGTTTCTGGGATGAAAATCTGTCAT  2055
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2073  GCCTCAAGAATCCCCTTATGTTTCTGGGATGAAAACCTGTCAT  2115