Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14060
• Subject: XM_005262062.5
• Aligned Length: 2145
• Identities: 2054
• Gaps: 90

Alignment

Query    1  ATGGAAACACTGGAGTCTGAATTGACCTGTCCAATCTGCCTAGAGTTGTTTGAAGACCCCCTTCTGCTCCCTTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAACACTGGAGTCTGAATTGACCTGTCCAATCTGCCTAGAGTTGTTTGAAGACCCCCTTCTGCTCCCTTG  74

Query   75  TGCTCACAGCCTCTGCTTCAGCTGTGCCCATCGCATTTTGGTATCAAGCTGCAGCTCTGGTGAATCCATTGAAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCTCACAGCCTCTGCTTCAGCTGTGCCCATCGCATTTTGGTATCAAGCTGCAGCTCTGGTGAATCCATTGAAC  148

Query  149  CCATTACTGCTTTCCAGTGTCCTACCTGCAGGTATGTTATCTCGCTGAACCACCGGGGCCTGGATGGCCTCAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCATTACTGCTTTCCAGTGTCCTACCTGCAGGTATGTTATCTCGCTGAACCACCGGGGCCTGGATGGCCTCAAG  222

Query  223  AGGAATGTGACTCTGCAGAACATTATTGATCGCTTCCAGAAGGCTTCAGTCAGTGGGCCCAATTCCCCTAGTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGGAATGTGACTCTGCAGAACATTATTGATCGCTTCCAGAAGGCTTCAGTCAGTGGGCCCAATTCCCCTAGTGA  296

Query  297  GAGCCGCCGGGAAAGGACTTACAGGCCCACCACTGCCATGTCTAGCGAGCGAATTGCTTGCCAATTCTGTGAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAGCCGCCGGGAAAGGACTTACAGGCCCACCACTGCCATGTCTAGCGAGCGAATTGCTTGCCAATTCTGTGAGC  370

Query  371  AGGACCCGCCAAGGGATGCAGTAAAAACATGCATCACCTGTGAGGTCTCCTACTGTGACCGTTGCCTGCGGGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGACCCGCCAAGGGATGCAGTAAAAACATGCATCACCTGTGAGGTCTCCTACTGTGACCGTTGCCTGCGGGCC  444

Query  445  ACGCACCCCAACAAGAAACCTTTCACCAGCCACCGCCTGGTGGAACCAGTGCCAGACACACATCTTCGAGGGAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACGCACCCCAACAAGAAACCTTTCACCAGCCACCGCCTGGTGGAACCAGTGCCAGACACACATCTTCGAGGGAT  518

Query  519  CACCTGCCTGGACCATGAGAATGAGAAAGTGAACATGTACTGTGTATCTGATGACCAATTGATCTGTGCCTTAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACCTGCCTGGACCATGAGAATGAGAAAGTGAACATGTACTGTGTATCTGATGACCAATTGATCTGTGCCTTAT  592

Query  593  GCAAACTGGTGGGTCGTCACCGAGACCATCAGGTCGCATCCCTGAATGATCGATTTGAGAAACTCAAGCAAACT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCAAACTGGTGGGTCGTCACCGAGACCATCAGGTCGCATCCCTGAATGATCGATTTGAGAAACTCAAGCAAACT  666

Query  667  CTGGAGATGAACCTCACCAACCTGGTTAAGCGCAACAGCGAACTAGAAAATCAAATGGCCAAACTAATACAGAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGGAGATGAACCTCACCAACCTGGTTAAGCGCAACAGCGAACTAGAAAATCAAATGGCCAAACTAATACAGAT  740

Query  741  CTGCCAGCAGGTTGAGGTGAATACTGCTATGCATGAGGCAAAACTTATGGAAGAATGTGACGAGTTGGTAGAGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGCCAGCAGGTTGAGGTGAATACTGCTATGCATGAGGCAAAACTTATGGAAGAATGTGACGAGTTGGTAGAGA  814

Query  815  TCATCCAGCAGAGGAAGCAAATGATCGCTGTCAAAATCAAAGAGACAAAGGTTATGAAACTGAGAAAGTTGGCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCATCCAGCAGAGGAAGCAAATGATCGCTGTCAAAATCAAAGAGACAAAGGTTATGAAACTGAGAAAGTTGGCA  888

Query  889  CAGCAGGTTGCTAATTGCCGCCAGTGTCTTGAACGGTCAACAGTCCTCATCAACCAAGCTGAGCATATCCTGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGCAGGTTGCTAATTGCCGCCAGTGTCTTGAACGGTCAACAGTCCTCATCAACCAAGCTGAGCATATCCTGAA  962

Query  963  AGAAAATGACCAGGCACGGTTTCTACAGTCTGCAAAAAATATTGCTGAGAGGGTCGCTATGGCAACTGCATCTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGAAAATGACCAGGCACGGTTTCTACAGTCTGCAAAAAATATTGCTGAGAGGGTCGCTATGGCAACTGCATCTT  1036

Query 1037  CTCAAGTTCTGATTCCAGACATCAATTTTAATGATGCCTTTGAAAACTTTGCTTTAGATTTTTCCAGAGAAAAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCAAGTTCTGATTCCAGACATCAATTTTAATGATGCCTTTGAAAACTTTGCTTTAGATTTTTCCAGAGAAAAG  1110

Query 1111  AAACTGCTAGAGGGGTTAGATTATTTAACAGCCCCAAACCCACCATCTATCCGAGAAGAACTCTGTACTGCCTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAACTGCTAGAGGGGTTAGATTATTTAACAGCCCCAAACCCACCATCTATCCGAGAAGAACTCTGTACTGCCTC  1184

Query 1185  CCATGACACCATTACAGTCCACTGGATCTCGGATGATGAGTTCAGCATCAGCTCCTATGAGCTTCAGTACACCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCATGACACCATTACAGTCCACTGGATCTCGGATGATGAGTTCAGCATCAGCTCCTATGAGCTTCAGTACACCA  1258

Query 1259  TATTCACTGGCCAGGCTAACTTCATCA-----------------------------------------------  1285
            |||||||||||||||||||||||||||                                               
Sbjct 1259  TATTCACTGGCCAGGCTAACTTCATCAGTAAGTCATGGTGTAGTTGGGGCCTGTGGCCAGAGATAAGGAAATGT  1332

Query 1286  -------------------------------------------GCCTGTATAATTCAGTAGACAGCTGGATGAT  1316
                                                       |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGGAAGCAGTAAGCTGCTCAAGATTGGCCGGGGCGCCACGAGGCCTGTATAATTCAGTAGACAGCTGGATGAT  1406

Query 1317  TGTTCCCAACATTAAACAGAACCATTACACAGTGCATGGACTCCAGAGCGGGACTCGCTACATCTTCATCGTTA  1390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGTTCCCAACATTAAACAGAACCATTACACAGTGCATGGACTCCAGAGCGGGACTCGCTACATCTTCATCGTTA  1480

Query 1391  AAGCCATAAACCAAGCCGGCAGCCGGAACAGTGAACCTACCCGACTAAAAACAAACAGCCAACCCTTTAAATTG  1464
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AAGCCATAAACCAAGCCGGCAGCCGGAACAGTGAACCTACCCGACTAAAAACAAACAGCCAACCCTTTAAATTG  1554

Query 1465  GATCCCAAAATGACTCACAAGAAGTTGAAGATCTCCAATGATGGATTGCAGATGGAGAAGGATGAAAGCTCTCT  1538
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GATCCCAAAATGACTCACAAGAAGTTGAAGATCTCCAATGATGGATTGCAGATGGAGAAGGATGAAAGCTCTCT  1628

Query 1539  AAAGAAGAGCCACACCCCAGAGAGGTTTAGTGGCACAGGGTGCTATGGGGCAGCAGGAAATATATTCATTGACA  1612
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AAAGAAGAGCCACACCCCAGAGAGGTTTAGTGGCACAGGGTGCTATGGGGCAGCAGGAAATATATTCATTGACA  1702

Query 1613  GTGGCTGCCACTATTGGGAGGTGGTCATGGGTTCCTCAACATGGTATGCAATTGGCATTGCCTACAAATCAGCT  1686
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTGGCTGCCACTATTGGGAGGTGGTCATGGGTTCCTCAACATGGTATGCAATTGGCATTGCCTACAAATCAGCT  1776

Query 1687  CCAAAGAATGAATGGATTGGCAAGAATGCCTCCTCATGGGTCTTCTCTCGCTGCAATAGTAACTTCGTGGTGAG  1760
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CCAAAGAATGAATGGATTGGCAAGAATGCCTCCTCATGGGTCTTCTCTCGCTGCAATAGTAACTTCGTGGTGAG  1850

Query 1761  ACACAACAACAAGGAAATGCTGGTGGATGTGCCCCCACACCTGAAGCGTCTGGGTGTCCTCCTGGATTATGACA  1834
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ACACAACAACAAGGAAATGCTGGTGGATGTGCCCCCACACCTGAAGCGTCTGGGTGTCCTCCTGGATTATGACA  1924

Query 1835  ACAATATGCTGTCTTTCTATGACCCAGCTAACTCTCTCCATCTTCATACTTTTGATGTGACCTTCATTCTTCCA  1908
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ACAATATGCTGTCTTTCTATGACCCAGCTAACTCTCTCCATCTTCATACTTTTGATGTGACCTTCATTCTTCCA  1998

Query 1909  GTTTGTCCAACATTTACAATCTGGAACAAATCCCTAATGATCCTGTCTGGCTTGCCTGCCCCAGATTTTATTGA  1982
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GTTTGTCCAACATTTACAATCTGGAACAAATCCCTAATGATCCTGTCTGGCTTGCCTGCCCCAGATTTTATTGA  2072

Query 1983  TTACCCTGAGCGGCAGGAATGCAACTGCAGGCCTCAAGAATCCCCTTATGTTTCTGGGATGAAAATCTGTCAT  2055
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2073  TTACCCTGAGCGGCAGGAATGCAACTGCAGGCCTCAAGAATCCCCTTATGTTTCTGGGATGAAAACCTGTCAT  2145