Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14060
• Subject: XM_006528522.3
• Aligned Length: 2205
• Identities: 1932
• Gaps: 150

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------------ATGGAAACACTGGA  14
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGTGAGAGCCCAGCCTCTGCGGTTCTTAATGCCTCAGCAGGATTATTTTCACTAAAGATGGAAACACTGGA  74

Query   15  GTCTGAATTGACCTGTCCAATCTGCCTAGAGTTGTTTGAAGACCCCCTTCTGCTCCCTTGTGCTCACAGCCTCT  88
            |||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct   75  GTCAGAATTGACCTGTCCAATCTGCCTCGAGTTGTTTGAAGACCCCCTTCTGCTTCCTTGTGCTCACAGCCTAT  148

Query   89  GCTTCAGCTGTGCCCATCGCATTTTGGTATCAAGCTGCAGCTCTGGTGAATCCATTGAACCCATTACTGCTTTC  162
            |.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTTTTAGCTGTGCCCACCGCATCTTGGTCTCAAGCTGCAGCTCTGGTGAATCCATTGAACCCATTACTGCTTTC  222

Query  163  CAGTGTCCTACCTGCAGGTATGTTATCTCGCTGAACCACCGGGGCCTGGATGGCCTCAAGAGGAATGTGACTCT  236
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  CAGTGTCCTACATGCAGGTATGTTATCTCGCTGAATCACCGGGGCCTGGATGGCCTCAAGAGGAATGTGACCCT  296

Query  237  GCAGAACATTATTGATCGCTTCCAGAAGGCTTCAGTCAGTGGGCCCAATTCCCCTAGTGAGAGCCGCCGGGAAA  310
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  297  GCAGAACATTATTGATCGCTTCCAGAAGGCTTCAGTCAGTGGGCCCAATTCTCCAAGTGAGAGCCGCCGGGAGA  370

Query  311  GGACTTACAGGCCCACCACTGCCATGTCTAGCGAGCGAATTGCTTGCCAATTCTGTGAGCAGGACCCGCCAAGG  384
            |||||||||||||.|.|.|.||||||||.||.|||.|||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct  371  GGACTTACAGGCCTAGCTCCGCCATGTCGAGTGAGAGAATTGCATGTCAATTCTGTGAGCAGGACCCTCCGAGA  444

Query  385  GATGCAGTAAAAACATGCATCACCTGTGAGGTCTCCTACTGTGACCGTTGCCTGCGGGCCACGCACCCCAACAA  458
            |||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  445  GATGCTGTAAAGACGTGCATCACCTGTGAGGTCTCCTACTGTGACCGTTGCCTTCGGGCCACACACCCCAACAA  518

Query  459  GAAACCTTTCACCAGCCACCGCCTGGTGGAACCAGTGCCAGACACACATCTTCGAGGGATCACCTGCCTGGACC  532
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  GAAACCTTTCACCAGCCATCGCCTGGTGGAACCAGTTTCAGACACACATCTTCGAGGGATTACCTGCCTGGACC  592

Query  533  ATGAGAATGAGAAAGTGAACATGTACTGTGTATCTGATGACCAATTGATCTGTGCCTTATGCAAACTGGTGGGT  606
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACGAGAATGAGAAGGTGAACATGTACTGTGTATCTGATGATCAATTGATCTGTGCCTTATGCAAACTGGTGGGT  666

Query  607  CGTCACCGAGACCATCAGGTCGCATCCCTGAATGATCGATTTGAGAAACTCAAGCAAACTCTGGAGATGAACCT  680
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  CGTCACCGAGACCATCAGGTCGCTTCTCTGAATGATCGATTTGAGAAACTAAAGCAAACTCTCGAGATGAACCT  740

Query  681  CACCAACCTGGTTAAGCGCAACAGCGAACTAGAAAATCAAATGGCCAAACTAATACAGATCTGCCAGCAGGTTG  754
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  CACCAACCTGGTTAAGCGCAACAGTGAACTAGAAAATCAAATGGCCAAACTAATACAGATCTGCCAGCAAGTTG  814

Query  755  AGGTGAATACTGCTATGCATGAGGCAAAACTTATGGAAGAATGTGACGAGTTGGTAGAGATCATCCAGCAGAGG  828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGTGAATACTGCTATGCATGAGGCAAAACTTATGGAAGAATGTGACGAGTTGGTAGAGATCATCCAGCAGAGG  888

Query  829  AAGCAAATGATCGCTGTCAAAATCAAAGAGACAAAGGTTATGAAACTGAGAAAGTTGGCACAGCAGGTTGCTAA  902
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAACAAATGATTGCTGTCAAAATCAAAGAGACAAAGGTTATGAAACTGAGAAAGTTGGCACAGCAGGTTGCTAA  962

Query  903  TTGCCGCCAGTGTCTTGAACGGTCAACAGTCCTCATCAACCAAGCTGAGCATATCCTGAAAGAAAATGACCAGG  976
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct  963  TTGCCGCCAGTGTCTTGAGCGGTCAACAGTCCTCATCAACCAAGCTGAGCATATCCTAAAGGAAAATGACCAAG  1036

Query  977  CACGGTTTCTACAGTCTGCAAAAAATATTGCTGAGAGGGTCGCTATGGCAACTGCATCTTCTCAAGTTCTGATT  1050
            ||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1037  CACGGTTTCTGCAGTCTGCAAAAAACATTGCCGAGAGGGTCGCTATGGCAACTGCATCTTCGCAAGTTCTGATT  1110

Query 1051  CCAGACATCAATTTTAATGATGCCTTTGAAAACTTTGCTTTAGATTTTTCCAGAGAAAAGAAACTGCTAGAGGG  1124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..|.|||||
Sbjct 1111  CCAGACATCAATTTTAATGATGCCTTTGAAAACTTTGCTTTAGATTTTTCTAGAGAAAAGAAACTATTGGAGGG  1184

Query 1125  GTTAGATTATTTAACAGCCCCAAACCCACCATCTATCCGAGAAGAACTCTGTACTGCCTCCCATGACACCATTA  1198
            |.||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCTAGACTATTTAACAGCTCCAAACCCACCATCTATCCGAGAAGAGCTCTGTACTGCTTCCCATGACACCATTA  1258

Query 1199  CAGTCCACTGGATCTCGGATGATGAGTTCAGCATCAGCTCCTATGAGCTTCAGTACACCATATTCACTGGCCAG  1272
            ||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGTCCACTGGATCTCAGACGACGAATTCAGCATCAGCTCCTATGAGCTTCAGTACACCATATTCACTGGCCAG  1332

Query 1273  GCTAACTTCATCA-------------------------------------------------------------  1285
            |||||||||||||                                                             
Sbjct 1333  GCTAACTTCATCAGTAAGTCATGGTGTAGTTGGGGCCTGTGGCCAGAGATAAGGAAATGTAAGGAAGCAGTAAG  1406

Query 1286  -----------------------------GCCTGTATAATTCAGTAGACAGCTGGATGATTGTTCCCAACATTA  1330
                                         |||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1407  CTGCTCAAGATTGGCCGGTGCGCCACGAGGCCTGTACAATTCAGTGGATAGCTGGATGATTGTGCCCAACATTA  1480

Query 1331  AACAGAACCATTACACAGTGCATGGACTCCAGAGCGGGACTCGCTACATCTTCATCGTTAAAGCCATAAACCAA  1404
            |.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1481  AGCAGAACCATTACACAGTTCATGGACTCCAGAGTGGGACACGCTACATCTTTATCGTGAAAGCCATAAATCAA  1554

Query 1405  GCCGGCAGCCGGAACAGTGAACCTACCCGACTAAAAACAAACAGCCAACCCTTTAAATTGGATCCCAAAATGAC  1478
            ||.||||||||||||||.|||||.|||.||||||||||.|||||||||||.||||||.|.||||||||||||||
Sbjct 1555  GCAGGCAGCCGGAACAGCGAACCCACCAGACTAAAAACGAACAGCCAACCATTTAAACTAGATCCCAAAATGAC  1628

Query 1479  TCACAAGAAGTTGAAGATCTCCAATGATGGATTGCAGATGGAGAAGGATGAAAGCTCTCTAAAGAAGAGCCACA  1552
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1629  TCACAAGAAGTTGAAGATCTCCAATGATGGATTGCAGATGGAGAAGGATGAGAGCTCTCTGAAGAAGAGCCACA  1702

Query 1553  CCCCAGAGAGGTTTAGTGGCACAGGGTGCTATGGGGCAGCAGGAAATATATTCATTGACAGTGGCTGCCACTAT  1626
            |.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1703  CTCCGGAGAGATTTAGTGGCACAGGGTGTTATGGGGCAGCAGGAAATATATTCATCGACAGTGGCTGCCACTAC  1776

Query 1627  TGGGAGGTGGTCATGGGTTCCTCAACATGGTATGCAATTGGCATTGCCTACAAATCAGCTCCAAAGAATGAATG  1700
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1777  TGGGAGGTGGTCATGGGTTCTTCAACATGGTATGCTATTGGTATTGCCTACAAATCAGCTCCAAAGAATGAGTG  1850

Query 1701  GATTGGCAAGAATGCCTCCTCATGGGTCTTCTCTCGCTGCAATAGTAACTTCGTGGTGAGACACAACAACAAGG  1774
            ||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..|.|||||||||||||
Sbjct 1851  GATTGGCAAGAATGCCTCTTCCTGGGTCTTCTCTCGATGCAACAGTAACTTCGTGGTTCGGCACAACAACAAGG  1924

Query 1775  AAATGCTGGTGGATGTGCCCCCACACCTGAAGCGTCTGGGTGTCCTCCTGGATTATGACAACAATATGCTGTCT  1848
            |||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1925  AAATGCTGGTGGATGTGCCCCCACAGTTGAAGCGTCTAGGTGTCCTTCTGGATTATGACAACAACATGCTGTCT  1998

Query 1849  TTCTATGACCCAGCTAACTCTCTCCATCTTCATACTTTTGATGTGACCTTCATTCTTCCAGTTTGTCCAACATT  1922
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TTCTATGACCCAGCTAACTCTCTCCATCTTCATACTTTTGATGTTACCTTCATTCTTCCAGTTTGTCCAACATT  2072

Query 1923  TACAATCTGGAACAAATCCCTAATGATCCTGTCTGGCTTGCCTGCCCCAGATTTTATTGATTACCCTGAGCGGC  1996
            .||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2073  CACAATCTGGAACAAATCCCTAATGATTCTTTCTGGCTTGCCTGCCCCTGATTTTATTGATTATCCTGAGCGGC  2146

Query 1997  AGGAATGCAACTGCAGGCCTCAAGAATCCCCTTATGTTTCTGGGATGAAAATCTGTCAT  2055
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||...||.|||
Sbjct 2147  AGGAATGCAACTGCAGGCCTCAAGAATCCCCTTATGTGTCAGGGATGAAAGCTTGCCAT  2205