Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14060
- Subject:
- XM_006528523.3
- Aligned Length:
- 2115
- Identities:
- 1932
- Gaps:
- 60
Alignment
Query 1 ------------------------------------------------------------ATGGAAACACTGGA 14
||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGTGAGAGCCCAGCCTCTGCGGTTCTTAATGCCTCAGCAGGATTATTTTCACTAAAGATGGAAACACTGGA 74
Query 15 GTCTGAATTGACCTGTCCAATCTGCCTAGAGTTGTTTGAAGACCCCCTTCTGCTCCCTTGTGCTCACAGCCTCT 88
|||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 75 GTCAGAATTGACCTGTCCAATCTGCCTCGAGTTGTTTGAAGACCCCCTTCTGCTTCCTTGTGCTCACAGCCTAT 148
Query 89 GCTTCAGCTGTGCCCATCGCATTTTGGTATCAAGCTGCAGCTCTGGTGAATCCATTGAACCCATTACTGCTTTC 162
|.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GTTTTAGCTGTGCCCACCGCATCTTGGTCTCAAGCTGCAGCTCTGGTGAATCCATTGAACCCATTACTGCTTTC 222
Query 163 CAGTGTCCTACCTGCAGGTATGTTATCTCGCTGAACCACCGGGGCCTGGATGGCCTCAAGAGGAATGTGACTCT 236
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 223 CAGTGTCCTACATGCAGGTATGTTATCTCGCTGAATCACCGGGGCCTGGATGGCCTCAAGAGGAATGTGACCCT 296
Query 237 GCAGAACATTATTGATCGCTTCCAGAAGGCTTCAGTCAGTGGGCCCAATTCCCCTAGTGAGAGCCGCCGGGAAA 310
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 297 GCAGAACATTATTGATCGCTTCCAGAAGGCTTCAGTCAGTGGGCCCAATTCTCCAAGTGAGAGCCGCCGGGAGA 370
Query 311 GGACTTACAGGCCCACCACTGCCATGTCTAGCGAGCGAATTGCTTGCCAATTCTGTGAGCAGGACCCGCCAAGG 384
|||||||||||||.|.|.|.||||||||.||.|||.|||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 371 GGACTTACAGGCCTAGCTCCGCCATGTCGAGTGAGAGAATTGCATGTCAATTCTGTGAGCAGGACCCTCCGAGA 444
Query 385 GATGCAGTAAAAACATGCATCACCTGTGAGGTCTCCTACTGTGACCGTTGCCTGCGGGCCACGCACCCCAACAA 458
|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 445 GATGCTGTAAAGACGTGCATCACCTGTGAGGTCTCCTACTGTGACCGTTGCCTTCGGGCCACACACCCCAACAA 518
Query 459 GAAACCTTTCACCAGCCACCGCCTGGTGGAACCAGTGCCAGACACACATCTTCGAGGGATCACCTGCCTGGACC 532
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 519 GAAACCTTTCACCAGCCATCGCCTGGTGGAACCAGTTTCAGACACACATCTTCGAGGGATTACCTGCCTGGACC 592
Query 533 ATGAGAATGAGAAAGTGAACATGTACTGTGTATCTGATGACCAATTGATCTGTGCCTTATGCAAACTGGTGGGT 606
|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACGAGAATGAGAAGGTGAACATGTACTGTGTATCTGATGATCAATTGATCTGTGCCTTATGCAAACTGGTGGGT 666
Query 607 CGTCACCGAGACCATCAGGTCGCATCCCTGAATGATCGATTTGAGAAACTCAAGCAAACTCTGGAGATGAACCT 680
|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 667 CGTCACCGAGACCATCAGGTCGCTTCTCTGAATGATCGATTTGAGAAACTAAAGCAAACTCTCGAGATGAACCT 740
Query 681 CACCAACCTGGTTAAGCGCAACAGCGAACTAGAAAATCAAATGGCCAAACTAATACAGATCTGCCAGCAGGTTG 754
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 741 CACCAACCTGGTTAAGCGCAACAGTGAACTAGAAAATCAAATGGCCAAACTAATACAGATCTGCCAGCAAGTTG 814
Query 755 AGGTGAATACTGCTATGCATGAGGCAAAACTTATGGAAGAATGTGACGAGTTGGTAGAGATCATCCAGCAGAGG 828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGGTGAATACTGCTATGCATGAGGCAAAACTTATGGAAGAATGTGACGAGTTGGTAGAGATCATCCAGCAGAGG 888
Query 829 AAGCAAATGATCGCTGTCAAAATCAAAGAGACAAAGGTTATGAAACTGAGAAAGTTGGCACAGCAGGTTGCTAA 902
||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAACAAATGATTGCTGTCAAAATCAAAGAGACAAAGGTTATGAAACTGAGAAAGTTGGCACAGCAGGTTGCTAA 962
Query 903 TTGCCGCCAGTGTCTTGAACGGTCAACAGTCCTCATCAACCAAGCTGAGCATATCCTGAAAGAAAATGACCAGG 976
||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct 963 TTGCCGCCAGTGTCTTGAGCGGTCAACAGTCCTCATCAACCAAGCTGAGCATATCCTAAAGGAAAATGACCAAG 1036
Query 977 CACGGTTTCTACAGTCTGCAAAAAATATTGCTGAGAGGGTCGCTATGGCAACTGCATCTTCTCAAGTTCTGATT 1050
||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1037 CACGGTTTCTGCAGTCTGCAAAAAACATTGCCGAGAGGGTCGCTATGGCAACTGCATCTTCGCAAGTTCTGATT 1110
Query 1051 CCAGACATCAATTTTAATGATGCCTTTGAAAACTTTGCTTTAGATTTTTCCAGAGAAAAGAAACTGCTAGAGGG 1124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..|.|||||
Sbjct 1111 CCAGACATCAATTTTAATGATGCCTTTGAAAACTTTGCTTTAGATTTTTCTAGAGAAAAGAAACTATTGGAGGG 1184
Query 1125 GTTAGATTATTTAACAGCCCCAAACCCACCATCTATCCGAGAAGAACTCTGTACTGCCTCCCATGACACCATTA 1198
|.||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCTAGACTATTTAACAGCTCCAAACCCACCATCTATCCGAGAAGAGCTCTGTACTGCTTCCCATGACACCATTA 1258
Query 1199 CAGTCCACTGGATCTCGGATGATGAGTTCAGCATCAGCTCCTATGAGCTTCAGTACACCATATTCACTGGCCAG 1272
||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CAGTCCACTGGATCTCAGACGACGAATTCAGCATCAGCTCCTATGAGCTTCAGTACACCATATTCACTGGCCAG 1332
Query 1273 GCTAACTTCATCAGCCTGTATAATTCAGTAGACAGCTGGATGATTGTTCCCAACATTAAACAGAACCATTACAC 1346
||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1333 GCTAACTTCATCAGCCTGTACAATTCAGTGGATAGCTGGATGATTGTGCCCAACATTAAGCAGAACCATTACAC 1406
Query 1347 AGTGCATGGACTCCAGAGCGGGACTCGCTACATCTTCATCGTTAAAGCCATAAACCAAGCCGGCAGCCGGAACA 1420
|||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1407 AGTTCATGGACTCCAGAGTGGGACACGCTACATCTTTATCGTGAAAGCCATAAATCAAGCAGGCAGCCGGAACA 1480
Query 1421 GTGAACCTACCCGACTAAAAACAAACAGCCAACCCTTTAAATTGGATCCCAAAATGACTCACAAGAAGTTGAAG 1494
|.|||||.|||.||||||||||.|||||||||||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GCGAACCCACCAGACTAAAAACGAACAGCCAACCATTTAAACTAGATCCCAAAATGACTCACAAGAAGTTGAAG 1554
Query 1495 ATCTCCAATGATGGATTGCAGATGGAGAAGGATGAAAGCTCTCTAAAGAAGAGCCACACCCCAGAGAGGTTTAG 1568
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 1555 ATCTCCAATGATGGATTGCAGATGGAGAAGGATGAGAGCTCTCTGAAGAAGAGCCACACTCCGGAGAGATTTAG 1628
Query 1569 TGGCACAGGGTGCTATGGGGCAGCAGGAAATATATTCATTGACAGTGGCTGCCACTATTGGGAGGTGGTCATGG 1642
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1629 TGGCACAGGGTGTTATGGGGCAGCAGGAAATATATTCATCGACAGTGGCTGCCACTACTGGGAGGTGGTCATGG 1702
Query 1643 GTTCCTCAACATGGTATGCAATTGGCATTGCCTACAAATCAGCTCCAAAGAATGAATGGATTGGCAAGAATGCC 1716
||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GTTCTTCAACATGGTATGCTATTGGTATTGCCTACAAATCAGCTCCAAAGAATGAGTGGATTGGCAAGAATGCC 1776
Query 1717 TCCTCATGGGTCTTCTCTCGCTGCAATAGTAACTTCGTGGTGAGACACAACAACAAGGAAATGCTGGTGGATGT 1790
||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TCTTCCTGGGTCTTCTCTCGATGCAACAGTAACTTCGTGGTTCGGCACAACAACAAGGAAATGCTGGTGGATGT 1850
Query 1791 GCCCCCACACCTGAAGCGTCTGGGTGTCCTCCTGGATTATGACAACAATATGCTGTCTTTCTATGACCCAGCTA 1864
|||||||||..||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GCCCCCACAGTTGAAGCGTCTAGGTGTCCTTCTGGATTATGACAACAACATGCTGTCTTTCTATGACCCAGCTA 1924
Query 1865 ACTCTCTCCATCTTCATACTTTTGATGTGACCTTCATTCTTCCAGTTTGTCCAACATTTACAATCTGGAACAAA 1938
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1925 ACTCTCTCCATCTTCATACTTTTGATGTTACCTTCATTCTTCCAGTTTGTCCAACATTCACAATCTGGAACAAA 1998
Query 1939 TCCCTAATGATCCTGTCTGGCTTGCCTGCCCCAGATTTTATTGATTACCCTGAGCGGCAGGAATGCAACTGCAG 2012
|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TCCCTAATGATTCTTTCTGGCTTGCCTGCCCCTGATTTTATTGATTATCCTGAGCGGCAGGAATGCAACTGCAG 2072
Query 2013 GCCTCAAGAATCCCCTTATGTTTCTGGGATGAAAATCTGTCAT 2055
|||||||||||||||||||||.||.|||||||||...||.|||
Sbjct 2073 GCCTCAAGAATCCCCTTATGTGTCAGGGATGAAAGCTTGCCAT 2115