Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14060
• Subject: XM_006528524.3
• Aligned Length: 2145
• Identities: 1932
• Gaps: 90

Alignment

Query    1  ATGGAAACACTGGAGTCTGAATTGACCTGTCCAATCTGCCTAGAGTTGTTTGAAGACCCCCTTCTGCTCCCTTG  74
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGAAACACTGGAGTCAGAATTGACCTGTCCAATCTGCCTCGAGTTGTTTGAAGACCCCCTTCTGCTTCCTTG  74

Query   75  TGCTCACAGCCTCTGCTTCAGCTGTGCCCATCGCATTTTGGTATCAAGCTGCAGCTCTGGTGAATCCATTGAAC  148
            ||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCTCACAGCCTATGTTTTAGCTGTGCCCACCGCATCTTGGTCTCAAGCTGCAGCTCTGGTGAATCCATTGAAC  148

Query  149  CCATTACTGCTTTCCAGTGTCCTACCTGCAGGTATGTTATCTCGCTGAACCACCGGGGCCTGGATGGCCTCAAG  222
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCATTACTGCTTTCCAGTGTCCTACATGCAGGTATGTTATCTCGCTGAATCACCGGGGCCTGGATGGCCTCAAG  222

Query  223  AGGAATGTGACTCTGCAGAACATTATTGATCGCTTCCAGAAGGCTTCAGTCAGTGGGCCCAATTCCCCTAGTGA  296
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  223  AGGAATGTGACCCTGCAGAACATTATTGATCGCTTCCAGAAGGCTTCAGTCAGTGGGCCCAATTCTCCAAGTGA  296

Query  297  GAGCCGCCGGGAAAGGACTTACAGGCCCACCACTGCCATGTCTAGCGAGCGAATTGCTTGCCAATTCTGTGAGC  370
            ||||||||||||.||||||||||||||.|.|.|.||||||||.||.|||.|||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  297  GAGCCGCCGGGAGAGGACTTACAGGCCTAGCTCCGCCATGTCGAGTGAGAGAATTGCATGTCAATTCTGTGAGC  370

Query  371  AGGACCCGCCAAGGGATGCAGTAAAAACATGCATCACCTGTGAGGTCTCCTACTGTGACCGTTGCCTGCGGGCC  444
            |||||||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  371  AGGACCCTCCGAGAGATGCTGTAAAGACGTGCATCACCTGTGAGGTCTCCTACTGTGACCGTTGCCTTCGGGCC  444

Query  445  ACGCACCCCAACAAGAAACCTTTCACCAGCCACCGCCTGGTGGAACCAGTGCCAGACACACATCTTCGAGGGAT  518
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACACACCCCAACAAGAAACCTTTCACCAGCCATCGCCTGGTGGAACCAGTTTCAGACACACATCTTCGAGGGAT  518

Query  519  CACCTGCCTGGACCATGAGAATGAGAAAGTGAACATGTACTGTGTATCTGATGACCAATTGATCTGTGCCTTAT  592
            .||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  519  TACCTGCCTGGACCACGAGAATGAGAAGGTGAACATGTACTGTGTATCTGATGATCAATTGATCTGTGCCTTAT  592

Query  593  GCAAACTGGTGGGTCGTCACCGAGACCATCAGGTCGCATCCCTGAATGATCGATTTGAGAAACTCAAGCAAACT  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  593  GCAAACTGGTGGGTCGTCACCGAGACCATCAGGTCGCTTCTCTGAATGATCGATTTGAGAAACTAAAGCAAACT  666

Query  667  CTGGAGATGAACCTCACCAACCTGGTTAAGCGCAACAGCGAACTAGAAAATCAAATGGCCAAACTAATACAGAT  740
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTCGAGATGAACCTCACCAACCTGGTTAAGCGCAACAGTGAACTAGAAAATCAAATGGCCAAACTAATACAGAT  740

Query  741  CTGCCAGCAGGTTGAGGTGAATACTGCTATGCATGAGGCAAAACTTATGGAAGAATGTGACGAGTTGGTAGAGA  814
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGCCAGCAAGTTGAGGTGAATACTGCTATGCATGAGGCAAAACTTATGGAAGAATGTGACGAGTTGGTAGAGA  814

Query  815  TCATCCAGCAGAGGAAGCAAATGATCGCTGTCAAAATCAAAGAGACAAAGGTTATGAAACTGAGAAAGTTGGCA  888
            ||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCATCCAGCAGAGGAAACAAATGATTGCTGTCAAAATCAAAGAGACAAAGGTTATGAAACTGAGAAAGTTGGCA  888

Query  889  CAGCAGGTTGCTAATTGCCGCCAGTGTCTTGAACGGTCAACAGTCCTCATCAACCAAGCTGAGCATATCCTGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  889  CAGCAGGTTGCTAATTGCCGCCAGTGTCTTGAGCGGTCAACAGTCCTCATCAACCAAGCTGAGCATATCCTAAA  962

Query  963  AGAAAATGACCAGGCACGGTTTCTACAGTCTGCAAAAAATATTGCTGAGAGGGTCGCTATGGCAACTGCATCTT  1036
            .|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAAAATGACCAAGCACGGTTTCTGCAGTCTGCAAAAAACATTGCCGAGAGGGTCGCTATGGCAACTGCATCTT  1036

Query 1037  CTCAAGTTCTGATTCCAGACATCAATTTTAATGATGCCTTTGAAAACTTTGCTTTAGATTTTTCCAGAGAAAAG  1110
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037  CGCAAGTTCTGATTCCAGACATCAATTTTAATGATGCCTTTGAAAACTTTGCTTTAGATTTTTCTAGAGAAAAG  1110

Query 1111  AAACTGCTAGAGGGGTTAGATTATTTAACAGCCCCAAACCCACCATCTATCCGAGAAGAACTCTGTACTGCCTC  1184
            |||||..|.||||||.||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1111  AAACTATTGGAGGGGCTAGACTATTTAACAGCTCCAAACCCACCATCTATCCGAGAAGAGCTCTGTACTGCTTC  1184

Query 1185  CCATGACACCATTACAGTCCACTGGATCTCGGATGATGAGTTCAGCATCAGCTCCTATGAGCTTCAGTACACCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCATGACACCATTACAGTCCACTGGATCTCAGACGACGAATTCAGCATCAGCTCCTATGAGCTTCAGTACACCA  1258

Query 1259  TATTCACTGGCCAGGCTAACTTCATCA-----------------------------------------------  1285
            |||||||||||||||||||||||||||                                               
Sbjct 1259  TATTCACTGGCCAGGCTAACTTCATCAGTAAGTCATGGTGTAGTTGGGGCCTGTGGCCAGAGATAAGGAAATGT  1332

Query 1286  -------------------------------------------GCCTGTATAATTCAGTAGACAGCTGGATGAT  1316
                                                       |||||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1333  AAGGAAGCAGTAAGCTGCTCAAGATTGGCCGGTGCGCCACGAGGCCTGTACAATTCAGTGGATAGCTGGATGAT  1406

Query 1317  TGTTCCCAACATTAAACAGAACCATTACACAGTGCATGGACTCCAGAGCGGGACTCGCTACATCTTCATCGTTA  1390
            |||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 1407  TGTGCCCAACATTAAGCAGAACCATTACACAGTTCATGGACTCCAGAGTGGGACACGCTACATCTTTATCGTGA  1480

Query 1391  AAGCCATAAACCAAGCCGGCAGCCGGAACAGTGAACCTACCCGACTAAAAACAAACAGCCAACCCTTTAAATTG  1464
            ||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||.||||||||||.|||||||||||.||||||.|.
Sbjct 1481  AAGCCATAAATCAAGCAGGCAGCCGGAACAGCGAACCCACCAGACTAAAAACGAACAGCCAACCATTTAAACTA  1554

Query 1465  GATCCCAAAATGACTCACAAGAAGTTGAAGATCTCCAATGATGGATTGCAGATGGAGAAGGATGAAAGCTCTCT  1538
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1555  GATCCCAAAATGACTCACAAGAAGTTGAAGATCTCCAATGATGGATTGCAGATGGAGAAGGATGAGAGCTCTCT  1628

Query 1539  AAAGAAGAGCCACACCCCAGAGAGGTTTAGTGGCACAGGGTGCTATGGGGCAGCAGGAAATATATTCATTGACA  1612
            .||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1629  GAAGAAGAGCCACACTCCGGAGAGATTTAGTGGCACAGGGTGTTATGGGGCAGCAGGAAATATATTCATCGACA  1702

Query 1613  GTGGCTGCCACTATTGGGAGGTGGTCATGGGTTCCTCAACATGGTATGCAATTGGCATTGCCTACAAATCAGCT  1686
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTGGCTGCCACTACTGGGAGGTGGTCATGGGTTCTTCAACATGGTATGCTATTGGTATTGCCTACAAATCAGCT  1776

Query 1687  CCAAAGAATGAATGGATTGGCAAGAATGCCTCCTCATGGGTCTTCTCTCGCTGCAATAGTAACTTCGTGGTGAG  1760
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..|
Sbjct 1777  CCAAAGAATGAGTGGATTGGCAAGAATGCCTCTTCCTGGGTCTTCTCTCGATGCAACAGTAACTTCGTGGTTCG  1850

Query 1761  ACACAACAACAAGGAAATGCTGGTGGATGTGCCCCCACACCTGAAGCGTCTGGGTGTCCTCCTGGATTATGACA  1834
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1851  GCACAACAACAAGGAAATGCTGGTGGATGTGCCCCCACAGTTGAAGCGTCTAGGTGTCCTTCTGGATTATGACA  1924

Query 1835  ACAATATGCTGTCTTTCTATGACCCAGCTAACTCTCTCCATCTTCATACTTTTGATGTGACCTTCATTCTTCCA  1908
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1925  ACAACATGCTGTCTTTCTATGACCCAGCTAACTCTCTCCATCTTCATACTTTTGATGTTACCTTCATTCTTCCA  1998

Query 1909  GTTTGTCCAACATTTACAATCTGGAACAAATCCCTAATGATCCTGTCTGGCTTGCCTGCCCCAGATTTTATTGA  1982
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1999  GTTTGTCCAACATTCACAATCTGGAACAAATCCCTAATGATTCTTTCTGGCTTGCCTGCCCCTGATTTTATTGA  2072

Query 1983  TTACCCTGAGCGGCAGGAATGCAACTGCAGGCCTCAAGAATCCCCTTATGTTTCTGGGATGAAAATCTGTCAT  2055
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||...||.|||
Sbjct 2073  TTATCCTGAGCGGCAGGAATGCAACTGCAGGCCTCAAGAATCCCCTTATGTGTCAGGGATGAAAGCTTGCCAT  2145