Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14094
• Subject: XM_006525479.2
• Aligned Length: 594
• Identities: 494
• Gaps: 19

Alignment

Query   1  ATGCACTCCGAAGCAGAAGAATCCAAGGAAGTGGCCACAGATGTCTTTAATTCCAAAAACCTGGCCGTTCAGGC  74
           |||    ||||..|.|              |||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATG----CCGAGACTG--------------GTGGCTACAGATGTCTTCAATTCCAAAAACCTGGCCGTTCAGGC  56

Query  75  ACAAAAGAAGATCTTGGGTAAAATGGTGTCCAAATCCATCGCCACCACCTTAATAGACGACACAAGTAGTGAGG  148
           |||||||||||||.||||.||||||||.||||||||||||||||||||..|.||.||||||||.||.||.||||
Sbjct  57  ACAAAAGAAGATCCTGGGCAAAATGGTATCCAAATCCATCGCCACCACGCTGATCGACGACACCAGCAGCGAGG  130

Query 149  TGCTGGATGAGCTCTACAGAGTGACCAGGGAGTACACCCAAAACAAGAAGGAGGCAGAGAAGATCATCAAGAAC  222
           ||||.||||||||.|||||.|||||||.||||||||||||.||||||||||||||.||||.|.|||||||||||
Sbjct 131  TGCTAGATGAGCTGTACAGGGTGACCAAGGAGTACACCCAGAACAAGAAGGAGGCGGAGAGGGTCATCAAGAAC  204

Query 223  CTCATCAAGACAGTCATCAAGCTGGCCATTCTTTATAGGAATAATCAGTTTAATCAAGATGAGCTAGCATTGAT  296
           |||||||||||.|||||||||||||||.|.||..|.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||..|.||
Sbjct 205  CTCATCAAGACGGTCATCAAGCTGGCCGTCCTCCACAGGAACAATCAGTTCAATCAAGACGAGCTGGCGCTCAT  278

Query 297  GGAGAAATTTAAGAAGAAAGTTCATCAGCTTGCTATGACCGTGGTCAGTTTCCATCAGGTGGATTATACCTTTG  370
           ||||||.||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.|||||.|
Sbjct 279  GGAGAAGTTCAAGAAGAAGGTGCACCAGCTTGCCATGACGGTCGTCAGCTTCCACCAGGTAGAGTACACCTTCG  352

Query 371  ACCGGAATGTGTTATCCAGGCTGTTAAATGAATGCAGAGAGATGCTGCACCAAATCATTCAGCGCCACCTCACT  444
           ||||.||||||.|.|||||||||.|.||.||.|||.|||||.|.||.|||.|.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 353  ACCGCAATGTGCTGTCCAGGCTGCTGAACGAGTGCCGAGAGCTCCTACACGAGATCATTCAGCGCCACCTTACC  426

Query 445  GCCAAGTCACATGGACGGGTTAATAATGTGTTTGATCATTTTTCAGATTGTGAATTTTTGGCTGCCTTGTATAA  518
           ||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 427  GCCAAGTCTCACGGACGGGTTAATAATGTCTTTGACCATTTTTCAGATTGTGATTTTTTGGCTGCCTTGTACAA  500

Query 519  TCCTTTTGGGAATTTTAAACCCCACTTACAAAAACTATGTGATGGTATCAACAAAATGTTA-ATGAAGGGAACA  591
           |||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||| ||||||.|||||
Sbjct 501  TCCCTTTGGAAAGTTTAAACCTCACTTACAGAAACTTTGCGACGGCATCAACAAAATGTTAGATGAAGAGAACA  574

Query 592  TA  593
           ||
Sbjct 575  TA  576