Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14105
• Subject: NM_001081068.1
• Aligned Length: 1768
• Identities: 1507
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  MGGKNKQRTKGNLRPSNSGRAAELLAKEQGTVPGFIGFGTSQSDLGYVPAIQGAEEIDSLVDSDFRMVLRKLSK  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||.||||||||||||||||||
Sbjct    1  MGGKNKQRTKGNLRPSNSGRAAELLAKEQGTVPGFIGFGTSHSDLGYVPAVQGAEDIDSLVDSDFRMVLRKLSK  74

Query   75  KDVTTKLKAMQEFGTMCTERDTETVKGVLPYWPRIFCKISLDHDRRVREATQQAFEKLILKVKKQLAPYLKSLM  148
            ||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|
Sbjct   75  KDVTTKLKAMQEFGIMCTERDTEAVKGVLPYWPRIFCKISLDHDRRVREATQQAFEKLILKVKKHLAPYLKSVM  148

Query  149  GYWLMAQCDTYTPAAFAAKDAFEAAFPPSKQPEAIAFCKDEITSVLQDHLIKETPDTLSDPQTVPEEEREAKFY  222
            |||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||||.||||||||||||||||||||||.
Sbjct  149  GYWLMAQCDTYPPAALAAKDAFEAAFPPSKQPEAIAFCKEEITTVLQDHLLKETPDTLSDPQTVPEEEREAKFH  222

Query  223  RVVTCSLLALKRLLCLLPDNELDSLEEKFKSLLSQNKFWKYGKHSVPQIRSAYFELVSALCQRIPQLMKEEASK  296
            |||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||..||.|||||.|
Sbjct  223  RVVTCSLLALKRLLCFLPNNELDSLEEKFKSLLSQNKFWKYGKHSVPQVRSAYFELVSALCQHVPQVMKEEAAK  296

Query  297  VSPSVLLSIDDSDPIVCPALWEAVLYTLTTIEDCWLHVNAKKSVFPKLSTVIREGGRGLATVIYPYLLPFISKL  370
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||...|||||||||.|.|||||||||||
Sbjct  297  VSPSVLLSIDDSDPVVCPALWEAVLYTLTTIEDCWFHVNAKKSVFPKLMAMIREGGRGLAAVMYPYLLPFISKL  370

Query  371  PQSITNPKLDFFKNFLTSLVAGLSTERTKTSSSESSAVISAFFECLRFIMQQNLGEEEIEQMLVNDQLXPFIDA  444
            |||||.||||||||||||||.||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||..|||.|.||.||||.
Sbjct  371  PQSITEPKLDFFKNFLTSLVTGLSTERTKSSSSECSAVISAFFECLRFIMQQNLGEEEMVQMLINEQLIPFIDT  444

Query  445  VLKDPGLQHGQLFNHLAETLSSWEAKADTEKDEKTAHNLENVLIHFWERLSEICVAKISEPEADVESVLGVSNL  518
            ||||.||.||..|.|||.||||||||||.|.|.....||||||..||.||||||..||..|||||.|||.||.|
Sbjct  445  VLKDSGLHHGPMFDHLADTLSSWEAKADAERDPGAVYNLENVLLSFWGRLSEICTEKIRQPEADVKSVLCVSSL  518

Query  519  LQVLQKPKSSLKSSKKKNXKVRFADEILESNKENEKCVSSEGEKIEGWELTTEPSLTHNSSGLLSPLRKKPLED  592
            ..|||.|.||||...||...||||..|.|..|..||..|||||..||........|...||.|.||||||||||
Sbjct  519  VGVLQRPRSSLKLHRKKTAQVRFAINIPEAHKGDEKSMSSEGENSEGSDGGAQSPLSNTSSDLVSPLRKKPLED  592

Query  593  LVCKLADISINYVNERKSEQHLRFLSTLLDSFSSSRVFKMLLGDEKQSIVQAKPLEIAKLVQKNPAVQFLYQKL  666
            ||||||..||..||||||||||.|||||||||||..||..||.|.....|.||||||.||..|||||.|||.||
Sbjct  593  LVCKLAEVSISFVNERKSEQHLQFLSTLLDSFSSVQVFNILLSDKQKNVVKAKPLEITKLAEKNPAVKFLYHKL  666

Query  667  IGWLNEDQRKDFGFLVDILYSALRCCDNDMERKKVLDDLTKVDLKWNSLLKIIEKACPSSDKHALVTPWLKGDI  740
            |||||..|..|.|||||||||||||||...|||.|||||||.||||.|||..|||||.||||||||||||||.|
Sbjct  667  IGWLNDSQKEDGGFLVDILYSALRCCDSGVERKEVLDDLTKEDLKWSSLLQVIEKACSSSDKHALVTPWLKGSI  740

Query  741  LGEKLVNLADCLCNEDLESRVSSESHFSERWTLLSLVLSQHVKNDYLIGDVYVERIIVRLHETLFKTKKLSEAE  814
            ||||||.||||||..|||. ..||||.||.|.||.|.||||||||||||.|||.||||.|||||.|||.||||.
Sbjct  741  LGEKLVALADCLCDKDLEA-TTSESHSSEQWSLLRLALSQHVKNDYLIGEVYVGRIIVKLHETLSKTKDLSEAA  813

Query  815  SSDSSVSFICDVAYNYFSSAKGCLLMPSSEDLLLTLFQLCAQSKEKTHLPDFLICKLKNTWLSGVNLLVHQTDS  888
            .|||||||.|||....||||.|.||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  814  NSDSSVSFVCDVVHSFFSSAGGGLLMPPSEDLLLTLFQLCAQSKERTHLPDFLICKLKNTLLSGVNLLVHQTAS  887

Query  889  SYKESTFLHLSALWLKNQVQASSLDINSLQVLLSAVDDLLNTLLESEDSYLMGVYIGSVMPNDSEWEKMRQSLP  962
            .|..||||.||.||||.|||.|.||..||||||||..|||.||.||||..|.|||||||||.|||||||||.||
Sbjct  888  TYEQSTFLRLSVLWLKDQVQSSALDNTSLQVLLSAAGDLLGTLVESEDTSLLGVYIGSVMPSDSEWEKMRQALP  961

Query  963  MQWLHRPLLEGRLSLNYECFKTDFKEQDIKTLPSHLCTSALLSKMVLIALRKETVLENNELEKIIAELLYSLQW  1036
            .|||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||.|.|..|..|||.|.||||||||||||||
Sbjct  962  VQWLHRPLLEGRLSLNYECFKTDFKEQDTKTLPNHLCTSSLLSKMILVAQKKKLVLEDNVLEKIIAELLYSLQW  1035

Query 1037  CEELDNPPIFLIGFCEILQKMNITYDNLRVLGNTSGLLQLLFNRSREHGTLWSLIIAKLILSRSISSDEVKPHY  1110
            ||||||.|.||.|||.|||||||||.||.||..||.||||||.|||..||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1036  CEELDNAPSFLSGFCGILQKMNITYSNLSVLSETSSLLQLLFDRSRKNGTLWSLIIAKLILSRSISSDEVKPYY  1109

Query 1111  KRKESFFPLTEGNLHTIQSLCPFLSKEEKKEFSAQCIPALLGWTKKDLCSTNGGFGHLAIFNSCLQTKSIDDGE  1184
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||.||.|||||||||||||.||||..
Sbjct 1110  KRKESFFPLTEGSLHTIQSLCPFLSKEEKKEFSAQCIPAFLGWTKEDLCSINGAFGHLAIFNSCLQTRSIDDKQ  1183

Query 1185  LLHGILKIIISWKKEHEDIFLFSCNLSEASPEVLGVNIEIIRFLSLFLKYCS--SPLAESEWDFIMCSMLAWLE  1256
            |||||||||.||.|.||||||||||||||||||||.||||.||||||||.|.  .|||.|||||||||||||||
Sbjct 1184  LLHGILKIITSWRKQHEDIFLFSCNLSEASPEVLGLNIEIMRFLSLFLKHCAYPLPLADSEWDFIMCSMLAWLE  1257

Query 1257  TTSENQALYSIPLVQLFACVSRDLACDLSAFFDSTTLDTIGNLPVNLISEWKEFFSQGIHSLLLPILVTVTGEN  1330
            ||||||||||.||||||||||.||||||.|||||.|.|...|||||||||||||||.||||||||.||...|||
Sbjct 1258  TTSENQALYSVPLVQLFACVSFDLACDLCAFFDSITPDIVDNLPVNLISEWKEFFSKGIHSLLLPLLVNAIGEN  1331

Query 1331  KDVSETSFQNAMLKPMCETLTYISKEQLLSHKLPARLVADQKTNLPEYLQTLLNTLAPLLLFRARPVQIAVYHM  1404
            ||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||.||||||||.|||||||||||||.|||
Sbjct 1332  KDLSETSFQNAMLKPMCETLTYISKDQLLSHKLPARLVASQKTNLPEHLQTLLNTLTPLLLFRARPVQIAAYHM  1405

Query 1405  LYKLMPELPQYDQDNLKSYGDEEEEPALSPPAALMSLLSIQEDLLENVLGCIPVGQIVTIKPLSEDFCYVLGYL  1478
            |.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||.||||||||||||||
Sbjct 1406  LCKLMPELPQHDQDNLRSYGDEEEEPALSPPAALMSLLSSQEELLENVLGCVPVGQIVTVKPLSEDFCYVLGYL  1479

Query 1479  LTWKLILTFFKAASSQLRALYSMYLRKTKSLNKLLYHLFRLMPENPTYAETAVEVPNKDPKTFFTEELQLSIRE  1552
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Sbjct 1480  LTWKLILTFFKAASSQLRALYSMYLRKTKSLNKLLYHLFRLMPENPTYGETAIEVSSKDPKTFFTEEVQLSIRE  1553

Query 1553  TTMLPYHIPHLACSVYHMTLKDLPAMVRLWWNSSEKRVFNIVDRFTSKYVSSVLSFQEISSVQTSTQLFNGMTV  1626
            |..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554  TATLPYHIPHLACSVYHMTLKDLPAMVRLWWNSSEKRVFNIVDRFTSKYVSNVLSFQEISSVQTSTQLFNGMTV  1627

Query 1627  KARATTREVMATYTIEDIVIELIIQLPSNYPLGSIIVESGKRVGVAVQQWRNWMLQLSTYLTHQNGSIMEGLAL  1700
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Sbjct 1628  KARATTREVMATYTIEDIVIELIIQLPSNYPLGSITVESGKRIGVAVQQWRNWMLQLSTYLTHQNGSIMEGLAL  1701

Query 1701  WKNNVDKRFEGVEDCMICFSVIHGFNYSLPKKACRTCKKKFHSACLYKWFTSSNKSTCPLCRERFS  1766
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Sbjct 1702  WKNNVDKRFEGVEDCMICFSVIHGFNYSLPKKACRTCKKKFHSACLYKWFTSSNKSTCPLCRETFF  1767