Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14143
- Subject:
- XM_006720559.3
- Aligned Length:
- 1341
- Identities:
- 1318
- Gaps:
- 21
Alignment
Query 1 ATGATCATCCCCTCACTAGAGGAGCTGGACTCCCTCAAGTACAGTGACCTGCAGAACTTAGCCAAGAGTCTGGG 74
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATCATCCCCTCTCTAGAGGAGCTGGACTCCCTCAAGTACAGTGACCTGCAGAACTTAGCCAAGAGTCTGGG 74
Query 75 TCTCCGGGCCAACCTGAGGGCAACCAAGTTGTTAAAAGCCTTGAAAGGCTACATTAAACATGAGGCAAGAAAAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCTCCGGGCCAACCTGAGGGCAACCAAGTTGTTAAAAGCCTTGAAAGGCTACATTAAACATGAGGCAAGAAAAG 148
Query 149 GAAATGAGAATCAGGATGAAAGTCAAACTTCTGCATCCTCTTGTGATGAGACTGAGATACAGATCAGCAACCAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GAAATGAGAATCAGGATGAAAGTCAAACTTCTGCATCCTCTTGTGATGAGACTGAGATACAGATCAGCAACCAG 222
Query 223 GAAGAAGCTGAGAGACAGCCACTTGGCCATGTCACCAAAACAAGGAGAAGGTGCAAGACTGTCCGTGTGGACCC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAGAAGCTGAGAGACAGCCACTTGGCCATGTCACCAAAACAAGGAGAAGGTGCAAGACTGTCCGTGTGGACCC 296
Query 297 TGACTCA---CAGAATCATTCAGAGATAAAAATAAGTAATCCCACTGAATTCCAGAATCATGAAAAGCAGGAAA 367
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGACTCACAGCAGAATCATTCAGAGATAAAAATAAGTAATCCCACTGAATTCCAGAATCATGAAAAGCAGGAAA 370
Query 368 GCCAGGATCTCAGAGCTACTGCAAAAGTTCCTTCTCCACCAGACGAGCACCAAGAAGCTGAGAATGCTGTTTCC 441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCCAGGATCTCAGAGCTACTGCAAAAGTTCCTTCTCCACCAGACGAGCACCAAGAAGCTGAGAATGCTGTTTCC 444
Query 442 TCA------------------GGTAACAGAGATTCAAAGGTACCTTCAGAAGGAAAGAAATCTCTCTACACAGA 497
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCAGGTAAACGTGGAATAAATGGTAACAGAGATTCAAAGGTACCTTCAGAAGGAAAGAAATCTCTCTACACAGA 518
Query 498 TGAGTCATCCAAACCTGGAAAAAATAAAAGAACTGCAATCACTACTCCAAACTTTAAGAAGCTTCATGAAGCTC 571
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGAGTCATCCAAACCTGGAAAAAATAAAAGAACTGCAATCACTACTCCAAACTTTAAGAAGCTTCATGAAGCTC 592
Query 572 ATTTTAAGGAAATGGAGTCCATTGATCAATATATTGAGAGAAAAAAGAAACATTTTGAAGAACACAATTCCATG 645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATTTTAAGGAAATGGAGTCCATTGATCAATATATTGAGAGAAAAAAGAAACATTTTGAAGAACACAATTCCATG 666
Query 646 AATGAACTGAAGCAGCAGCCCATCAATAAGGGAGGGGTCAGGACTCCAGTACCTCCAAGAGGAAGACTCTCTGT 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AATGAACTGAAGCAGCAGCCCATCAATAAGGGAGGGGTCAGGACTCCAGTACCTCCAAGAGGAAGACTCTCTGT 740
Query 720 GGCTTCTACTCCCATCAGCCAACGACGCTCGCAAGGCCGGTCTTGTGGCCCTGCAAGTCAGAGTACCTTGGGTC 793
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGCTTCTACTCCCATCAGCCAACGACGCTCGCAAGGCCGGTCTTGTGGCCCTGCAAGTCAGAGTACCTTGGGTC 814
Query 794 TGAAGGGGTCACTCAAGCGCTCTGCTATCTCTGCAGCTAAAACGGGTGTCAGGTTTTCAGCTGCTACTAAAGAT 867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGAAGGGGTCACTCAAGCGCTCTGCTATCTCTGCAGCTAAAACGGGTGTCAGGTTTTCAGCTGCTACTAAAGAT 888
Query 868 AATGAGCATAAGCGTTCACTGACCAAGACTCCAGCCAGAAAGTCTGCACATGTGACCGTGTCTGGGGGCACCCC 941
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AATGAGCATAAGCGTTCACTGACCAAGACTCCAGCCAGAAAGTCTGCACATGTGACCGTGTCTGGGGGCACCCC 962
Query 942 AAAAGGCGAGGCTGTGCTTGGGACACACAAATTAAAGACCATCACGGGGAATTCTGCTGCTGTTATTACCCCAT 1015
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AAAAGGCGAGGCTGTGCTTGGGACACACAAATTAAAGACCATCACGGGGAATTCTGCTGCTGTTATTACCCCAT 1036
Query 1016 TCAAGTTGACAACTGAGGCAACGCAGACTCCAGTCTCCAATAAGAAACCAGTGTTTGATCTTAAAGCAAGTTTG 1089
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCAAGTTGACAACTGAGGCAACGCAGACTCCAGTCTCCAATAAGAAACCAGTGTTTGATCTTAAAGCAAGTTTG 1110
Query 1090 TCTCGTCCCCTCAACTATGAACCACACAAAGGAAAGCTAAAACCATGGGGGCAATCTAAAGAAAATAATTATCT 1163
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCTCGTCCCCTCAACTATGAACCACACAAAGGAAAGCTAAAACCATGGGGGCAATCTAAAGAAAATAATTATCT 1184
Query 1164 AAATCAACATGTCAACAGAATTAACTTCTACAAGAAAACTTACAAACAACCCCATCTCCAGACAAAGGAAGAGC 1237
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AAATCAACATGTCAACAGAATTAACTTCTACAAGAAAACTTACAAACAACCCCATCTCCAGACAAAGGAAGAGC 1258
Query 1238 AACGGAAGAAACGCGAGCAAGAACGAAAGGAGAAGAAAGCAAAGGTTTTGGGAATGCGAAGGGGCCTCATTTTG 1311
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AACGGAAGAAACGCGAGCAAGAACGAAAGGAGAAGAAAGCAAAGGTTTTGGGAATGCGAAGGGGCCTCATTTTG 1332
Query 1312 GCTGAAGAA 1320
||||||||.
Sbjct 1333 GCTGAAGAT 1341