Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14143
- Subject:
- XM_017022294.2
- Aligned Length:
- 1320
- Identities:
- 1156
- Gaps:
- 162
Alignment
Query 1 ATGATCATCCCCTCACTAGAGGAGCTGGACTCCCTCAAGTACAGTGACCTGCAGAACTTAGCCAAGAGTCTGGG 74
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATCATCCCCTCTCTAGAGGAGCTGGACTCCCTCAAGTACAGTGACCTGCAGAACTTAGCCAAGAGTCTGGG 74
Query 75 TCTCCGGGCCAACCTGAGGGCAACCAAGTTGTTAAAAGCCTTGAAAGGCTACATTAAACATGAGGCAAGAAAAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCTCCGGGCCAACCTGAGGGCAACCAAGTTGTTAAAAGCCTTGAAAGGCTACATTAAACATGAGGCAAGAAAAG 148
Query 149 GAAATGAGAATCAGGATGAAAGTCAAACTTCTGCATCCTCTTGTGATGAGACTGAGATACAGATCAGCAACCAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GAAATGAGAATCAGGATGAAAGTCAAACTTCTGCATCCTCTTGTGATGAGACTGAGATACAGATCAGCAACCAG 222
Query 223 GAAGAAGCTGAGAGACAGCCACTTGGCCATGTCACCAAAACAAGGAGAAGGTGCAAGACTGTCCGTGTGGACCC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAGAAGCTGAGAGACAGCCACTTGGCCATGTCACCAAAACAAGGAGAAGGTGCAAGACTGTCCGTGTGGACCC 296
Query 297 TGACTCACAGAATCATTCAGAGATAAAAATAAGTAATCCCACTGAATTCCAGAATCATGAAAAGCAGGAAAGCC 370
||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGACTCA------------------------------------------CAGAATCATGAAAAGCAGGAAAGCC 328
Query 371 AGGATCTCAGAGCTACTGCAAAAGTTCCTTCTCCACCAGACGAGCACCAAGAAGCTGAGAATGCTGTTTCCTCA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 329 AGGATCTCAGAGCTACTGCAAAAGTTCCTTCTCCACCAGACGAGCACCAAGAAGCTGAGAATGCTGTTTCCTCA 402
Query 445 GGTAACAGAGATTCAAAGGTACCTTCAGAAGGAAAGAAATCTCTCTACACAGATGAGTCATCCAAACCTGGAAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 403 GGTAACAGAGATTCAAAGGTACCTTCAGAAGGAAAGAAATCTCTCTACACAGATGAGTCATCCAAACCTGGAAA 476
Query 519 AAATAAAAGAACTGCAATCACTACTCCAAACTTTAAGAAGCTTCATGAAGCTCATTTTAAGGAAATGGAGTCCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 477 AAATAAAAGAACTGCAATCACTACTCCAAACTTTAAGAAGCTTCATGAAGCTCATTTTAAGGAAATGGAGTCCA 550
Query 593 TTGATCAATATATTGAGAGAAAAAAGAAACATTTTGAAGAACACAATTCCATGAATGAACTGAAGCAGCAGCCC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 551 TTGATCAATATATTGAGAGAAAAAAGAAACATTTTGAAGAACACAATTCCATGAATGAACTGA---AGCAGCCC 621
Query 667 ATCAATAAGGGAGGGGTCAGGACTCCAGTACCTCCAAGAGGAAGACTCTCTGTGGCTTCTACTCCCATCAGCCA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 622 ATCAATAAGGGAGGGGTCAGGACTCCAGTACCTCCAAGAGGAAGACTCTCTGTGGCTTCTACTCCCATCAGCCA 695
Query 741 ACGACGCTCGCAAGGCCGGTCTTGTGGCCCTGCAAGTCAGAGTACCTTGGGTCTGAAGGGGTCACTCAAGCGCT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 696 ACGACGCTCGCAAGGCCGGTCTTGTGGCCCTGCAAGTCAGAGTACCTTGGGTCTGAAGGGGTCACTCAAGCGCT 769
Query 815 CTGCTATCTCTGCAGCTAAAACGGGTGTCAGGTTTTCAGCTGCTACTAAAGATAATGAGCATAAGCGTTCACTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 770 CTGCTATCTCTGCAGCTAAAACGGGTGTCAGGTTTTCAGCTGCTACTAAAGATAATGAGCATAAGCGTTCACTG 843
Query 889 ACCAAGACTCCAGCCAGAAAGTCTGCACATGTGACCGTGTCTGGGGGCACCCCAAAAGGCGAGGCTGTGCTTGG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 844 ACCAAGACTCCAGCCAGAAAGTCTGCACATGTGACCGTGTCTGGGGGCACCCCAAAAGGCGAGGCTGTGCTTGG 917
Query 963 GACACACAAATTAAAGACCATCACGGGGAATTCTGCTGCTGTTATTACCCCATTCAAGTTGACAACTGAGGCAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 918 GACACACAAATTAAAGACCATCACGGGGAATTCTGCTGCT---------------------------------- 957
Query 1037 CGCAGACTCCAGTCTCCAATAAGAAACCAGTGTTTGATCTTAAAGCAAGTTTGTCTCGTCCCCTCAACTATGAA 1110
Sbjct 958 -------------------------------------------------------------------------- 957
Query 1111 CCACACAAAGGAAAGCTAAAACCATGGGGGCAATCTAAAGAAAATAATTATCTAAATCAACATGTCAACAGAAT 1184
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 ---------GGAAAGCTAAAACCATGGGGGCAATCTAAAGAAAATAATTATCTAAATCAACATGTCAACAGAAT 1022
Query 1185 TAACTTCTACAAGAAAACTTACAAACAACCCCATCTCCAGACAAAGGAAGAGCAACGGAAGAAACGCGAGCAAG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1023 TAACTTCTACAAGAAAACTTACAAACAACCCCATCTCCAGACAAAGGAAGAGCAACGGAAGAAACGCGAGCAAG 1096
Query 1259 AACGAAAGGAGAAGAAAGCAAAGGTTTTGGGAATGCGAAGGGGCCTCATTTTGGCTGAAGAA 1320
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1097 AACGAAAGGAGAAGAAAGCAAAGGTTTTGGGAATGCGAAGGGGCCTCATTTTGGCTGAAGAT 1158