Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14160
• Subject: XM_011242709.1
• Aligned Length: 1290
• Identities: 863
• Gaps: 369

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGACCATTCTAATAGGGAAAAGGATGATAGACAACGGACAACTAAAACCATGGCACAAAGGAATACACACTG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TTCGAGACCATCTGGCACTTCAACATCCTCTGGGGTTCTCATGGTGGGACCCAACTTCAGGGTTGGCAAGAAGA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TAGGGTGTGGGAACTTCGGAGAGCTCAGATTAGGTAAAAATCTCTACACCAATGAATATGTAGCCATTAAACTG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GAACCAATAAAATCACGTGCTCCACAACTTCATTTAGAGTACAGGTTTTATAAACAGCTTGGCAGTGCAGGTGA  296

Query    1  -------------------------------------------------ATGGTGCTGGAGCTCCTTGGCCCTA  25
                                                             |||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  297  AGGCCTCCCACAGGTTTATTACTTTGGACCATGTGGGAAGTACAATGCCATGGTGCTGGAACTCCTTGGCCCTA  370

Query   26  GCTTGGAGGACTTGTTTGACCTCTGTGACCGAACATTTACTTTGAAGACGGTGTTAATGATAGCCATCCAGCTG  99
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  371  GCTTGGAAGACTTGTTTGACCTCTGTGACCGAACGTTTACTTTGAAGACGGTGTTAATGATAGCCATCCAGTTG  444

Query  100  CTTTCTCGAATGGAATACGTGCACTCAAAGAACCTCATTTACCGAGATGTCAAGCCAGAGAACTTCCTGATTGG  173
            ||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||
Sbjct  445  CTTTCTCGAATGGAGTATGTACACTCAAAGAATCTTATTTACCGAGATGTCAAACCAGAGAACTTCTTGATTGG  518

Query  174  TCGACAAGGCAATAAGAAAGAGCATGTTATACACATTATAGACTTTGGACTGGCCAAGGAATACATTGACCCCG  247
            .||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||..||||.||.|
Sbjct  519  CCGACAAGGCAATAAGAAAGAGCATGTAATACACATTATAGATTTTGGACTGGCCAAGGAATATGTTGATCCTG  592

Query  248  AAACCAAAAAACACATACCTTATAGGGAACACAAAAGTTTAACTGGAACTGCAAGATATATGTCTATCAACACG  321
            ||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct  593  AAACCAAAAAACACATACCTTACAGAGAGCACAAAAGTTTGACTGGAACTGCGAGATACATGTCTATCAACACA  666

Query  322  CATCTTGGCAAAGAGCAAAGCCGGAGAGATGATTTGGAAGCCCTAGGCCATATGTTCATGTATTTCCTTCGAGG  395
            |||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  667  CATCTAGGCAAAGAGCAAAGCCGGCGAGATGATTTGGAAGCCTTAGGCCATATGTTCATGTACTTCCTCCGAGG  740

Query  396  CAGCCTCCCCTGGCAAGGACTCAAGGCTGACACATTAAAAGAGAGATATCAAAAAATTGGTGACACCAAAAGGA  469
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  741  CAGCCTACCCTGGCAAGGACTCAAGGCTGATACATTAAAAGAGAGATATCAAAAAATCGGTGATACCAAAAGGA  814

Query  470  ATACTCCCATTGAAGCTCTCTGTGAGAACTTTCCAGAGGAGATGGCAACCTACCTTCGATATGTCAGGCGACTG  543
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.
Sbjct  815  ATACTCCCATCGAAGCTCTCTGTGAGAACTTTCCAGAGGAGATGGCAACCTACCTTCGATATGTCAGGCGATTA  888

Query  544  GACTTCTTTGAAAAACCTGATTATGAGTATTTACGGACCCTCTTCACAGACCTCTTTGAAAAGAAAGGCTACAC  617
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||..|||||||||.||
Sbjct  889  GACTTCTTTGAAAAACCTGATTATGAGTATTTACGGACCCTCTTCACAGATCTGTTTGAACGGAAAGGCTATAC  962

Query  618  CTTTGACTATGCCTATGATTGGGTTGGGAGACCTATTCCTACTCCAGTAGGGTCAGTTCACGTAGATTCTGGTG  691
            |||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  963  CTTTGACTATGCCTATGATTGGGTTGGAAGGCCTATTCCTACTCCAGTAGGATCAGTTCATGTAGATTCTGGTG  1036

Query  692  CATCTGCAATAACTCGAGAAAGCCACACACATAGGGATCGGCCATCACAACAGCAGCCTCTTCGAAATCAGGTG  765
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||
Sbjct 1037  CATCTGCAATAACTCGAGAAAGCCACACACACAGGGATCGGCCATCACAACAACAGCCTCTTAGAAATCAGGTG  1110

Query  766  GTTAGCTCAACCAATGGAGAGCTGAATGTTGATGATCCCACGGGAGCCCACTCCAATGCACCAATCACAGCTCA  839
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTTAGCTCAACCAATGGAGAGCTGAATGTCGATGACCCCACTGGAGCTCACTCCAATGCACCAATCACAGCTCA  1184

Query  840  TGCCGAGGTGGAGGTAGTGGAGGAAGCTAA------------------------GTGCTGCTGTTTCTTTAAGA  889
            ||||||.|||||||||||||||||||||||                        ||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCCGAAGTGGAGGTAGTGGAGGAAGCTAACTGCCTGAAAATGCTCAACCTGTGGTGCTGCTGTTTCTTTAAGA  1258

Query  890  GGAAAAGGAAGAAGACTGCTCCGCGCCACAAG  921
            ||||||||||||||||.||.|.|||.||||||
Sbjct 1259  GGAAAAGGAAGAAGACAGCCCAGCGACACAAG  1290