Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14182
• Subject: NM_001033175.2
• Aligned Length: 939
• Identities: 808
• Gaps: 22

Alignment

Query   1  ATGGA---GGCGACGCGGAGGCGGCAGCACCTGGGAGCGACGGGCGGCCCAGG---CGCGCAGCTGGGCGCCTC  68
           |||||   ||||||||||||||||||||.|||.||||||.||||||||||.||   ||||              
Sbjct   1  ATGGAGGCGGCGACGCGGAGGCGGCAGCTCCTCGGAGCGGCGGGCGGCCCCGGTGTCGCG--------------  60

Query  69  CTTCCTGCAGGCCAGGCATGGCTCTGTGAGCGCTGATGAGGCTGCCCGCACGGCTCCCTTCCACCTCGACCTCT  142
            |||.||||||||||||||||||||||||..||.||.||....|.||||||.||.||||||||.||.|||||||
Sbjct  61  -TTCGTGCAGGCCAGGCATGGCTCTGTGAAGGCCGAGGACAAAGACCGCACAGCCCCCTTCCATCTTGACCTCT  133

Query 143  GGTTCTACTTCATACTGCAGAACTAGGTTCTGGACTTTGGGCG-TCCATTGCCATGCTGGTATTCCCTCTCGAG  215
           ||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.|| .||||||||||||||||||||||..||.||
Sbjct 134  GGTTCTACTTCACACTGCAGAACTGGGTTCTGGACTTTGGCCGCCCCATTGCCATGCTGGTATTCCCGATCCAG  207

Query 216  TGGTTTCCACTCAACAAGCCCAGTGTTGGGGACTACTTCCACATGGCCTACAACGTCATCACGCCCTTTCTCTT  289
           ||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||.||||||||.|||||||||||||.||..|
Sbjct 208  TGGTTTCCTCTCAACAAGCCAAGTGTCGGGGACTACTTTCACATGACCTACAACATCATCACGCCCTTCCTGCT  281

Query 290  GCTCAAGCTCATCGAGCGGTCCCCCCGCACCCTGCCACGCTCCATCACGTACGTGAGCATCATCATCTTCATCA  363
           |||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||.||.||....||.||.||||||||||..|||||||
Sbjct 282  GCTAAAGCTTATTGAGCGGTCCCCCCGAACGCTGCCGCGGTCTATAGTCTATGTCAGCATCATCACTTTCATCA  355

Query 364  TGGGTGCCAGCATCCACCTGGTGGGTGACTCTGTCAACCACCGCCTGCTCTTCAGTGGCTACCAGCACCACCTG  437
           ||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 356  TGGGAGCCAGCATCCACCTGGTGGGAGACTCAGTCAACCATCGCCTGCTCTTCAGTGGGTACCAGCACCACCTG  429

Query 438  TCTGTCCGTGAGAACCCCATCATCAAGAATCTCAAGCCGGAGACGCTGATCGACTCCTTTGAGCTGCTCTACTA  511
           ||.|||.|.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.|||||
Sbjct 430  TCCGTCAGAGAGAACCCCATTATCAAGAACCTCAAGCCGGAGACTCTGATCGACTCCTTTGAGCTGTTGTACTA  503

Query 512  TTATGATGAGTACCTGGGTCACTGCATGTGGTACATCCCCTTCTTCCTCATCCTCTTCATGTACTTCAGCGGCT  585
           .|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 504  CTATGACGAGTACCTGGGCCACTGCATGTGGTACATCCCCTTCTTCCTCATCCTCTTCATGTACTTCAGTGGCT  577

Query 586  GCTTTACTGCCTCTAAAGCTGAGAGCTTGATTCCAGGGCCTGCCCTGCTCCTGGTGGCACCCAGTGGCCTGTAC  659
           |.||.||..|||..||.|||||||||...||.|||||.|||||||||||||||||||..||||||||.||||||
Sbjct 578  GTTTCACCACCTGCAAGGCTGAGAGCCACATGCCAGGACCTGCCCTGCTCCTGGTGGTGCCCAGTGGTCTGTAC  651

Query 660  TACTGGTACCTGGTCACCGAGGGCCAGATCTTCATCCTCTTCATCTTCACCTTCTTCGCCATGCTGGCCCTCGT  733
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 652  TACTGGTACCTGGTCACCGAGGGCCAGATCTTCATCCTCTTCATCTTCACCTTCTTCGCCATGCTGGCTCTCGT  725

Query 734  CCTGCACCAGAAGCGCAAGCGCCTCTTCCTGGACAGCAACGGCCTCTTCCTCTTCTCCTCCTTCGCACTGACCC  807
           |.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..||||||||.||.||||
Sbjct 726  CTTGCACCAGAAGCGCAGGCGCCTCTTCCTGGACAGCAACGGCCTCTTCCTCTTGTATTCCTTCGCGCTCACCC  799

Query 808  TCTTGCTTGTGGCGCTCTGGGTCGCCTGGCTGTGGAATGACCCTGTTCTCAGGAAGAAGTACCCGGGTGTCATC  881
           |||..||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 800  TCTCACTGGTGGCTCTGTGGGTGGCTTGGCTGTGGAATGACCCTGTACTCAGAAAGAAGTACCCTGGTGTCATC  873

Query 882  TACGTCCCTGAGCCCTGGGCTTTCTACACCCTTCACGTCAGCAGTCGGCAC  932
           ||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||..||.
Sbjct 874  TATGTTCCTGAGCCCTGGGCCTTCTACACACTCCACGTTAGCAGTCAACAG  924