Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14195
• Subject: NM_025700.2
• Aligned Length: 1862
• Identities: 1568
• Gaps: 29

Alignment

Query    1  ATGGCGGC-------------------------CCAGAAGGCAGCGGTCTAGACGA-GGACGCCCGGCTGGACC  48
            ||||||||                         ||.||||||||.|| ||.|...| ||||||.||.|||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCGGCGACACCGACAGAGACACCGGCTCCGGAAGGCAGTGG-CTTGGGTATGGACGCGCGACTGGACC  73

Query   49  AGGAGACCGCCCAGTGGCTGCGCTGGGACAAGAATTCCTTAACTTTGGAGGCAGTGAAACGACTAATAGCAGAA  122
            ||||||||||.|||||||||||.||||||.||||..|.|||||.|..|||.|||||||||..||.||.||.|.|
Sbjct   74  AGGAGACCGCGCAGTGGCTGCGTTGGGACCAGAACCCTTTAACCTCTGAGTCAGTGAAACAGCTCATTGCTGGA  147

Query  123  GGTAATAAAGAAGAACTACGAAAATGTTTTGGGGCCCGAATGGAGTTTGGGACAGCTGGCCTCCGAGCTGCTAT  196
            ||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||..||||
Sbjct  148  GGTAATAAAGAAGAGCTGCGGAAATGCTTTGGGGCCCGGATGGAGTTTGGGACAGCTGGCCTTCGAGCGCCTAT  221

Query  197  GGGACCTGGAATTTCTCGTATGAATGACTTGACCATCATCCAGACTACACAGGGATTTTGCAGATACCTGGAAA  270
            ||||.|.||.||||||||.|||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  222  GGGAGCAGGGATTTCTCGAATGAATGACCTGACCATCATCCAGACCACACAGGGATTTTGCAGGTACCTGGAAA  295

Query  271  AACAATTCAGTGACTTAAAGCAGAAAGGCATCGTGATCAGTTTTGACGCCCGAGCTCATCCATCCAGTGGGGGT  344
            |.||.|||||||||.|.|||||||..|||.|.||||||||.||.||.||..|||||||.||..||||.|||||.
Sbjct  296  AGCAGTTCAGTGACCTGAAGCAGAGGGGCGTGGTGATCAGCTTCGATGCGAGAGCTCACCCCGCCAGCGGGGGC  369

Query  345  AGCAGCAGAAGGTTTGCCCGACTTGCTGCAACCACATTTATCAGTCAGGGGATTCCTGTGTACCTCTTTTCTGA  418
            ||||||.|.|||||||||||.||.|||||.||..|||||||||..|||||..|||||||.||||||||.|||||
Sbjct  370  AGCAGCCGGAGGTTTGCCCGGCTGGCTGCGACTGCATTTATCACCCAGGGTGTTCCTGTATACCTCTTCTCTGA  443

Query  419  TATAACGCCAACCCCCTTTGTGCCCTTCACAGTATCACATTTGAAACTTTGTGCTGGAATCATGATAACTGCAT  492
            ||||||.||.||||||||||||||.|.|||.||.||.||..|||||||.||.||.||.||||||||.|||||.|
Sbjct  444  TATAACCCCCACCCCCTTTGTGCCGTACACCGTGTCGCACCTGAAACTCTGCGCAGGCATCATGATCACTGCCT  517

Query  493  CTCACAATCCAAAGCAGGATAATGGTTATAAGGTCTATTGGGATAATGGAGCTCAGATCATTTCTCCTCACGAT  566
            |.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  518  CGCACAATCCAAAGCAGGACAATGGCTATAAGGTCTACTGGGACAACGGAGCTCAGATCATCTCTCCCCACGAT  591

Query  567  AAAGGGATTTCTCAAGCTATTGAAGAAAATCTAGAACCGTGGCCTCAAGCTTGGGACGATTCTTTAATTGATAG  640
            ...||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||..||||.||
Sbjct  592  CGCGGCATTTCTCAGGCCATTGAGGAAAATCTAGAGCCCTGGCCTCAGGCTTGGGAGGAGTCTTTGGTTGACAG  665

Query  641  CAGTCCACTTCTCCACAATCCGAGTGCTTCCATCAATAATGACTACTTTGAAGACCTTAAAAAGTACTGTTTCC  714
            .|||||.|||||.|||||.||.||.||.||||||..|||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  666  TAGTCCCCTTCTTCACAACCCCAGCGCGTCCATCGGTAATGACTACTTTGAAGACCTTAAAAAATACTGTTTTC  739

Query  715  ACAGGAGCGTGAACAGGGAGACAAAGGTGAAGTTTGTGCACACCTCTGTCCATGGGGTGGGTCA-TAGCTTTGT  787
            ||||.|..||.||||.|||||..|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|| .|| |||||
Sbjct  740  ACAGAACGGTAAACAAGGAGAGCAAGGTGAAGTTCGTGCACACCTCTGTCCATGGTGTGGGCCACGAG-TTTGT  812

Query  788  GCAGTCAGCTTTCAAGGCTTTTGACCTTGTTCCTCCTGAGGCTGTTCCTGAACAGAAAGATCCGGATCCTGAGT  861
            |||||..||.|||||||||||||||||||.||||||.||.||||||||..|||||||||||||||||||.||||
Sbjct  813  GCAGTTGGCCTTCAAGGCTTTTGACCTTGCTCCTCCCGAAGCTGTTCCCCAACAGAAAGATCCGGATCCCGAGT  886

Query  862  TTCCAACAGTGAAATACCCGAATCCCGAAGAGGGGAAAGGTGTCTTGACTTTGTCTTTTGCTTTGGCTGACAAA  935
            |||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  887  TTCCAACTGTCAAATACCCGAATCCTGAGGAGGGCAAAGGTGTCTTGACTTTATCTTTTGCCTTGGCTGACAAA  960

Query  936  ACCAAGGCCAGAATTGTTTTAGCTAACGACCCGGATGCTGATAGACTTGCTGTGGCAGAAAAGCAAGACAGTGG  1009
            |.||||||||.|||.||..||||.||.|||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  961  ATCAAGGCCAAAATCGTCCTAGCCAATGACCCAGATGCTGACAGGCTCGCTGTGGCTGAGAAGCAAGACAGTGG  1034

Query 1010  TGAATGGAGGGTGTTTTCAGGCAATGAGTTGGGGGCCCTCCTGGGCTGGTGGCTTTTTACATCTTGGAAAGAGA  1083
            |||.|||||.|||||.||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.||||||||.|
Sbjct 1035  TGAGTGGAGAGTGTTCTCAGGCAATGAGCTGGGGGCCCTGCTGGGATGGTGGCTCTTCACTTCCTGGAAAGAAA  1108

Query 1084  AGAACCAGGATCGCAGTGCTCTCAAAGACACGTACATGTTGTCCAGCACCGTCTCCTCCAAAATCTTGCGGGCC  1157
            |||||||.||||..|||...|||||||||||.||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  AGAACCAAGATCAAAGTAACCTCAAAGACACATACATGCTGTCCAGCACTGTTTCCTCCAAAATCTTGCGGGCC  1182

Query 1158  ATTGCCTTAAAGGAAGGTTTTCATTTTGAGGAAACATTAACTGGCTTTAAGTGGATGGGAAACAGAGCCAAACA  1231
            ||.|||.|.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1183  ATAGCCCTGAAGGAAGGCTTTCATTTCGAGGAAACATTAACCGGCTTCAAGTGGATGGGAAACAGAGCCCAACA  1256

Query 1232  GCTAATAGACCAGGGGAAAACTGTTTTATTTGCATTTGAAGAAGCTATTGGATACATGTGCTGCCCTTTTGTTC  1305
            |||...|||||||||||||||.||..||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1257  GCTCGGAGACCAGGGGAAAACAGTCCTATTTGCATTTGAAGAAGCTATCGGATACATGTGCTGTCCCTTTGTTC  1330

Query 1306  TGGACAAAGATGGAGTCAGTGCCGCTGTCATAAGTGCAGAGTTGGCTAGCTTCCTAGCAACCAAGAATTTGTCT  1379
            |||||||||||||.||||||||.|||||.||..||||||||.||||.|||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1331  TGGACAAAGATGGCGTCAGTGCTGCTGTTATTTGTGCAGAGCTGGCGAGCTTTCTAGCAACGAAGAATTTGTCT  1404

Query 1380  TTGTCTCAGCAACTAAAGGCCATTTATGTGGAGTATGGCTACCATATTACTAAAGCTTCCTATTTTATCTGCCA  1453
            ||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|.||||||.||||||||||||||
Sbjct 1405  TTATCTCAGCAGCTAAATGCCATCTATGTGGAGTACGGCTATCATATTACCACAGCTTCATATTTTATCTGCCA  1478

Query 1454  TGATCAAGAAACCATTAAGAAATTATTTGAAAACCTCAGAAACTACGATGGAAAAAATAATTATCCAAAAGCTT  1527
            ||||||.|..||.|||.|.||.|||||||.||||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||...|
Sbjct 1479  TGATCAGGGCACAATTCAAAACTTATTTGGAAACCTGAGAAACTATGACGGGAAGAATAATTATCCCAAAATGT  1552

Query 1528  GTGGCAAATTTGAAATTTCTGCCATTAGGGACCTTACAACTGGCTATGATGATAGCCAACCTGATAAAAAAGCT  1601
            |||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct 1553  GTGGCAAGTTTGAAATCTCTGCTATCAGGGACCTTACAACTGGCTATGATGATAGCCAGCCTGACAAGAAAGCT  1626

Query 1602  GTTCTTCCCACTAGTAAAAGCAGCCAAATGATCACCTTCACCTTTGCTAATGGAGGCGTGGCCACCATGCGCAC  1675
            ||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1627  GTTCTTCCTACCAGTAAGAGCAGCCAAATGATCACCTTCACCTTTGCTAATGGAGGTGTGGCCACCATGCGGAC  1700

Query 1676  CAGTGGGACAGAGCCCAAAATCAAGTACTATGCAGAGCTGTGTGCCCCACCTGGGAACAGTGATCCTGAGCAGC  1749
            |||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 1701  CAGTGGGACTGAGCCCAAAATCAAGTACTACGCAGAGTTGTGTGCTCCCCCTGGCAACAGTGATCCGGAGCATC  1774

Query 1750  TGAAGAAGGAACTGAATGAACTGGTCAGTGCTATTGAAGAACATTTTTTCCAGCCACAGAAGTACAATCTGCAG  1823
            ||||.|||||||||.||||..|.|||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||
Sbjct 1775  TGAAAAAGGAACTGGATGAGTTAGTCGGTGCCATTGAAGAACATTTTTTCCAGCCACAAAAATATAACCTACAG  1848

Query 1824  CCAAAAGCAGAC  1835
            |||||||||||.
Sbjct 1849  CCAAAAGCAGAA  1860