Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14220
- Subject:
- NM_020123.4
- Aligned Length:
- 1767
- Identities:
- 1370
- Gaps:
- 393
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGGCCGCTGCCTGGCGCTCTTGGCGTGGCGGCGGCCGCCGCGCTGTGGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCCCCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GACCCGGGCGGACGAGCACGAACACACGTATCAAGATAAAGAGGAAGTTGTCTTATGGATGAATACTGTTGGGC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CCTACCATAATCGTCAAGAAACATATAAGTACTTTTCACTTCCATTCTGTGTGGGGTCAAAAAAAAGTATCAGT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CATTACCATGAAACTCTGGGAGAAGCACTTCAAGGGGTTGAATTGGAATTTAGTGGTCTGGATATTAAATTTAA 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 AGATGATGTGATGCCAGCCACTTACTGTGAAATTGATTTAGATAAAGAAAAGAGAGATGCATTTGTATATGCCA 370
Query 1 -----------------------ATGCACATAGATGATTTACCAATATGGGGTATTGTTGGTGAGGCTGATGAA 51
|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TAAAAAATCATTACTGGTACCAGATGTACATAGATGATTTACCAATATGGGGTATTGTTGGTGAGGCTGATGAA 444
Query 52 AATGGAGAAGATTACTATCTTTGGACCTATAAAAAACTTGAAATAGGTTTTAATGGAAATCGAATTGTTGATGT 125
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AATGGAGAAGATTACTATCTTTGGACCTATAAAAAACTTGAAATAGGTTTTAATGGAAATCGAATTGTTGATGT 518
Query 126 TAATCTAACTAGTGAAGGAAAGGTGAAACTGGTTCCAAATACTAAAATCCAGATGTCATATTCAGTAAAATGGA 199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TAATCTAACTAGTGAAGGAAAGGTGAAACTGGTTCCAAATACTAAAATCCAGATGTCATATTCAGTAAAATGGA 592
Query 200 AAAAGTCAGATGTGAAATTTGAAGATCGATTTGACAAATATCTTGATCCGTCCTTTTTTCAACATCGGATTCAT 273
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAAAGTCAGATGTGAAATTTGAAGATCGATTTGACAAATATCTTGATCCGTCCTTTTTTCAACATCGGATTCAT 666
Query 274 TGGTTTTCAATTTTCAACTCCTTCATGATGGTGATCTTCTTGGTGGGCTTAGTTTCAATGATTTTAATGAGAAC 347
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TGGTTTTCAATTTTCAACTCCTTCATGATGGTGATCTTCTTGGTGGGCTTAGTTTCAATGATTTTAATGAGAAC 740
Query 348 ATTAAGAAAAGATTATGCTCGGTACAGTAAAGAGGAAGAAATGGATGATATGGATAGAGACCTAGGAGATGAAT 421
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ATTAAGAAAAGATTATGCTCGGTACAGTAAAGAGGAAGAAATGGATGATATGGATAGAGACCTAGGAGATGAAT 814
Query 422 ATGGATGGAAACAGGTGCATGGAGATGTATTTAGACCATCAAGTCACCCACTGATATTTTCCTCTCTGATTGGT 495
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATGGATGGAAACAGGTGCATGGAGATGTATTTAGACCATCAAGTCACCCACTGATATTTTCCTCTCTGATTGGT 888
Query 496 TCTGGATGTCAGATATTTGCTGTGTCTCTCATCGTTATTATTGTTGCAATGATAGAAGATTTATATACTGAGAG 569
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCTGGATGTCAGATATTTGCTGTGTCTCTCATCGTTATTATTGTTGCAATGATAGAAGATTTATATACTGAGAG 962
Query 570 GGGATCAATGCTCAGTACAGCCATATTTGTCTATGCTGCTACGTCTCCAGTGAATGGTTATTTTGGAGGAAGTC 643
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGGATCAATGCTCAGTACAGCCATATTTGTCTATGCTGCTACGTCTCCAGTGAATGGTTATTTTGGAGGAAGTC 1036
Query 644 TGTATGCTAGACAAGGAGGAAGGAGATGGATAAAGCAGATGTTTATTGGGGCATTCCTTATCCCAGCTATGGTG 717
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGTATGCTAGACAAGGAGGAAGGAGATGGATAAAGCAGATGTTTATTGGGGCATTCCTTATCCCAGCTATGGTG 1110
Query 718 TGTGGCACTGCCTTCTTCATCAATTTCATAGCCATTTATTACCATGCTTCAAGAGCCATTCCTTTTGGAACAAT 791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TGTGGCACTGCCTTCTTCATCAATTTCATAGCCATTTATTACCATGCTTCAAGAGCCATTCCTTTTGGAACAAT 1184
Query 792 GGTGGCCGTTTGTTGCATCTGTTTTTTTGTTATTCTTCCTCTAAATCTTGTTGGTACAATACTTGGCCGAAATC 865
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGTGGCCGTTTGTTGCATCTGTTTTTTTGTTATTCTTCCTCTAAATCTTGTTGGTACAATACTTGGCCGAAATC 1258
Query 866 TGTCAGGTCAGCCCAACTTTCCTTGTCGTGTCAATGCTGTGCCTCGTCCTATACCGGAGAAAAAATGGTTCATG 939
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGTCAGGTCAGCCCAACTTTCCTTGTCGTGTCAATGCTGTGCCTCGTCCTATACCGGAGAAAAAATGGTTCATG 1332
Query 940 GAGCCTGCGGTTATTGTTTGCCTGGGTGGAATTTTACCTTTTGGTTCAATCTTTATTGAAATGTATTTCATCTT 1013
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAGCCTGCGGTTATTGTTTGCCTGGGTGGAATTTTACCTTTTGGTTCAATCTTTATTGAAATGTATTTCATCTT 1406
Query 1014 CACGTCTTTCTGGGCATATAAGATCTATTATGTCTATGGCTTCATGATGCTGGTGCTGGTTATCCTGTGCATTG 1087
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CACGTCTTTCTGGGCATATAAGATCTATTATGTCTATGGCTTCATGATGCTGGTGCTGGTTATCCTGTGCATTG 1480
Query 1088 TGACTGTCTGTGTGACTATTGTGTGCACATATTTTCTACTAAATGCAGAAGATTACAGGTGGCAATGGACAAGT 1161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGACTGTCTGTGTGACTATTGTGTGCACATATTTTCTACTAAATGCAGAAGATTACCGGTGGCAATGGACAAGT 1554
Query 1162 TTTCTCTCTGCTGCATCAACTGCAATCTATGTTTACATGTATTCCTTTTACTACTATTTTTTCAAAACAAAGAT 1235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TTTCTCTCTGCTGCATCAACTGCAATCTATGTTTACATGTATTCCTTTTACTACTATTTTTTCAAAACAAAGAT 1628
Query 1236 GTATGGCTTATTTCAAACATCATTTTACTTTGGATATATGGCGGTATTTAGCACAGCCTTGGGGATAATGTGTG 1309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GTATGGCTTATTTCAAACATCATTTTACTTTGGATATATGGCGGTATTTAGCACAGCCTTGGGGATAATGTGTG 1702
Query 1310 GAGCGATTGGTTACATGGGAACAAGTGCCTTTGTCCGAAAAATCTATAGTCATGTGAAAATTGAC 1374
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||
Sbjct 1703 GAGCGATTGGTTACATGGGAACAAGTGCCTTTGTCCGAAAAATCTATACTAATGTGAAAATTGAC 1767