Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14225
- Subject:
- XM_017001859.1
- Aligned Length:
- 1279
- Identities:
- 806
- Gaps:
- 458
Alignment
Query 1 ATGGTCTTCGTGGGCTTTGGCTTCCTCATGGTCTTCCTGCAGCGTTACGGCTTCAGCAGCGTGGGCTTCACCTT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCTCCTGGCCGCCTTTGCCCTGCAGTGGTCCACACTGGTCCAGGGCTTTCTCCACTCCTTCCACGGTGGCCACA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TCCATGTTGGCGTGGAGAGCATGATCAATGCTGACTTTTGTGCGGGGGCCGTGCTCATCTCCTTTGGTGCCGAC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CTGGGCAAGACCGGGCCTACCCAGCTGCTGCTCATGGCCCTGCTGGAGGTGGTGCTGTTTGGCATCAATGAGTT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TGTGCTCCTTCATCTCCTGGGGGTGAGAGTCTGGGGAGGGATGGAGTCGGGGGTGGGGGGTGGTCAAGGTCAGC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 CTCTGAGCCAGGAGCGTGGGGGTGGGGGCGGGGTGCTGCCTCTCACCCCACCTCCCCAGGTGAGAGATGCCGGA 444
.||..|.|.||.....||.||||.|||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------------------------ATGAATTTTACTTTCGCTACCCAAGTGAGAGATGCCGGA 39
Query 445 GGCTCCATGACTATCCACACCTTTGGTGCCTACTTCGGGCTCGTCCTTTCGCGGGTTCTGTACAGGCCCCAGCT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 40 GGCTCCATGACTATCCACACCTTTGGTGCCTACTTCGGGCTCGTCCTTTCGCGGGTTCTGTACAGGCCCCAGCT 113
Query 519 GGAGAAGAGCAAGCACCGCCAGGGCTCCGTCTACCATTCAGACCTCTTCGCCATGATTGGGACCATCTTCCTGT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 114 GGAGAAGAGCAAGCACCGCCAGGGCTCCGTCTACCATTCAGACCTCTTCGCCATGATTGGGACCATCTTCCTGT 187
Query 593 GGATCTTCTGGCCTAGCTTCAATGCTGCACTCACATCGCTGGGGGCTGGGCAGCATCGGACGGCCCTCAACACA 666
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 188 GGATCTTCTGGCCTAGCTTCAATGCTGCACTCACAGCGCTGGGGGCTGGGCAGCATCGGACGGCCCTCAACACA 261
Query 667 TACTACTCCCTGGCTGCCAGCACCCTTGGCACCTTTGCCTTGTCAGCCCTTGTAGGGGAAGATGGGAGGCTTGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 262 TACTACTCCCTGGCTGCCAGCACCCTTGGCACCTTTGCCTTGTCAGCCCTTGTAGGGGAAGATGGGAGGCTTGA 335
Query 741 CATGGTCCACATCCAAAATGCAGCGCTGGCTGGAGGGGTTGTGGTGGGGACCTCAAGTGAAATGATGCTGACAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 336 CATGGTCCACATCCAAAATGCAGCGCTGGCTGGAGGGGTTGTGGTGGGGACCTCAAGTGAAATGATGCTGACAC 409
Query 815 CCTTTGGGGCTCTGGCAGCTGGCTTCTTGGCTAGGACTGTCTCCACGCTGGGGTACAAGTTCTTCACGCCCATC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 410 CCTTTGGGGCTCTGGCAGCTGGCTTCTTGGCTGGGACTGTCTCCACGCTGGGGTACAAGTTCTTCACGCCCATC 483
Query 889 CTTGAATCAAAATTCAAAGTCCAAGACACATGTGGAGTCCACAACCTCCATGGGATGCCGGGGGTCCTGGGGGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 484 CTTGAATCAAAATTCAAAGTCCAAGACACATGTGGAGTCCACAACCTCCATGGGATGCCGGGGGTCCTGGGGGC 557
Query 963 CCTCCTGGGGGTCCTTGTGGCTGGACTTGCCACCCATGAAGCTTACGGAGATGGCCTGGAGAGTGTGTTTCCAC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 558 CCTCCTGGGGGTCCTTGTGGCTGGACTTGCCACCCATGAAGCTTACGGAGATGGCCTGGAGAGTGTGTTTCCAC 631
Query 1037 TCATAGCCGAGGGCCAGCGCAGTGCCACGTCACAGGCCATGCACCAGCTCTTCGGGCTGTTTGTCACACTGATG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 632 TCATAGCCGAGGGCCAGCGCAGTGCCACGTCACAGGCCATGCACCAGCTCTTCGGGCTGTTTGTCACACTGATG 705
Query 1111 TTTGCCTCTGTGGGCGGGGGCCTTGGAGGGCTCCTGCTGAAGCTACCCTTTCTGGACTCCCCCCCCAGACTCCC 1184
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 706 TTTGCCTCTGTGGGCGGGGGCCTTGGAGGGCTCCTGCTGAAGCTACCCTTTCTGGACT-CCCCCCCAGACTCCC 778
Query 1185 AGCGCTACGAGGACCAAGTTCACTGGCAGGTGCCTGGCGAGCA------------------------------- 1227
|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 AGCACTACGAGGACCAAGTTCACTGGCAGGTGCCTGGCGAGCATGAGGATAAAGCCCAGAGACCTCTGAGGGTG 852
Query 1228 --------------------- 1227
Sbjct 853 GAGGAGGCAGACACTCAGGCC 873