Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14249
- Subject:
- XM_006519507.2
- Aligned Length:
- 1660
- Identities:
- 1243
- Gaps:
- 278
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGGGTGCCGGACTGCGGGCGACAGCTAGGCGCTTGCTGCTGTGCAGAGGCCACAGCGGACCGCGGGCCGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CTCGTCCTCACCCTCCTGCCCTGGCTGCGGCCCGCCGGGTCCCGGAGCCCACTGCCCCAGCACCCCGCGCTCGG 148
Query 1 -----------------------------------------------------ATGCGGAGACTGGTGCACGAC 21
||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 CGCCCGCAGACGGCGCGGACCTCAGCGCGCACTTATGGGCTCGTTACCAGGACATGCGGAGGCTGGTGCACGAC 222
Query 22 CTCCTGCCCCCCGAGGTCTGCAGTCTCCTGAACCCAGCAGCCATCTACGCCAACAACGAGATCAGCCTGCGTGA 95
||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||.||||
Sbjct 223 CTTCTGCCCCCTGAGGTCTGCAGCCTCCTAAACCCAGCAGCTATTTATGCCAACAATGAGATCAGCCTGAGTGA 296
Query 96 CGTTGAGGTCTACGGCTTTGACTACGACTACACCCTGGACCAGTATGCAGACGCACTGCACCCCGAGATCTTCA 169
|||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||.|||||||||.||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 297 CGTCGAAGTCTATGGCTTTGACTACGACTACACGCTGGCCCAGTATGCGGATGCACTGCACCCTGAGATCTTCA 370
Query 170 GTACCGCCCGTGACATCCTGATCGAGCACTAC------------------------------------------ 201
.|.|.|||||.||||||.||||.|||||||||
Sbjct 371 ATGCTGCCCGGGACATCTTGATAGAGCACTACAAGTATCCTGAGGGGATCCGGAAGTATGACTATGACCCCAGC 444
Query 202 ---------------------------------AAGAGCCTTCTGATGAAGATTGACGCCTTCCACTACGTGCA 242
|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct 445 TTTGCCATCCGTGGCCTGCACTACGACATTCAGAAGAGCCTTCTGATGAAAATTGACGCTTTTCACTATGTACA 518
Query 243 GCTGGGGACAGCCTACAGGGGCCTCCAGCCTGTGCCAGACGAGGAGGTGATTGAGCTGTATGGGGGTACCCAGC 316
.|||||.||.|||||||||||||||.||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct 519 ACTGGGAACGGCCTACAGGGGCCTCAAGCCTGTGCCGGACGATGAAGTGATCGACCTGTACGGCGGCACCCAGC 592
Query 317 ACATCCCACTATACCAGATGAGTGGCTTCTATGGCAAGGGTCCCTCCATTAAGCAGTTCATGGACATCTTCTCG 390
||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACATCCCACTCTACCAGATGAGCGGCTTCTATGGCAAGGGCCCATCTATCAAGCAGTTCATGGACATCTTCTCG 666
Query 391 CTACCGGAGATGGCTCTGCTGTCCTGTGTGGTGGACTACTTTCTGGGCCACAGCCTGGAGTTTGACCAAGCACA 464
||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||
Sbjct 667 CTCCCAGAGATGGCTCTGCTGTCCTGTGTGGTGGACTACTTTCTGGGCCACGGCCTGGAGTTTGACCAAGTACA 740
Query 465 TCTCTACAAGGACGTGACGGACGCCATCCGAGACGTGCATGTGAAGGGCCTCATGTACCAGTGGATCGAGCAGG 538
||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 741 TCTCTACAAGGATGTGACGGATGCTATCCGCGATGTGCATGTAAAGGGCCTCATGTACCAGTGGATCGAGCAAG 814
Query 539 ACATGGAGAAGTACATCCTGAGAGGGGATGAGACGTTTGCTGTCCTGAGCCGCCTGGTGGCCCATGGGAAGCAG 612
|||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 815 ACATGGAGAAGTACATCCTGAGAGGAGATGAGACATTTGCGGTGCTGAGCCGCCTGGTGGCCCATGGGAAACAG 888
Query 613 CTGTTCCTCATCACCAACAGTCCTTTCAGCTTCGTAGACAAGGGGATGCGGCACATGGTGGGTCCCGATTGGCG 686
|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 889 CTGTTCCTCATTACCAACAGTCCCTTCAGCTTTGTGGACAAAGGTATGCGGCACATGGTAGGTCCCGATTGGCG 962
Query 687 CCAGCTCTTCGATGTGGTCATTGTCCAGGCAGACAAGCCCAGCTTCTTCACTGACCGGCGCAAGCCTTTCAGAA 760
|||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||.|||.|||||.|||.|||||||||||||..|.|
Sbjct 963 CCAACTCTTCGACGTCGTCATCGTCCAGGCAGACAAGCCCAACTTTTTCACCGACAGGCGCAAGCCTTTTCGCA 1036
Query 761 AACTCGATGAGAAGGGCTCACTTCAGTGGGACCGGATCACCCGCTTGGAAAAGGGCAAGATCTATCGGCAGGGA 834
|.||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||.|.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGCTTGACGAGAAGGGCTCCCTCCACTGGGACCGTATCACTCGCCTAGAGAAGGGCAAGATCTATCGGCAGGGA 1110
Query 835 AACCTGTTTGA-CTTCTTGCGCTTGACGGAATGGCGTGGCCCCCGCGTGCTCTACTTCGGGGACCACCTCTATA 907
||||||||||| .||||| ||..|||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 1111 AACCTGTTTGATTTTCTT-CGTCTGACGGAATGGCGAGGGCCGCGTGTGCTCTACTTCGGTGACCACCTTTACA 1183
Query 908 GTGATCTGGCGGATCTCATGCTGCGGCACGGCTGGCGCACAGGCGCCATCATCCCCGAGCTGGAGCGTGAGATC 981
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1184 GTGACCTGGCGGATCTCATGCTGCGGCACGGCTGGCGCACGGGAGCCATCATCCCTGAGCTGGAGCGCGAGATC 1257
Query 982 CGCATCATCAACACGGAGCAGTACATGCACTCGCTGACGTGGCAACAGGCGCTCACGGGGCTGCTGGAGCGCAT 1055
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1258 CGCATCATCAACACGGAGCAGTACATGCACTCGCTGACCTGGCAGCAGGCTCTCACTGGGCTGCTGGAGCGCAT 1331
Query 1056 GCAGACCTATCAGGACGCGGAGTCGAGGCAGGTGCTGGCTGCCTGGATGAAAGAGCGGCAGGAGCTGAGGTGCA 1129
|||||||||||||||.||.|||||..||||||||||||||.||||||||||.||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 1332 GCAGACCTATCAGGATGCAGAGTCACGGCAGGTGCTGGCTACCTGGATGAAGGAGCGGCAAGAACTGAGATGCA 1405
Query 1130 TCACCAAGGCCCTGTTCAATGCGCAGTTCGGCAGCATCTTCCGCACCTTCCACAACCCCACCTACTTCTCAAGG 1203
||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||
Sbjct 1406 TCACAAAGGCCCTATTCAACGCCCAGTTCGGGAGCATCTTCCGCACCTTCCACAACCCTACCTACTTCTCCCGG 1479
Query 1204 CGCCTCGTGCGCTTCTCTGACCTCTACATGGCCTCCCTCAGCTGCCTGCTCAACTACCGCGTGGACTTCACCTT 1277
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1480 CGCCTCGTGCGCTTCTCCGACCTCTACATGGCCTCACTCAGCTGCCTGCTCAACTACCGCGTAGACTTCACCTT 1553
Query 1278 CTACCCACGCCGTACGCCGCTGCAGCACGAGGCACCCCTCTGGATGGACCAGCTCTGCACCGGCTGCATGAAGA 1351
||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1554 CTACCCGCGCCGCACACCCCTGCAGCACGAGGCACCCCTCTGGATGGACCAGCTGTGCACTGGCTGCATGAAGA 1627
Query 1352 CCCCCTTCCTTGGTGACATGGCCCACATCCGC 1383
|.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628 CACCCTTTCTTGGTGACATGGCCCACATCCGC 1659