Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14265
• Subject: NM_001349795.1
• Aligned Length: 1008
• Identities: 754
• Gaps: 252

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCAGAAGAAAATAAAAATCCCCAAGCTTTCTCTTAATCATGTAGAAGAAGATGGAGAGGTTAAAGATTATGG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGAAGAAGATTTACAGCTTAGACACATCAAGAGACCTGAGGGGCGGAAGCCGAGCGAAGTGGCGCACAAGAGCA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TCGAGGCAGTGGTGGCTCGGCTAGAGAAGCAGAACGGCCTGAGCCTGGGCCATAGCACGTGTCCGGAAGAGGTC  222

Query    1  ------------------------------ATGGAAAGTCTAGAAGATGCTGTGGTGCCCCGGGCTCTGTATGA  44
                                          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCGTGGAGGCCTCGCCAGGCACAGAGGACATGGACAGTCTAGAAGATGCTGTGGTGCCCCGGGCTCTGTATGA  296

Query   45  GGAGCTGCTGCGCAACTACCAGCAGCAACAGGAAGAGATGCGCCACCTCCAGCAGGAGCTGGAGCGGACTCGGA  118
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAGCTGCTGCGCAACTACCAGCAGCAACAGGAAGAGATGCGCCACCTCCAGCAGGAGCTGGAGCGGACTCGGA  370

Query  119  GGCAGCTGGTACAACAGGCCAAGAAGCTCAAGGAGTACGGGGCACTTGTGTCTGAAATGAAGGAGCTCCGTGAC  192
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGCAGCTGGTACAACAGGCCAAGAAGCTCAAGGAGTACGGGGCACTTGTGTCTGAAATGAAGGAGCTCCGTGAC  444

Query  193  CTTAACCGGAGGCTCCAGGACGTGCTGCTCCTGAGGCTTGGCAGCGGTCCCGCCATTGATCTGGAAAAAGTAAA  266
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTTAACCGGAGGCTCCAGGACGTGCTGCTCCTGCGGCTTGGCAGCGGTCCCGCCATTGATCTGGAAAAAGTAAA  518

Query  267  GTCAGAATGTCTCGAGCCCGAGCCGGAGTTACGGAGCACTTTCAGTGAGGAAGCAAATACGTCGTCCTATTACC  340
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTCAGAATGTCTCGAGCCCGAGCCGGAGTTACGGAGCACTTTCAGTGAGGAAGCAAATACGTCGTCCTATTACC  592

Query  341  CCGCTCCTGCGCCTGTCATGGACAAGTATATCCTAGACAATGGCAAGGTCCATCTGGGAAGCGGGATTTGGGTT  414
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCGCTCCTGCGCCTGTCATGGACAAGTATATCCTAGACAATGGCAAGGTCCATCTGGGAAGCGGGATTTGGGTT  666

Query  415  GATGAGGAGAAATGGCACCAGCTACAAGTAACCCAAGGAGATTCCAAGTACACGAAGAACTTGGCAGTTATGAT  488
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATGAGGAGAAATGGCACCAGCTACAAGTAACCCAAGGAGATTCCAAGTACACGAAGAACTTGGCAGTTATGAT  740

Query  489  TTGGGGAACAGATGTTCTGAAAAACAGAAGCGTCACAGGCGTCGCCACAAAAAAAAAGAAAGATGCAGTCCCTA  562
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTGGGGAACAGATGTTCTGAAAAACAGAAGCGTCACAGGCGTCGCCACAAAAAAAAAGAAAGATGCAGTCCCTA  814

Query  563  AACCACCCCTCTCGCCTCACAAACTAAGCATCGTCAGAGAGTGTTTGTATGACAGAATAGCACAAGAAACTGTG  636
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AACCACCCCTCTCGCCTCACAAACTAAGCATCGTCAGAGAGTGTTTGTATGACAGAATAGCACAAGAAACTGTG  888

Query  637  GATGAAACTGAAATTGCACAGAGACTCTCCAAAGTCAACAAGTACATCTGTGAAAAAATCATGGATATCAATAA  710
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GATGAAACTGAAATTGCACAGAGACTCTCCAAAGTCAACAAGTACATCTGTGAAAAAATCATGGATATCAATAA  962

Query  711  ATCCTGTAAAAATGAAGAACGAAGGGAAGCAAAATACAATTTGCAA  756
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATCCTGTAAAAATGAAGAACGAAGGGAAGCAAAATACAATTTGCAA  1008